| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,545,969 | G→A | A422A (GCG→GCA) | unknown → | Inner membrane component of TAM transport system |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,545,969 | 0 | G | A | 100.0% | 216.4 / NA | 80 | A422A (GCG→GCA) | unknown | Inner membrane component of TAM transport system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (44/36); total (44/36) | |||||||||||
ATCTAACGCTTTCAGGATCGCTGAAAAAACAGACCGCACTTTCCCTGCAAACCCAGGGTGCCTT‑AGAAACGACACTGGAAGCGCAGGCACAACCTGCTGCGCCGAAATTGCCATTAACGCTACATTTCACCGCCGATAAGGCACAATACCCGTTTAACAATAAAGATCCGCTGCAAATTAACGATCTGGTGTTGGATATTGAAGGAGATTTACTGACGGCACAAGTGAACTTAAAAAGTGCGGTCAGTGGCATGGGAATTCCAACCAACACTCTTAAATTACAGGCAGTTAGCCATTTATCCAATGTGGAAATTCAGCGTCTCTTGCTTAACGCGTTAAGTGGTTCGGCAGAATTACAAGGCAATTTGAACTGGCGTGACGGCATTGCCTGGGACAGCCATTTGCAGTTGGCAAAAATCAATGTGGGCAAATACTTATCCGTCTTCCCGGCCCAGTTATCAGGCAAATTAAGCTCACAAGGCAAAGC > 1/1545728‑1546214 | aTCTACCGCTTCCAGGATCGCTAAAAAAACAGCCCGCACTTCCCCGGCAACCCCGGGGTGCTTA‑AAAAACGACACGGGAAGCGCAGGCACAACCTGCTGCGCAAAAATTGCCATAAACGCTACATTTCACCGCCGATAAGGCACAATACCCGTTTAACAATAAAGATCCGCTGCAAATTAACGATCTGGTGTTGGATATTGAAGGAGATTTACTGACGGCACAAGTGAACTTAAAAAGTGCAGTCAGTgg < 1:210192/250‑1 (MQ=255)aTCTAACGCTTTCAGGATCGCTGAAAAAACAGACCGCACTTTCCCTGCAAACCCAGGGTGCCTT‑AGAAACGACACTGGAAGCGCAGGCACAACCTGCTGCGCCGAAATTGCCATTAACGCTACATTTCACCGCCGATAAGGCACAATACCCGTTTAACAATAAAGATCCGCTGCAAATTAACGATCTGGTGTTGGATATTGAAGGAGATTTACTGACGGCACAAGTGAACTTAAAAAGTGCAGTCAGTgg > 1:474410/1‑250 (MQ=255) gCTTTCAGGATCGCTGAAAAAACAGACCGCACTTTCCCTGCAAACCCAGGGTGCCTT‑AGAAACGACACTGGAAGCGCAGGCACAACCTGCTGCGCCGAAATTGCCATTAACGCTACATTTCACCGCCGATAAGGCACAATACCCGTTTAACAATAAAGATCCGCTGCAAATTAACGATCTGGTGTTGGATATTGAAGGAGATTTACTGACGGCACAAGTGAACTTAAAAAGTGCAGTCAGTGGCATGGGaa > 1:725119/1‑251 (MQ=255) gCTTTCAGGATCGCTGAAAAAACAGACCGCACTTTCCCTGCAAACCCAGGGTGCCTT‑AGAAACGACACTGGAAGCGCAGGCACAACCTGCTGCGCCGAAATTGCCATTAACGCTACATTTCACCGCCGATAAGGCACAATACCCGTTTAACAATAAAGATCCGCTGCAAATTAACGATCTGGTGTTGGATATTGAAGGAGATTTACTGACGGCACAAGTGAACTTAAAAAGTGCAGTCAGTGGCATGGGaa > 1:789766/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |