| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,508,084 | G→A | Y653Y (TAC→TAT) | unknown ← | LPS‑assembly protein LptD @ Organic solvent tolerance protein precursor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,508,084 | 0 | G | A | 100.0% | 271.8 / NA | 99 | Y653Y (TAC→TAT) | unknown | LPS‑assembly protein LptD @ Organic solvent tolerance protein precursor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (58/41); total (58/41) | |||||||||||
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tCTTTGGCTTGCATAACGGTAAGTTAACTGAATTAAATTCTCTTTTTGCGGATTCCATTCTAATCCGGTATTTGCCAATGAAACCTGTTTTAACTGCGGATCATATTGATAACTTGCGCGCCAACGCCATTGGTCGCTTATTTTCCAGTTGGATTCCAATGCCCATGACGAAGATGCGCCGGAGGTTTTATTATTCGGGTTATCATCAATGCGGGACGGCTTTAAATAAAAGGTTTGCCCGATGGAAAAAt > 1:505220/1‑251 (MQ=255) tCTTTGGCTTGCATAACGGTAAGTTAACTGAATTAAATTCTCTTTTTGCGGATTCCATTCTAATCCGGTATTTGCCAATGAAACCTGTTTTAACTGCGGATCATATTGATAACTTGCGCGCCAACGCCATTGGTCGCTTATTTTCCAGTTGGATTCCAATGCCCATGACGAAGATGCGCCGGAGGTTTTATTATTCGGGTTATCATCAATGCGGGACGGCTTTAAATAAAAGGTTTGCCCGATGGAAAAAt > 1:35386/1‑251 (MQ=255) cTTTGGCTTGCATAACGGTAAGTTAACTGAATTAAATTCTCTTTTTGCGGATTCCATTCTAATCCGGTATTTGCCAATGAAACCTGTTTTAACTGCGGATCATATTGATAACTTGCGCGCCAACGCCATTGGTCGCTTATTTTCCAGTTGGATTCCAATGCCCATGACGAAGATGCGCCGGAGGTTTTATTATTCGGGTTATCATCAATGCGGGACGGCTTTAAATAAAAGGTTTGCCCGATGGAAAAAtt > 1:155419/1‑251 (MQ=255) | TTTGATTTTGGCGGCTGGTGACATAACGTCTGGCGCCTACACCGATGCTCCAACAGCAGGAGTTGTATTGTACGCCAAGGTATTGTTCCACCGGTTTCTTCAGCGCCAAATCCTGATAATAACGCCCGACCACCGCCCAATTGTCGGTGATTTCCCACGCTGCCTGCACGCCCAATTGTTTAATATCCTGATTATAACGATTAGCGCCGACATCCAGGTTTTGATCGATATATCTTTGGCTTGCGTAACGGTAAGTTAACTGAATTAAATTCTCTTTTTGCGGATTCCATTCTAATCCGGTATTTGCCAATGAAACCTGTTTTAACTGCGGATCATATTGATAACTTGCGCGCCAACGCCATTGGTCGCTTATTTTCCAGTTGGATTCCAATGCCCATGACGAAGATGCGCCGGAGGTTTTATTATTCGGGTTATCATCAATGCGGGACGGCTTTAAATAAAAGGTTTGCCCGATGGAAAAATT > 1/1507840‑1508323 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |