| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 292,883 | A→G | intergenic (+5/‑19) | unknown → / → unknown | Cystathionine gamma‑synthase (EC 2.5.1.48)/D‑lactate dehydrogenase (EC 1.1.1.28) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 292,883 | 0 | A | G | 100.0% | 169.8 / NA | 60 | intergenic (+5/‑19) | unknown/unknown | Cystathionine gamma‑synthase (EC 2.5.1.48)/D‑lactate dehydrogenase (EC 1.1.1.28) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (32/28); total (32/28) | |||||||||||
GGATGAAAGTTGGGTTAATACGTTCTTGAAGGCGATTAAATTGATTACGTTCGCCGAAAGCCTTGGCGGTACCGAAAGTTTCATTACTTACCCGGCAACTCAAACCCACATGGATATTCCGGAAGCAGAGCGCATTGCGCGCGGTATCACCAATAATCTGCTGCGTTTCTCTGTCGGTTTGGAAAATGTGGAAGACATCAAAGCGGATCTGGTACAGGCGTTTGCACAGCTTAAATAAATTTAATATATTTGGAGGGTAAAATGAAAGTTGCAGTATATAGCACCAAAAGTTATGACCGAAAATATTTAGAGTTAATTGATGCTAAATACGGCTTGGATTTGGAATTTTACGATTTCATGCTCAGTGAGCGCACGGCAAAAATGGCGGAACATTGTGAAGCCGTATGTATTTTCGTGAATGATGACGGAAGCAGAAAAGTGTTGGAAAAACTCGCCGCACTTGGAGTAAAAATTATTGC > 1/292641‑293119 | ggATGAAAGTTGGGTTAATACGTTCTTGAAGGCGATTAAATTGATTACGTTCGCCGAAAGCCTTGGCGGTACCGAAAGTTTCATTACTTACCCGGCAACTCAAACCCACATGGATATTCCGGAAGCAGAGCGCATTGCGCGCGGTATCACCAATAATCTGCTGCGTTTCTCTGTCGGTTTGGAAAATGTGGAAGACATCAAAGCGGATCTGGTACAGGCGTTTGCACAGCTTAAATAAATTTGATATAttt > 1:845672/1‑251 (MQ=255) gATGAAAGTTGGGTTAATACGTTCTTGAAGGCGATTAAATTGATTACGTTCGCCGAAAGCCTTGGCGGTACCGAAAGTTTCATTACTTACCCGGCAACTCAAACCCACATGGATATTCCGGAAGCAGAGCGCATTGCGCGCGGTATCACCAATAATCTGCTGCGTTTCTCTGTCGGTTTGGAAAATGTGGAAGACATCAAAGCGGATCTGGTACAGGCGTTTGCACAGCTTAAATAAATTTGATATATTTg > 1:577632/1‑251 (MQ=255) aaaGTTGGGTTAATACGTTCTTGAAGGCGATTAAATTGATTACGTTCGCCGAAAGCCTTGGCGGTACCGAAAGTTTCATTACTTACCCGGCAACTCAAACCCACATGGATATTCCGGAAGCAGAGCGCATTGCGCGCGGTATCACCAATAATCTGCTGCGTTTCTCTGTCGGTTTGGAAAATGTGGAAGACATCAAAGCGGATCTGGTACAGGCGTTTGCACAGCTTAAATAAATTTGATATATTTGGAgg < 1:542348/251‑1 (MQ=255) aaaGTTGGGTTAATACGTTCTTGAAGGCGATTAAATTGATTACGTTCGCCGAAAGCCTTGGCGGTACCGAAAGTTTCATTACTTACCCGGCAACTCAAACCCACATGGATATTCCGGAAGCAGAGCGCATTGCGCGCGGTATCACCAATAATCTGCTGCGTTTCTCTGTCGGTTTGGAAAATGTGGAAGACATCAAAGCGGATCTGGTACAGGCGTTTGCACAGCTTAAATAAATTTGATATATTTGGAg < 1:687035/250‑1 (MQ=255) aaaGTTGGGTTAATACGTTCTTGAAGGCGATTAAATTGATTACGTTCGCCGAAAGCCTTGGCGGTACCGAAAGTTTCATTACTTACCCGGCAACTCAAACCCACATGGATATTCCGGAAGCAGAGCGCATTGCGCGCGGTATCACCAATAATCTGCTGCGTTTCTCTGTCGGTTTGGAAAATGTGGAAGACATCAAAGCGGATCTGGTACAGGCGTTTGCACAGCTTAAATAAATTTGATATATTTGGAg < 1:359523/250‑1 (MQ=255) aaGTTGGGTTAATACGTTCTTGAAGGCGATTAAATTGATTACGTTCGCCGAAAGCCTTGGCGGTACCGAAAGTTTCATTACTTACCCGGCAACTCAAACCCACATGGATATTCCGGAAGCAGAGCGCATTGCGCGCGGTATCACCAATAATCTGCTGCGTTTCTCTGTCGGTTTGGAAAATGTGGAAGACATCAAAGCGGATCTGGTACAGGCGTTTGCACAGCTTAAATAAATTTGATATATTTGGAggg > 1:649839/1‑251 (MQ=255) ggTTAATACGTTCTTGAAGGCGATTAAATTGATTACGTTCGCCGAAAGCCTTGGCGGTACCGAAAGTTTCATTACTTACCCGGCAACTCAAACCCACATGGATATTCCGGAAGCAGAGCGCATTGCGCGCGGTATCACCAATAATCTGCTGCGTTTCTCTGTCGGTTTGGAAAATGTGGAAGACATCAAAGCGGATCTGGTACAGGCGTTTGCACAGCTTAAATAAATTTGatat > 1:383217/1‑235 (MQ=255) 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aTTAAATTGATTACGTTCGCCGAAAGCCTTGGCGGTACCGAAAGTTTCATTACTTACCCGGCAACTCAAACCCACATGGATATTCCGGAAGCAGAGCGCATTGCGCGCGGTATCACCAATAATCTGCTGCGTTTCTCTGTCGGTTTGGAAAATGTGGAAGACATCAAAGCGGATCTGGTACAGGCGTTTGCACAGCTTAAATAAATTTGATATATTTGGAGGGTAAAATGAAAGTTGCAGTATATAGCAc > 1:674027/1‑250 (MQ=255) aTTGATTACGTTCGCCGAAAGCCTTGGCGGTACCGAAAGTTTCATTACTTACCCGGCAACTCAAACCCACATGGATATTCCGGAAGCAGAGCGCATTGCGCGCGGTATCACCAATAATCTGCTGCGTTTCTCTGTCGGTTTGGAAAATGTGGAAGACATCAAAGCGGATCTGGTACAGGCGTTTGCACAGCTTAAATAAATTTGATATATTTGGAGGGTAAAATGAAAGTTGCAGTATATAGCACCAAAAg > 1:209889/1‑251 (MQ=255) gATTACGTTCGCCGAAAGCCTTGGCGGTACCGAAAGTTTCATTACTTACCCGGCAACTCAAACCCACATGGATATTCCGGAAGCAGAGCGCATTGCGCGCGGTATCACCAATAATCTGCTGCGTTTCTCTGTCGGTTTGGAAAATGTGGAAGACATCAAAGCGGATCTGGTACAGGCGTTTGCACAGCTTAAATAAATTTGATATATTTGGAGGGTAAAATGAAAGTTGCAGtat < 1:491587/235‑1 (MQ=255) 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ttCATTACTTACCCGGCAACTCAAACCCACATGGATATTCCGGAAGCAGAGCGCATTGCGCGCGGTATCACCAATAATCTGCTGCGTTTCTCTGTCGGTTTGGAAAATGTGGAAGACATCAAAGCGGATCTGGTACAGGCGTTTGCACAGCTTAAATAAATTTGATATATTTGGAGGGTAAAATGAAAGTTGCAGTATATAGCACCAAAAGTTATGACCGAAAATATTTAGAGTTAATTGATGCTAAATAc < 1:7861/251‑1 (MQ=255) ttCATTACTTACCCGGCAACTCAAACCCACATGGATATTCCGGAAGCAGAGCGCATTGCGCGCGGTATCACCAATAATCTGCTGCGTTTCTCTGTCGGTTTGGAAAATGTGGAAGACATCAAAGCGGATCTGGTACAGGCGTTTGCACAGCTTAAATAAATTTGATATATTTGGAGGGTAAAATGAAAGTTGCAGTATATAGCACCAAAAGTTATGACCGAAAATATTTAGAGTTAATTGATGCTAAATAc < 1:901781/251‑1 (MQ=255) aCTCAAACCCACATGGATATTCCGGAAGCAGAGCGCATTGCGCGCGGTATCACCAATAATCTGCTGCGTTTCTCTGTCGGTTTGGAAAATGTGGAAGACATCAAAGCGGATCTGGTACAGGCGTTTGCACAGCTTAAATAAATTTGATATATTTGGAGGGTAAAATGAAAGTTGCAGTATATAGCACCAAAAGTTATGACCGAAAATATTTAGAGTTAATTGATGCTAAATAc > 1:731443/1‑233 (MQ=255) cTCAAACCCACATGGATATTCCGGAAGCAGAGCGCATTGCGCGCGGTATCACCAATAATCTGCTGCGTTTCTCTGTCGGTTTGGAAAATGTGGAAGACATCAAAGCGGATCTGGTACAGGCGTTTGCACAGCTTAAATAAATTTGATATATTTGGAGGGTAAAATGAAAGTTGCAGTATATAGCACCAAAAGTTATGACCGAAAATATTTAGAGTTAATTGATGCTAAATACGGCTTGGATTTGGAAtttt > 1:279960/1‑251 (MQ=255) cAAACCCACATGGATATTCCGGAAGCAGAGCGCATTGCGCGCGGTATCACCAATAATCTGCTGCGTTTCTCTGTCGGTTTGGAAAATGTGGAAGACATCAAAGCGGATCTGGTACAGGCGTTTGCACAGCTTAAATAAATTTGATATATTTGGAGGGTAAAATGAAAGTTGCAGTATATAGc > 1:648009/1‑182 (MQ=255) cccACATGGATATTCCGGAAGCAGAGCGCATTGCGCGCGGTATCACCAATAATCTGCTGCGTTTCTCTGTCGGTTTGGAAAATGTGGAAGACATCAAAGCGGATCTGGTACAGGCGTTTGCACAGCTTAAATAAATTTGATATATTTgg > 1:881814/1‑149 (MQ=255) cacaTGGATATTCCGGAAGCAGAGCGCATTGCGCGCGGTATCACCAATAATCTGCTGCGTTTCTCTGTCGGTTTGGAAAATGTGGAAGACATCAAAGCGGATCTGGTACAGGCGTTTGCACAGCTTAAATAAATTTGATATATTTGGAGGGTAAAATGAAAGTTGCAGTATATAGCACCAAAAGTTATGACCGAAAATATTTAGAGTTAATTGATGCTAAATAc < 1:623284/224‑1 (MQ=255) 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GGATGAAAGTTGGGTTAATACGTTCTTGAAGGCGATTAAATTGATTACGTTCGCCGAAAGCCTTGGCGGTACCGAAAGTTTCATTACTTACCCGGCAACTCAAACCCACATGGATATTCCGGAAGCAGAGCGCATTGCGCGCGGTATCACCAATAATCTGCTGCGTTTCTCTGTCGGTTTGGAAAATGTGGAAGACATCAAAGCGGATCTGGTACAGGCGTTTGCACAGCTTAAATAAATTTAATATATTTGGAGGGTAAAATGAAAGTTGCAGTATATAGCACCAAAAGTTATGACCGAAAATATTTAGAGTTAATTGATGCTAAATACGGCTTGGATTTGGAATTTTACGATTTCATGCTCAGTGAGCGCACGGCAAAAATGGCGGAACATTGTGAAGCCGTATGTATTTTCGTGAATGATGACGGAAGCAGAAAAGTGTTGGAAAAACTCGCCGCACTTGGAGTAAAAATTATTGC > 1/292641‑293119 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |