| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,487,174 | T→C | S109S (AGT→AGC) | unknown → | Flp pilus assembly membrane protein TadE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,487,174 | 0 | T | C | 100.0% | 164.1 / NA | 60 | S109S (AGT→AGC) | unknown | Flp pilus assembly membrane protein TadE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (14/46); total (14/46) | |||||||||||
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TTCCTAATTCTAGAATTCTGTCGTATATCTATTACAACTGCGTACTGGGACTTGGCTATCACTGAAAGTGCAAGAATTGCTAAAAATAGAACTGCAGAGGGTAATGATTATGCGGTAGAATTTGAGAAAGCTCTAAAACAACAGCTTGTTTATCAAGAATCTTCAACTTTAGGTTATCTCGCCCGTTTGGATAAAAATGGCGGTTACAAGATTGATGTTAAATATGTTGATTGTGGTAGTGAGAGTTCTTGTGTTAAGTCTTTATTGGATGGTAGGTTTAGACGGCCTACTAAAGATAGAGACGGTAAGATTATACCCCCC‑AATGGTCGGTTAGCAACATTGGCTGTATATTCATTGACCTACAATTATGAGTTTCTGGTTTCACTGCCATTTTTACCTAAGGATAGTGTTGGCGGTTTATTGTCACGTAAGTTTGTAGCCGTACAGGAATTTAATAGATCTAAATTCCAATATCCCGGCAGG > 1/1486929‑1487411 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |