| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,490,722 | A→G | I73T (ATA→ACA) | unknown ← | Mobile element protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,490,722 | 0 | A | G | 100.0% | 194.2 / NA | 71 | I73T (ATA→ACA) | unknown | Mobile element protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (35/36); total (35/36) | |||||||||||
CTTCTGACATTATGGTGTTTATAAGGGAAATAACCCTTTTCATTCGGCTTGTCCGAGCGTTCCGTCAAAAACGTTTGATGATTCCGATACCACAAATAGAGCCGGACATAAAAGTCATTTTTATGGCTATTTTTTAAGTGTCCTGA‑CGAGTACCTTTAAGGCTTTCCCCGCCTCAGATTGATGCTTATTACGCAATGCCCTCATGGCGATTGCTACCATATGAAATTAGCACATTTGTATCGGTATGTTGAACAAATCCTTTAATACTCCCCGTCTACCGTCGCAGGTAATCAATTGAATAACATAACCTTTTTCTCTTAGCCGATTAAATGCCATTTTATAATAAATGTCTTTTTCGGTTTTCACGATTTGGTGATAAATCACTTTTCCCGACAACGAATCTAACAGCACAAGCACACCGAAATCCCGACCAAAGAAGGTGACGTCGGCAAGGATATTCAATTGACGTTGTTGAGGAGGA > 1/1490478‑1490958 | cTTCTGACATTATGGTGTTTATAAGGGAAATAACCCTTTTCATTCGGCTTGTCCGAGCGTTCCGTCAAAAACGTTTGATGATTCCGATACCACAAATAGAGCCGGACATAAAAGTCATTTTTATGGCTATTTTTTAAGTGTCCTGA‑CGAGTACCTTTAAGGCTTTCCCCGCCTCAGATTGATGCTTATTACGCAATGCCCTCATGGCGATTGCTACCATATGAAATTAGCACATTTGTATCGGTGTGTTGa > 1:417327/1‑251 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cTCATGGCGATTGCTACCATATGAAATTAGCACATTTGTATCGGTGTGTTGAACAAATCCTTTAATACTCCCCGTCTACCGTCGCAGGTAATCAATTGAATAACATAACCTTTTTCTCTTAGCCGATTAAATGCCATTTTATAATAAATGTCTTTTTCGGTTTTCACGATTTGGTGATAAATCACTTTTCCCGACAACGAATCTAACAGCACAAGCACACCGAAATCCCGACCAAAGAAGGTGACGTCgg > 1:171381/1‑250 (MQ=255) cATGGCGATTGCTACCATATGAAATTAGCACATTTGTATCGGTGTGTTGAACAAATCCTTTAATACTCCCCGTCTACCGTCGCAGGTAATCAATTGAATAACATAACCTTTTTCTCTTAGCCGATTAAATGCCATTTTATAATAAATGTCTTTTTCGGTTTTCACGATTTGGTGATAAATCACTTTTCCCGACAACGAATCTAACAGCACAAGCACACCGAAATCCCGACCAAAGAAGGTGACGTCGGCaa > 1:147463/1‑251 (MQ=255) tGGCGATTGCTACCATATGAAATTAGCACATTTGTATCGGTGTGTTGAACAAATCCTTTAATACTCCCCGTCTACCGTCGCAGGTAATCAATTGAATAACATAACCTTTTTCTCTTAGCCGATTAAATGCCATTTTATAATAAATGTCTTTTTCGGTTTTCACGATTTGGTGATAAATCACTTTTCCCGACAACGAATCTAACagcacaagca > 1:525393/1‑213 (MQ=255) aTTGCTACCATATGAAATTAGCACATTTGTATCGGTGTGTTGAACAAATCCTTTAATACTCCCCGTCTACCGTCGCAGGTAATCAATTGAATAACATAACCTTTTTCTCTTAGCCGATTAAATGCCATTTTATAATAAATGTCTTTTTCGGTTTTCACGATTTGGTGATAAATCACTTTTCCCGACAACGAATCTAACAGCACAAGCACACCGAAATCCCGACCAAAGAAGGTGACGTCGGCAAGGATAtt > 1:687564/1‑251 (MQ=255) ttGCTACCATATGAAATTAGCACATTTGTATCGGTGTGTTGAACAAATCCTTTAATACTCCCCGTCTACCGTCGCAGGTAATCAATTGAATAACATAACCTTTTTCTCTTAGCCGATTAAATGCCATTTTATAATAAATGTCTTTTTCGGTTTTCACGATTTGGTGATAAATCACTTTTCCCGACAACGAATCTAACAGCACAAGCACACCGAAATCCCGACCAAAGAAGGTGACGTCGGCAAGGATATTc < 1:634426/251‑1 (MQ=255) ttGCTACCATATGAAATTAGCACATTTGTATCGGTGTGTTGAACAAATCCTTTAATACTCCCCGTCTACCGTCGCAGGTAATCAATTGAATAACATAACCTTTTTCTCTTAGCCGATTAAATGCCATTTTATAATAAATGTCTTTTTCGGTTTTCACGATTTGGTGATAAATCACTTTTCCCGACAACGAATCTAACAGCACAAGCACACCGAAATCCCGACCAAAGAAGGTGACGTCGGCAAGGATATTc < 1:172931/251‑1 (MQ=255) ccATATGAAATTAGCACATTTGTATCGGTGTGTTGAACAAATCCTTTAATACTCCCCGTCTACCGTCGCAGGTAATCAATTGAATAACATAACCTTTTTCTCTTAGCCGATTAAATGCCATTTTATAATAAATGTCTTTTTCGGTTTTCACGATTTGGTGATAAATCACTTTTCCCGACAACGAATCTAACAGCACAAGCACACCGAAATcc > 1:198127/1‑212 (MQ=255) cATATGAAATTAGCACATTTGTATCGGTGTGTTGAACAAATCCTTTAATACTCCCCGTCTACCGTCGCAGGTAATCAATTGAATAACATAACCTTTTTCTCTTAGCCGATTAAATGCCATTTTATAATAAATGTCTTTTTCGGTTTTCACGATTTGGTGATAAATCACTTTTCCCGACAACGAATCTAACAGCACAAGCACACCGAAATCCCGACCAAAGAAGGTGACGTCGGCAAGGATATTCAATTGa > 1:237740/1‑250 (MQ=255) tatGAAATTAGCACATTTGTATCGGTGTGTTGAACAAATCCTTTAATACTCCCCGTCTACCGTCGCAGGTAATCAATTGAATAACATAACCTTTTTCTCTTAGCCGATTAAATGCCATTTTATAATAAATGTC‑TTTTCGGTTTTCACGATTTGGTGATAAATCACTTTTCCCGACAACGAATCTAACagcacaagca < 1:351150/197‑1 (MQ=255) atGAAATTAGCACATTTGTATCGGTGTGTTGAACAAATCCTTTAATACTCCCCGTCTACCGTCGCAGGTAATCAATTGAATAACATAACCTTTTTCTCTTAGCCGATTAAATGCCATTTTATAATAAATGTCTTTTTCGGTTTTCACGATTTGGTGATAAATCACTTTTCCCGACAACGAATCTAACAGCACAAGCACACCGAAATcc > 1:425930/1‑208 (MQ=255) aaTTAGCACATTTGTATCGGTGTGTTGAACAAATCCTTTAATACTCCCCGTCTACCGTCGCAGGTAATCAATTGAATAACATAACCTTTTTCTCTTAGCCGATTAAATGCCATTTTATAATAAATGTCTTTTTCGGTTTTCACGATTTGGTGATAAATc < 1:496651/159‑1 (MQ=255) acaTTTGTATCGGTGTGTTGAACAAATCCTTTAATACTCCCCGTCTACCGTCGCAGGTAATCAATTGAATAACATAACCTTTTTCTCTTAGCCGATTAAATGCCATTTTATAATAAATGTCTTTTTCGGTTTTCACGATTTGGTGATAAATCACTTTTCCCGACAACGAATCTAACAGCACAAGCACACCGAAATCCCGACCAAAGAAGGTGACGTCGGCAAGGATATTCAATTGACGTTGTTGAggagga > 1:243642/1‑251 (MQ=255) caTTTGTATCGGTGTGTTGAACAAATCCTTTAATACTCCCCGTCTACCGTCGCAGGTAATCAATTGAATAACATAACCTTTTTCTCTTAGCCGATTAAATGCCATTTTataata < 1:87562/114‑1 (MQ=255) caTTTGTATCGGTGTGTTGAACAAATCCTTTAATACTCCCCGTCTACCGTCGCAGGTAATCAATTGAATAACATAACCTTTTTCTCTTAGCCGATTAAATGCCATTTTATAATAAATGTCTTTTTCGGTTTTCACGATTTGGTGATAAATCACTTTTCCCGACAACGAATCTAAc > 1:852013/1‑175 (MQ=255) caTTTGTATCGGTGTGTTGAACAAATCCTTTAATACTCCCCGTCTACCGTCGCAGGTAATCAATTGAATAACATAACCTTTTTCTCTTAGCCGATTAAATGCCATTTTATAATAAATGTCTTTTTCGGTTTTCACGATTTGGTGATAAATCACTTTTCCCGACAACGAATCTAACAGCACAAGCACACCGAAATCCCGACCAAAGAAGGTGACGTCGGCAAGGATATTCAATTGACGTTGTTgagg < 1:28309/246‑1 (MQ=255) | CTTCTGACATTATGGTGTTTATAAGGGAAATAACCCTTTTCATTCGGCTTGTCCGAGCGTTCCGTCAAAAACGTTTGATGATTCCGATACCACAAATAGAGCCGGACATAAAAGTCATTTTTATGGCTATTTTTTAAGTGTCCTGA‑CGAGTACCTTTAAGGCTTTCCCCGCCTCAGATTGATGCTTATTACGCAATGCCCTCATGGCGATTGCTACCATATGAAATTAGCACATTTGTATCGGTATGTTGAACAAATCCTTTAATACTCCCCGTCTACCGTCGCAGGTAATCAATTGAATAACATAACCTTTTTCTCTTAGCCGATTAAATGCCATTTTATAATAAATGTCTTTTTCGGTTTTCACGATTTGGTGATAAATCACTTTTCCCGACAACGAATCTAACAGCACAAGCACACCGAAATCCCGACCAAAGAAGGTGACGTCGGCAAGGATATTCAATTGACGTTGTTGAGGAGGA > 1/1490478‑1490958 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |