| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,548,618 | A→G | K12E (AAA→GAA) | unknown → | Exopolyphosphatase (EC 3.6.1.11) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,548,618 | 0 | A | G | 100.0% | 144.6 / NA | 53 | K12E (AAA→GAA) | unknown | Exopolyphosphatase (EC 3.6.1.11) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (30/23); total (30/23) | |||||||||||
AACCTGAGTACCGCCGGGGTGGGCGACAGATCTAAAGTAGTGGTCAGCGGCACCATTACACCGCGCTTACAGGTAAAATACGGCGTTGGGTTATTTGACGGTTTAGCCGAAGTGACTCTGCGTTACCGATTATTGCCACAACTGTATGTTCAATCCGTTTCGGGTGTTAATCAAGCCTTTGATCTACTCTATCAATTTGAATTTTAATTATGAATAACGAAAATTTACTAAAGAAAGCTAACAAACTCTACGCCCGACGTGGCGAGGTGCGTGAAATCGCCGCGATCGACTTAGGTTCCAACAGCTTTCACATGATCATCGCCCGCATCGTCAACGGCACGTTACAGGTATTATCGCGGTTGAAGCAGAAAGTCCAGCTTGCGGAAGGCTTGGATGAAAACCAAGTGTTAAGCCAGGCAGCAATTGAACGCGGGGTAAATTGTCTGGCGTTATTTGCCGAACGCTTGCAGGGATTTTC > 1/1548376‑1548853 | aaCCTGAGTACCGCCGGGGTGGGCGACAGATCTAAAGTAGTGGTCAGCGGCACCATTACACCGCGCTTACAGGTAAAATACGGCGTTGGGTTATTTGACGGTTTAGCCGAAGTGACTCTGCGTTACCGATTATTGCCACAACTGTATGTTCAATCCGTTTCGGGTGTTAATCAAGCCTTTGATCTACTCTATCAATTTGAATTTTAATTATGAATAACGAAAATTTACTAAAGAAAGCTAACGAACTCTAc < 1:693572/251‑1 (MQ=255) cTGAGTACCGCCGGGGTGGGCGACAGATCTAAAGTAGTGGTCAGCGGCACCATTACACCGCGCTTACAGGTAAAATACGGCGTTGGGTTATTTGACGGTTTAGCCGAAGTGACTCTGCGTTACCGATTATTGCCACAACTGTATGTTCAATCCGTTTCGGGTGTTAATCAAGCCTTTGATCTACTCTATCAATTTGAATTTTAATTATGAATAACGAAAATTTACTAAAGAAAGCTAACGAACTCTACGcc < 1:791506/251‑1 (MQ=255) ggTGGGCGACAGATCTAAAGTAGTGGTCAGCGGCACCATTACACCGCGCTTACAGGTAAAATACGGCGTTGGGTTATTTGACGGTTTAGCCGAAGTGACTCTGCGTTACCGATTATTGCCACAACTGTATGTTCAATCCGTTTCGGGTGTTAATCAAGCCTTTGATCTACTCTATCAATTTGAATTTTAATTATGAATAACGAAAATTTACTAAAGAAAGCTAACGAACTCTACGCCCGACGTGGCGAgg < 1:191791/250‑1 (MQ=255) gATCTAAAGTAGTGGTCAGCGGCACCATTACACCGCGCTTACAGGTAAAATACGGCGTTGGGTTATTTGACGGTTTAGCCGAAGTGACTCTGCGTTACCGATTATTGCCACAACTGTATGTTCAATCCGTTTCGGGTGTTAATCAAGCCTTTGATCTACTCTATCAATTTGAATTTTAATTATGAATAACGAAAATTTACTAAAGAAAGCTAACGAACTCTACGCCCGACGTGGCGa < 1:706841/237‑1 (MQ=255) 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tCTAAAGTAGTGGTCAGCGGCACCATTACACCGCGCTTACAGGTAAAATACGGCGTTAGGTTATTTGACGGTTTAGCCGAAGTGACTCTGCGTTACCGATTATTGCCACAACTGTATGTTCAATCCGTTTCGGGTGTTAATCAAGCCTTTGATCTACTCTATCAATTTGAATTTTAATTATGAATAACGAAAATTTACTAAAGAAAGCTAACGAACTCTACGCCCGACGTGGCGAGGTGCGTGAAATcgc > 1:482997/1‑250 (MQ=255) gTCAGCGGCACCATTACACCGCGCTTACAGGTAAAATACGGCGTTGGGTTATTTGACGGTTTAGCCGAAGTGACTCTGCGTTACCGATTATTGCCACAACTGTATGTTCAATCCGTTTCGGGTGTTAATCAAGCCTTTGATCTACTCTATCAATTTGAATTTTAATTATGAATAACGAAAATTTACTAAAGAAAGCTAACGAACTCTACGCCCGACGTGGCGAGGTGCGTGAAATCGCCGCGATCGACtt < 1:279680/250‑1 (MQ=255) gCGGCACCATTACACCGCGCTTACAGGTAAAATACGGCGTTGGGTTATTTGACGGTTTAGCCGAAGTGACTCTGCGTTACCGATTATTGCCACAACTGTATGTTCAATCCGTTTCGGGTGTTAATCAAGCCTTTGATCTACTCTATCAATTTGAATTTTAATTATGAATAACGAAAATTTACTAAAGAAAGCTAACGAACTCTACGCCCGACGTGGCGAGGTGCGTGAAATCGCCGCGATCGACTTAGGtt > 1:715968/1‑251 (MQ=255) ccATTACACCGCGCTTACAGGTAAAATACGGCGTTGGGTTATTTGACGGTTTAGCCGAAGTGACTCTGCGTTACCGATTATTGCCACAACTGTATGTTCAATCCGTTTCGGGTGTTAATCAAGCCTTTGATCTACTCTATCAATTTGAATTTTAATTATGAATAACGAAAATTTACTAAAGAAAGCTAACGAACTCTACGCCCGACGTGGCGAGGTGCGTGaa < 1:431358/223‑1 (MQ=255) ccATTACACCGCGCTTACAGGTAAAATACGGCGTTGGGTTATTTGACGGTTTAGCCGAAGTGACTCTGCGTTACCGATTATTGCCACAACTGTATGTTCAATCCGTTTCGGGTGTTAATCAAGCCTTTGATCTACTCTATCAATTTGAATTTTAATTATGAATAACGAAAATTTACTAAAGAAAGCTAACGAACTCTACGCCCGACGTGGCGAGGTGCGTGAAAt < 1:161022/225‑1 (MQ=255) ccATTACACCGCGCTTACAGGTAAAATACGGCGTTGGGTTATTTGACGGTTTAGCCGAAGTGACTCTGCGTTACCGATTATTGCCACAACTGTATGTTCAATCCGTTTCGGGTGTTAATCAAGCCTTTGATCTACTCTATCAATTTGAATTTTAATTATGAATAACGAAAATTTACTAAAGAAAGCTAACGAACTCTACGCCCGACGTGGCGAGGTGCGTGAAATCGCCGCGATCGACTTAg > 1:603162/1‑242 (MQ=255) 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> 1:371580/1‑167 (MQ=255) gTTTAGCCGAAGTGACTCTGCGTTACCGATTATTGCCACAACTGTATGTTCAATCCGTTTCGGGTGTTAATCAAGCCTTTGATCTACTCTATCAATTTGAATTTTAATTATGAATAACGAAAATTTACTAAAGAAAGCTAACGAACTCTACGCCCGACGTGGCGAGGTGCGTGAAATCGCCGCGATCGACTTAGGTTCCAACAGCTTTCACATGATCATCGCCCGCATCGTCAACGGCACGTTACAGGtat > 1:892259/1‑251 (MQ=255) gCCGAAGTGACTCTGCGTTACCGATTATTGCCACAACTGTATGTTCAATCCGTTTCGGGTGTTAATCAAGCCTTTGATCTACTCTATCAATTTGAATTTTAATTATGAATAACGAAAATTTACTAAAGAAAGCTAACGAACTCTACGCCCGACGTGGCGAGGTGCGTGAAATCGCCGCGATCGACTTAGGTTCCAACAGCTTTCACATGATCATCGCCCGCATCGTCAACGGCACGTTACAGGTATTATcg > 1:673787/1‑251 (MQ=255) gTGACTCTGCGTTACCGATTATTGCCACAACTGTATGTTCAATCCGTTTCGGGTGTTAATCAAGCCTTTGATCTACTCTATCAATTTGAATTTTAATTATGAATAACGAAAATTTACTAAAGAAAGCTAACGAACTCTACGCCCGACGTGGCGAGGTGCGTGAAATCGCCGCGATCGACTTAGGTTCCAACAg > 1:848254/1‑193 (MQ=255) 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cTAAAGAAAGCTAACGAACTCTACGCCCGACGTGGCGAGGTGCGTGAAATCGCCGCGATCGACTTAGGTTCCAACAGCTTTCACATGATCATCGCCCGCATCGTCAACGGCACGTTACAGGTATTATCGCGGTTGAAGCAGAAAGTCCAGCTTGCGGAAGGCTTGGATGAAAACCAAGTGTTAAGCCAGGCAGCAATTGAACGCGGGGTAAATTGTCTGGCGTTATTTGCCGAACGCTTGCAGGGATTTTc < 1:22966/251‑1 (MQ=255) aaagaaagCTAACGAACTCTACGCCCGACGTGGCGAGGTGCGTGAAATCGCCGCGATCGACTTAGGTTCCAACAGCTTTCACATGATCATCGCCCGCATCGTCAACGGCACGTTACAGGTATTATCGCGGTTGAAGCAGAAAGTCCAGCTTGCGGAAGGCTTGGATGAAAACCAAGTGTTAAGCCAGGCAGCAATTGAACGCGGGGTAAATTg < 1:234388/213‑1 (MQ=255) aaagaaagCTAACGAACTCTACGCCCGACGTGGCGAGGTGCGTGAAATCGCCGCGATCGACTTAGGTTCCAACAGCTTTCACATGATCATCGCCCGCATCGTCAACGGCACGTTACAGGTATTATCGCGGTTGAAGCAGAAAGTCCAGCTTGCGGAAGGCTTGGATGAAAACCAAGTGTTAAGCCAGGCAGCAATTGAACGCGGGGTAAATTGt > 1:850695/1‑214 (MQ=255) | AACCTGAGTACCGCCGGGGTGGGCGACAGATCTAAAGTAGTGGTCAGCGGCACCATTACACCGCGCTTACAGGTAAAATACGGCGTTGGGTTATTTGACGGTTTAGCCGAAGTGACTCTGCGTTACCGATTATTGCCACAACTGTATGTTCAATCCGTTTCGGGTGTTAATCAAGCCTTTGATCTACTCTATCAATTTGAATTTTAATTATGAATAACGAAAATTTACTAAAGAAAGCTAACAAACTCTACGCCCGACGTGGCGAGGTGCGTGAAATCGCCGCGATCGACTTAGGTTCCAACAGCTTTCACATGATCATCGCCCGCATCGTCAACGGCACGTTACAGGTATTATCGCGGTTGAAGCAGAAAGTCCAGCTTGCGGAAGGCTTGGATGAAAACCAAGTGTTAAGCCAGGCAGCAATTGAACGCGGGGTAAATTGTCTGGCGTTATTTGCCGAACGCTTGCAGGGATTTTC > 1/1548376‑1548853 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |