| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,489,956 | G→A | intergenic (+229/‑41) | unknown → / → unknown | Protein TadG, associated with Flp pilus assembly/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,489,956 | 0 | G | A | 100.0% | 162.2 / NA | 57 | intergenic (+229/‑41) | unknown/unknown | Protein TadG, associated with Flp pilus assembly/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (34/23); total (34/23) | |||||||||||
TCAATAAAGTATGTAAATAATAAAATTAAAACCGTCTTTTACTCAAAAAGACGGTTTTCTTTTACCCTACATACGATCAAAAAAATGACCTCATCACAAAAGCTAATCAGCTAAAATCACAAGGAACAACCTGACTTTTCAAAGGGCAAATAATTTTTCCACGTTTTTGAACATTAAAAACGCCGGTAAAAGCAACCGCACTTTAAATAACACATAATATTCTGGACTTTACCCCGATATTTCCCTATAATCGCGCCTTAATTCTACGCTCACACCGCCCCCATAGCTCAGTCGGTCAGAGCAGTCGACTCATAATCGATTGGTCACAGGTTCAAGTCCTGTTGGGGGCACCAACATATTAATCCATACTACTTCACTCTGATTCAAGTCAAACCAAAACCACTTATAAATTAACATATTTAATCATTTCCATAGTGTATTATGCTTTTTTTGATTCATTTTAGTT > 1/1489721‑1490186 | ccAATAAAGTATGTAAATAATAAAATTAAAACCGTCTTTTACTCAAAAAGACGGTTTTCTTTTACCCTACATACGATCAAAAAAATGACCTCATCACAAAAGCTAATCAGCTAAAATCACAAGGAACAACCTGACTTTTCAAAGGGCAAATAATTTTTCCACGTTTTTGAACATTAAAAACGCCGGTAAAAGCAACCGCACTTTAAATAACACATAATATTCTGGACTTTACCCCAATATTTCCCTATAAt > 1:481513/2‑251 (MQ=255) 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1:128652/1‑218 (MQ=255) ccccAATATTTCCCTATAATGGCGCCTTAATTCTACGCTCACACCGCCCCCATAGCTCAGTCGGTCAGAGCAGTCGACTCATAATCGATTAGTCACAGGTTCAAGTCCTGTTGGGGGCACCAACATATTAATCCATACTACTTCACTCTGATTCAAGTCAAACCAAAACCACTTATAAATTAACATATTTAATCATTTcc < 1:335711/200‑1 (MQ=255) | TCAATAAAGTATGTAAATAATAAAATTAAAACCGTCTTTTACTCAAAAAGACGGTTTTCTTTTACCCTACATACGATCAAAAAAATGACCTCATCACAAAAGCTAATCAGCTAAAATCACAAGGAACAACCTGACTTTTCAAAGGGCAAATAATTTTTCCACGTTTTTGAACATTAAAAACGCCGGTAAAAGCAACCGCACTTTAAATAACACATAATATTCTGGACTTTACCCCGATATTTCCCTATAATCGCGCCTTAATTCTACGCTCACACCGCCCCCATAGCTCAGTCGGTCAGAGCAGTCGACTCATAATCGATTGGTCACAGGTTCAAGTCCTGTTGGGGGCACCAACATATTAATCCATACTACTTCACTCTGATTCAAGTCAAACCAAAACCACTTATAAATTAACATATTTAATCATTTCCATAGTGTATTATGCTTTTTTTGATTCATTTTAGTT > 1/1489721‑1490186 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |