| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,537,706 | G→T | N11K (AAC→AAA) | unknown ← | Uncharacterized protein EC‑HemX |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,537,706 | 0 | G | T | 98.9% | 253.2 / ‑3.5 | 90 | coding (33/1386 nt) | unknown | Uncharacterized protein EC‑HemX |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base T (45/44); minor base . (1/0); total (46/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.49e-01 | |||||||||||
CCCAACGCAATTAAAAGTGCCAGCAAACCTAACGCGGAACCGGTTTTCTTCACCACAACGGTTTCATGCACGATCGGTTTTTGCTCTGACGGCGTGATTTTTTCTTCATTTTGTTGCATCGTTTCTGTCTTATCCTCTGCATTTGTTTCAACGTGTTCATTAGGCGTGGTATCTTGTGTCGCTAAATCAAGATCATCGCTGACAT‑CAATTTTATGTTCAATTTCCGCATTGTTTTTCGGATGATTGGATTTCTTGTTAGCCATATTCGTTACCTATAAAAAAGAAAGTGTTGTTTAACGACATTGTAATAAGGTTTGTAATAAAGTTTGATTGTCCGCACGCGGAGAAATCACCACATTTTGCCAGCCTAACGCTTCCGCCAAATGGGCGATTCGTTCGCTTACTGTAATAAGTTGACAACTTTTTAACCAATTATGTTCATTTTGCGGCACAAAATCCACTAA > 1/1537476‑1537939 | cccAACGCAATTAAAAGTGCCAGCAAACCTAACGCGGAACCGGTTTTCTTCACCACAACGGTTTCATGCACGATCGGTTTTTGCTCTGACGGCGTGATTTTTTCTTCATTTTGTTGCATCGTTTCTGTCTTATCCTCTGCATTTGTTTCAACGTGTTCATTAGGCGTGGTATCTTGTGTCGCTAAATCAAGATCATCGCTGACAT‑CAATTTTATGTTCAATTTCCGCATTTTTTTTCGGATGATTGGAttt < 1:667598/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |