| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 294,526 | C→A | R318M (AGG→ATG) | unknown ← | LSU rRNA pseudouridine(955/2504/2580) synthase (EC 5.4.99.24) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 294,526 | 0 | C | A | 100.0% | 257.5 / NA | 95 | R318M (AGG→ATG) | unknown | LSU rRNA pseudouridine(955/2504/2580) synthase (EC 5.4.99.24) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (48/47); total (48/47) | |||||||||||
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cTATGTTCAAAAAACATTGTTTTTTGTGACCGCACTTTTTTACTTCATCTCACGCAAACGCTTCAGAATGCCTTTCATTTTTTCCTCTAATGGCGCGGTTAAACGTAACGTTTCGCCACTGTGCGGATGTTCAAAACGAATGGTGTAGGCGTGTAAAAATAAGCGATTTAATCCTAATTCCACCATGTGTTGATCAAATTCTTTATCACCGTATTTGCTATCGAATGCGATAGGGTGACCGGCATATTggg < 1:828547/251‑1 (MQ=255) gTTCAAAAAACATTGTTTTTTGTGACCGCACTTTTTTACTTCATCTCACGCAAACGCTTCAGAATGCCTTTCATTTTTTCCTCTAATGGCGCGGTTAaacgta > 1:350076/1‑103 (MQ=255) cAAAAAACATTGTTTTTTGTGACCGCACTTTTTTACTTCATCTCACGCAAACGCTTCAGAATGCCTTTCATTTTTTCCTCTAATGGCGCGGTTAAACGTAACGTTTCGCCACTGTGCGGATGTTCAAAACGAATGGTGTAGGCGTGTAAAAATAAGCGATTTAATCCTAATTCCACCATGTGTTGATCAAATTCTTTATcgc < 1:680860/202‑3 (MQ=255) aaaaaaCATTGTTTTTTGTGACCGCACTTTTTTACTTCATCTCACGCAAACGCTTCAGAATGCCTTTCATTTTTTCCTCTAATGGCGCGGTTAAACGTAACGTTTCGCCACTGTGCGGATGTTCAAAACGAATGGTGTAGGCGTGTAAAAATAAGCGATTTAATCCTAATTCCACCATGTGTTGATCAAATTCTTTATCACCGTATTTGCTATCGAATGCGATAGGGTGACCGGCATATTGGGTATGCAcc < 1:234906/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |