| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,515,318 | C→T | intergenic (+83/‑14) | unknown → / → unknown | ATP‑dependent DNA helicase RecQ/DNA gyrase subunit B (EC 5.99.1.3) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,515,318 | 0 | C | T | 100.0% | 240.3 / NA | 88 | intergenic (+83/‑14) | unknown/unknown | ATP‑dependent DNA helicase RecQ/DNA gyrase subunit B (EC 5.99.1.3) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (37/51); total (37/51) | |||||||||||
TTGTGTTTAACGACGCAACGCTACAAGAAATGGCGCAATATCAACCTGTCAGTAACATTGAAATGCTGCAAATCAACGGCGTTGGCGCCATTAAACTGGAGCGTTTCGGGCAGGCATTTCTCACCTTGATCCGCGAACATAAAAGTGCCCGCGCCGGCGAATAATCCCCGCCACCGCTTCGGCGCACTTA‑TTTTTAGCTAATTGCACAAAATTTTGCTATAATCCCGCCCGATTTTTTACGAATTACACAGAGAAGAATTATGTCAACAAATACTCCTGAAACTTATGGTGCAAACAGTATTAAAGTGCTGAAAGGGCTTGATGCGGTGCGTAAACGTCCCGGAATGTATATCGGTGACACAGACGATGGAACGGGTTTACACCATATGGTTTTTGAAGTGGTGGATAACGCCATTGACGAAGCCTTGGCAGGGTATTGCGACGACATCGTAGTCACTATTCATTCCGACAATTCCGTTTCCGTACAAGACGA > 1/1515072‑1515564 | ttGTGTTTAACGACGCAACGCTACAAGAAATGGCGCAATATCAACCTGTCAGTAACATTGAAATGCTGCAAATCAACGGCGTTGGCGCCATTAAACTGGAGCGTTTCGGGCAGGCATTTCTCACCTTGATCCGCGAACATAAAAGTGCCCGCGCCGGCGAATAATCCCCGCCACCGCTTCGGCGCACTTA‑TTTTTAGCTAATTGCACAAAATTTTGCTATAATCCCGCCCGATTTTTTACGAATTATACag < 1:878873/251‑1 (MQ=255)ttGTGTTTAACGACGCAACGCTACAAGAAATGGCGCAATATCAACCTGTCAGTAACATTGAAATGCTGCAAATCAACGGCGTTGGCGCCATTAAACTGGAGCGTTTCGGGCAGGCATTTCTCACCTTGATCCGCGAACATAAAAGTGCCCGCGCCGGCGAATAATCCCCGCCACCGCTTCGGCGCACTTA‑TTTTTAGCTAATTGCACAAAATTTTGCTATAATCCCGCCCGATTTTTTACGAATTATACag < 1:153985/251‑1 (MQ=255) gtgtTTAACGACGCAACGCTACAAGAAATGGCGCAATATCAACCTGTCAGTAACATTGAAATGCTGCAAATCAACGGCGTTGGCGCCATTAAACTGGAGCGTTTCGGGCAGGCATTTCTCACCTTGATCCGCGAACATAAAAGTGCCCGCGCCGGCGAATAATCCCCGCCACCGCTTCGGCGCACTTA‑TTTTTAGCTAATTGCACAAAATTTTGCTATAATCCCGCCCGATTTTTTACGAATTATACagag > 1:882770/1‑251 (MQ=255) gtgtTTAACGACGCAACGCTACAAGAAATGGCGCAATATCAACCTGTCAGTAACATTGAAATGCTGCAAATCAACGGCGTTGGCGCCATTAAACTGGAGCGTTTCGGGCAGGCATTTCTCACCTTGATCCGCGAACATAAAAGTGCCCGCGCCGGCGAATAATCCCCGCCACCGCTTCGGCGCACTTA‑TTTTTAGCTAATTGCACAAAATTTTGCTATAATCCCGCCCGATTTTTTACGAATTATACaga < 1:606973/250‑1 (MQ=255) 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tAAAAGTGCCCGCGCCGGCGAATAATCCCCGCCACCGCTTCGGCGCACTTA‑TTTTTAGCTAATTGCACAAAATTTTGCTATAATCCCGCCCGATTTTTTACGAATTATACAGAGAAGAATTATGTCAACAAATACTCCTGAAACTTATGGTGCAAACAGTAt < 1:400798/162‑1 (MQ=255) ccGCGCCGGCGAATAATCCCCGCCACCGCTTCGGCGCACTTA‑TTTTTAGCTAATTGCACAAAATTTTGCTATAATCCCGCCCGATTTTTTACGAATTATACAGAGAAGAATTATGTCAACAAATACTCCTGAAACTTATGGTGCAAACAGTATTAAAGTGCTGAAAGGGCTTGATGCGGTGCGTAAACGTCCCGGAATGTATATCGGTGACACAGACGATGGAACGGGTTTACACCATATGGTTTTTGAAg < 1:50613/251‑1 (MQ=255) ccGGCGAATAATCCCCGCCACCGCTTCGGCGCACTTA‑TTTTTAGCTAATTGCACAAAATTTTGCTATAATCCCGCCCGATTTTTTACGAATTATACAGAGAAGAATTATGTCAACAAATACTCCTGAAACTTATGGTGCAAACAGTATTAAAGTGCTGAAAGGGCTTGATGCGGTGCGTAAACGTCCCGGAATGTATATCGGTGACACAGACGATGGAACGGGTTTACACCATATGGTTTTTGAAgtggtg < 1:866684/251‑1 (MQ=255) atCCCCGCCACCGCTTCGGCGCACTTA‑TTTTTAGCTAATTGCACAAAATTTTGCTATAATCCCGCCCGATTTTTTACGAATTATACAGAGAAGAATTATGTCAACAAATACTCCTGAAACTTATGGTGCAAACAg > 1:145584/1‑135 (MQ=255) 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(MQ=255) cacaAAATTTTGCTATAATCCCGCCCGATTTTTTACGAATTATACAGAGAAGAATTATGTCAACAAATACTCCTGAAACTTATGGTGCAAACAGTATTAAAGTGCTGAAAGGGCTTGATGCGGTGCGTAAACGTCCCGGAATGTATATCGGTGACACAGACGATGGAACGGGTTTACACCATATGGTTTTTGAAGTGGTGGATAACGCCATTGACGAAGCCTTGGCAGGGTATTGCGACGACATCGTAGTc < 1:429446/251‑1 (MQ=255) ttttGCTATAATCCCGCCCGATTTTTTACGAATTATACAGAGAAGAATTATGTCAACAAATACTCCTGAAACTTATGGTGCAAACAGTATTAAAGTGCTGAAAGGGCTTGATGCGGTGCGTAAACGTCCCGGAATGTATATCGGTGACACAGACGATGGAACGGGTTTACACCATATGGTTTTTGAAGTGGTGGATAACGCCATTGACGAAGCCTTGGCAGGGTATTGCGACGACATCGTAGTCACTattc < 1:886965/251‑1 (MQ=255) cTATAATCCCGCCCGATTTTTTACGAATTATACAGAGAAGAATTATGTCAACAAATACTCCTGAAACTTATGGTGCAAACAGTATTAAAGTGCTGAAAGGGCTTGATGCGGTGCGTAAACGTCCCGGAATGTATATCGGTGACACAGACGATGGAACGGGTTTacac > 1:129090/1‑167 (MQ=255) cTATAATCCCGCCCGATTTTTTACGAATTATACAGAGAAGAATTATGTCAACAAATACTCCTGAAACTTATGGTGCAAACAGTATTAAAGTGCTGAAAGGGCTTGATGCGGTGCGTAAACGTCCCGGAATGTATATCGGTGACACAGACGATGGAACGGGTTTacac > 1:112872/1‑167 (MQ=255) cTATAATCCCGCCCGATTTTTTACGAATTATACAGAGAAGAATTATGTCAACAAATACTCCTGAAACTTATGGTGCAAACAGTATTAAAGTGCTGAAAGGGCTTGATGCGGTGCGTAAACGTCCCGGAATGTATATCGGTGACACAGACGATGGAACGGGTTTACACCATATGGTTTTTGAAGTGGTGGATAACGCCATTGACGAAGCCTTGGCAGGGTATTGCGACGACATCGTAGTCACTattcattc > 1:413525/1‑250 (MQ=255) cTATAATCCCGCCCGATTTTTTACGAATTATACAGAGAAGAATTATGTCAACAAATACTCCTGAAACTTATGGTGCAAACAGTATTAAAGTGCTGAAAGGGCTTGATGCGGTGCGTAAACGTCCCGGAATGTATATCGGTGACACAGACGATGGAACGGGTTTACACCATATGGTTTTTGAAGTGGTGGATAACGCCATTGACGAAGCCTTGGCAGGGTATTGCGACGACATCGTAGTCACTattcattc > 1:643233/1‑250 (MQ=255) taATCCCGCCCGATTTTTTACGAATTATACAGAGAAGAATTATGTCAACAAATACTCCTGAAACTTATGGTGCAAACAGTATTAAAGTGCTGAAAGGGCTTGATGCGGTGCGTAAACGTCCCGGAATGTATATCGGTGACACAGACGATGGAACGGGTTTACACCATATGGTTTTTGAAGTGGTGGATAACGCCATTGACGAAGCCTTGGCAGGGTATTGCGACGACATCGTAGTCACTATTCATTCCGAc < 1:315019/251‑1 (MQ=255) cGAATTATACAGAGAAGAATTATGTCAACAAATACTCCTGAAACTTATGGTGCAAACAGTATTAAAGTGCTGAAAGGGCTTGATGCGGTGCGTAAACGTCCCGGAATGTATATCGGTGACACAGACGATGGAACGGGTTTACACCATATGGTTTTTGAAGTGGTGGATAACGCCATTGACGAAGCCTTGGCAGGGTATTGCGACGACATCGTAGTCACTATTCATTCCGACAATTCCGTTTCCGTGCAAGa < 1:64501/251‑1 (MQ=255) aTTATACAGAGAAGAATTATGTCAACAAATACTCCTGAAACTTATGGTGCAAACAGTATTAAAGTGCTGAAAGGGCTTGATGCGGTGCGTAAACGTCCCGGAATGTATATCGGTGACACAGACGATGGAACGGGTTTACACCATATGGTTTTTGAAGTGGTGGATAACGCCATTGACGAAGCCTTGGCAGGGTAt < 1:353311/195‑1 (MQ=255) aTTATACAGAGAAGAATTATGTCAACAAATACTCCTGAAACTTATGGTGCAAACAGTATTAAAGTGCTGAAAGGGCTTGATGCGGTGCGTAAACGTCCCGGAATGTATATCGGTGACACAGACGATGGAACGGGCTTACACCATATGGTTTTTGAAGTGGTGGATAACGCCATTGACGAAGCCTTGGCAGGGTATTGCGACGACATCGTAGTCACTATTCATTCCGACAATTCCGTTTCCGTGCAAGACGa > 1:20272/1‑251 (MQ=255) | TTGTGTTTAACGACGCAACGCTACAAGAAATGGCGCAATATCAACCTGTCAGTAACATTGAAATGCTGCAAATCAACGGCGTTGGCGCCATTAAACTGGAGCGTTTCGGGCAGGCATTTCTCACCTTGATCCGCGAACATAAAAGTGCCCGCGCCGGCGAATAATCCCCGCCACCGCTTCGGCGCACTTA‑TTTTTAGCTAATTGCACAAAATTTTGCTATAATCCCGCCCGATTTTTTACGAATTACACAGAGAAGAATTATGTCAACAAATACTCCTGAAACTTATGGTGCAAACAGTATTAAAGTGCTGAAAGGGCTTGATGCGGTGCGTAAACGTCCCGGAATGTATATCGGTGACACAGACGATGGAACGGGTTTACACCATATGGTTTTTGAAGTGGTGGATAACGCCATTGACGAAGCCTTGGCAGGGTATTGCGACGACATCGTAGTCACTATTCATTCCGACAATTCCGTTTCCGTACAAGACGA > 1/1515072‑1515564 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |