| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 283,215 | T→C | V105V (GTA→GTG) | unknown ← | Membrane‑bound lytic murein transglycosylase A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 283,215 | 0 | T | C | 100.0% | 192.4 / NA | 68 | V105V (GTA→GTG) | unknown | Membrane‑bound lytic murein transglycosylase A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (28/40); total (28/40) | |||||||||||
CAATTCCAAACCTTTACCTCTCAATGCACCGGCATAAATTTCGGCACGGGAGAAACGTTTTTTCGAAGGAAGTGCATAAATCGGTTGGTTAAATTTGCCTTGTTGGGTGCGACGGGCATGAATCACCGGGGAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTTACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATTTGGCTCACCGGCATAAAAATGGATTGCTGATAAGTCCGTCCGTTATAAATTGCGCCGAATTTTTGCGGATCGATGTCCAATGTATTTTGGGCTGTTGTTTGTCCGGCTGCAGGTTTATTAGAA > 1/282969‑283452 | cAATTCCAAACCTTTACCTCTCAATGCACCGGCATAAATTTCGGCACGGGAGAAACGTTTTTTCGAAGGAAGTGCATAAATTGGTTGGTTAAATTTGCCTTGTTGGGTGCGACGGGCATGAATCACCGGGGAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACtt < 1:435340/251‑1 (MQ=255) ttCCAAACCTTTACCTCTCAATGCACCGGCATAAATTTCGGCACGGGAGAAACGTTTTTTCGAAGGAAGTGCATAAATCGGTTGGTTAAATTTGCCTTGTTGGGTGCGACGGGCATGAATCACCGGGGAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTttgt > 1:895915/1‑251 (MQ=255) ttCCAAACCTTTACCTCTCAATGCACCGGCATAAATTTCGGCACGGGAGAAACGTTTTTTCGAAGGAAGTGCATAAATCGGTTGGTTAAATTTGCCTTGTTGGGTGCGACGGGCATGAATCACCGGGGAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTttgt > 1:400247/1‑251 (MQ=255) ttCCAAACCTTTACCTCTCAATGCACCGGCATAAATTTCGGCACGGGAGAAACGTTTTTTCGAAGGAAGTGCATAAATCGGCTGGTTAAATTTGCCTTGTTGGGTGCGACGGGCATGAATCACCGGGGAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTttgt > 1:47520/1‑251 (MQ=255) aaCCTTTACCTCTCAATGCACCGGCATAAATTTCGGCACGGGAGAAACGTTTTTTCGAAGGAAGTGCATAAATCGGTTGGTTAAATTTGCCTTGTTGGGTGCGACGGGCATGAATCACCGGGGAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTaa < 1:806626/251‑1 (MQ=255) ccTTTACCTCTCAATGCACCGGCATAAATTTCGGCACGGGAGAAACGTTTTTTCGAAGGAAGTGCATAAATCGGTTGGTTAAATTTGCCTTGTTGGGTGCGACGGGCATGAATCACCGGGGAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAg < 1:870594/251‑1 (MQ=255) ccTTTACCTCTCAATGCACCGGCATAAATTTCGGCACGGGAGAAACGTTTTTTCGAAGGAAGTGCATAAATCGGTTGGTTAAATTTGCCTTGTTGGGTGCGACGGGCATGAATCACCGGGGAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAg > 1:395368/1‑251 (MQ=255) cTTTACCTCTCAATGCACCGGCATAAATTTCGGCACGGGAGAAACGTTTTTTCGAAGGAAGTGCATAAATCGGTTGGTTAAATTTGCCTTGTTGGGTGCGACGGGCATGAATCACCGGGGAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGc < 1:881289/251‑1 (MQ=255) tctcAATGCACCGGCATAAATTTCGGCACGGGAGAAACGTTTTTTCGAAGGAAGTGCATAAATCGGTTGGTTAAATTTGCCTTGTTGGGTGCGACGGGCATGAATCACCGGGGAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGa > 1:790452/1‑251 (MQ=255) ggCATAAATTTCGGCACGGGAGAAACGTTTTTTCGAAGGAAGTGCATAAATCGGTTGGTTAAATTTGCCTTGTTGGGTGCGACGGGCATGAATCACCGGGGAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCa > 1:810076/1‑251 (MQ=255) tAAATTTCGGCACGGGAGAAACGTTTTTTCGAAGGAAGTGCATAAATCGGTTGGTTAAATTTGCCTTGTTGGGTGCGACGGGCATGAATCACCGGGGAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAAttt < 1:50520/251‑1 (MQ=255) aaaCGTTTTTTCGAAGGAAGTGCATAAATCGGTTGGTTAAATTTGCCTTGTTGGGTGCGACGGGCATGAATCACCGGGGAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAAttattt < 1:349213/249‑1 (MQ=255) aCGTTTTTTCGAAGGAAGTGCATAAATCGGTTGGTTAAATTTGCCTTGTTGGGTGCGACGGGCATGAATCACCGGGGAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTatat < 1:523454/251‑1 (MQ=255) gaagTGCATAAATCGGTTGGTTAAATTTGCCTTGTTGGGTGCGACGGGCATGAATCACCGGGGAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTCACAGTTGGGtt > 1:861018/1‑251 (MQ=255) gTGCATAAATCGGTTGGTTAAATTTGCCTTGTTGGGTGCGACGGGCATGAATCACCGGGGAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAatta < 1:179545/227‑1 (MQ=255) gttAAATTTGCCTTGTTGGGTGCGACGGGCATGAATCACCGGGGAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGAATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAAttt > 1:637092/1‑198 (MQ=255) tAAATTTGCCTTGTTGGGTGCGACGGGCATGAATCACCGGGGAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTacc < 1:464092/251‑1 (MQ=255) aaTTTGCCTTGTTGGGTGCGACGGGCATGAATCACCGGGGAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATAtt < 1:344666/215‑1 (MQ=255) aaTTTGCCTTGTTGGGTGCGACGGGCATGAATCACCGGGGAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTaccac < 1:4856/251‑1 (MQ=255) aaTTTGCCTTGTTGGGTGCGACGGGCATGAATCACCGGGGAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTaccac < 1:354237/251‑1 (MQ=255) gCCTTGTTGGGTGCGACGGGCATGAATCACCGGGGAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCa > 1:228390/1‑250 (MQ=255) gCCTTGTTGGGTGCGACGGGCATGAATCACCGGGGAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGACGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCa > 1:450763/1‑250 (MQ=255) gttgGGTGCGACGGGCATGAATCACCGGGGAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAAttatttat < 1:708290/202‑1 (MQ=255) ttgGGTGCGACGGGCATGAATCACCGGGGAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTg < 1:787280/250‑1 (MQ=255) ggTGCGACGGGCATGAATCACCGGGGAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGtttt > 1:253278/1‑251 (MQ=255) ggCATGAATCACCGGGGAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGAc < 1:567559/196‑1 (MQ=255) gcacgAATCACCGGGGAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATTTGGc < 1:21565/246‑1 (MQ=255) gCATGAATCACCGGGGAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATTTGGc < 1:644952/250‑1 (MQ=255) aCCGGGGAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATTTGGCTCACCGGCAt < 1:382646/251‑1 (MQ=255) ccGGGGAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTaccac > 1:687340/1‑217 (MQ=255) ggggAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATTTGGCTCACCGGCATaaa > 1:461212/1‑251 (MQ=255) gggAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTacca > 1:84915/1‑213 (MQ=255) gAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAAttattta > 1:316818/1‑172 (MQ=255) gAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATTTGGCTCACCgg > 1:870755/1‑242 (MQ=255) aataatAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATTTGGCTCACCGGCATAAAAAt < 1:465424/250‑1 (MQ=255) aataatAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATTTGGCTCACCGGCATAAAAAt < 1:728796/250‑1 (MQ=255) ataataGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGc < 1:441087/156‑1 (MQ=255) cccGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTatat < 1:651058/166‑1 (MQ=255) gTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATAtt < 1:318737/164‑1 (MQ=255) tCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATTTGGCTCACCGGCATAAAAATGGATTGCTGATa < 1:167672/250‑1 (MQ=255) cATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATTTGGCTCACCGGCATAAAAATGGATTGCTGATAAg < 1:766020/251‑1 (MQ=255) tGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATTTGGCTCACCGGCATAAAAATGGATTGCTGATAAgtc < 1:182484/251‑1 (MQ=255) gTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATTTGGCTCACCGGCATAAAAATGGATTGCTGATAAg > 1:636749/1‑246 (MQ=255) tAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATTTGGCTCACCGGCATAAAAATGGATTGCTGATAAGTCCGTCCGTTATAAAt < 1:896132/251‑1 (MQ=255) gCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCGCTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATGTGGCTCACCGGCATAAAAATGGATTGCTGATAAgtcc < 1:390245/212‑1 (MQ=255) gCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAAttatttat > 1:314904/1‑117 (MQ=255) gCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATTTGGCTCACCGGCATAAAAATGGATTGCTGATAAGTCCGTCCGTTATAAAt < 1:155578/225‑1 (MQ=255) cTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATTTGGCTCACCGGCATAAAAATGGATTGCTGATAAGTCCGTCCGTTATAAATTGCGCCGAATTTTTGCGGATCGATGt < 1:71171/250‑1 (MQ=255) tttGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATTTGGCTCACCGGCATAAAAATGGATTGCTGATAAGTCCGTCCGTTATAAATTGCGCCGAATTTTTGCGGATCGATGTcc < 1:498715/251‑1 (MQ=255) aTACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATTTGGCTCACCGGCATAAAAATGGATTGCTGATAAGTCCGTCCGTTATAAATTGCGCCGAATTTTTGCGGATCGATGTCCAATg < 1:774260/250‑1 (MQ=255) aaTTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATTTGGCTCACCGGCATAAAAATGGATTGCTGATAAGTCCGTCCGTTATAAATTGCGCCGAATTTTTGCGGATCGATGTCCAATGTATTTTgg < 1:597831/251‑1 (MQ=255) aaTTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATTTGGCTCACCGGCATAAAAATGGATTGCTGATAAGTCCGTCCGTTATAAATTGCGCCGAATTTTTGCGGATCGATGTCCAATGTATTTTgg < 1:755689/251‑1 (MQ=255) cACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATTTGGCTCACCGGCATAAAAATGGATTGCTGATAAg > 1:833214/1‑183 (MQ=255) cACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATTTGGCTCACCGGCATAAAAATGGATTGCTGATAAGTCCGTCCGTTATAAATTGCGCCGAATTTTTGCGGATCGATGTCCAATGTATTTTGGGCTGttgtttgt > 1:892213/1‑251 (MQ=255) ccGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCGCCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATTTGGCTCACCGGCATAAAAATGGATTGCTGATAAGTCCGTCCGTTATAAATTGCGCCGAATTTTTGCGGATCGATGTCCAATGTATTTTGGGCTGTTGTTTGTcc < 1:168591/251‑1 (MQ=255) gTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAAttattta < 1:849590/85‑1 (MQ=255) gTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCGCTTTTGTTTTCAATTTGGCTCACCGGCATAAAAATGGATTGCTGATAAg < 1:567129/178‑1 (MQ=255) gTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATTTGGCTCACCGGCATAAAAATGGATTGCTGATAAGTCCGTCCGTTATAAATTGCGCCGAATTTTTGCGGATCGATGTCCAATGTATTTTGGGCTGTTGTTTGTCCgg > 1:330413/1‑250 (MQ=255) gTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATTTGGCTCACCGGCATAAAAATGGATTGCTGATAAGTCCGTCCGTTATAAATTGCGCCGAATTTTTGCGGATCGATGTCCAATGTATTTTGGGCTGTTGTTTGTCCgg > 1:264725/1‑250 (MQ=255) tGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGAc > 1:371492/1‑89 (MQ=255) cACCGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATGTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATTTGGCTCACCGGCATAAAAATGGATTGCTGATAAGTCCGTCCGTTATAAATTGCGCCGAATTTTTGCGGATCGATGTCCAATGTATTTTGGGCTGTTGTTTGTCCGGCTGCAGGt < 1:427745/251‑1 (MQ=255) ccGGCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATTTGGCTCACCGGCATAAAAATGGATTGCTGATAAGTCCGTCCGTTATAAATTGCGCCGAATTTTTGCGGATCGATGTCCAATGTATTTTGGGCTGTTGTTTGTCCGGCTGCAGGttt > 1:277641/1‑251 (MQ=255) ggCGAGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATTTGGCTCACCGGCATaaaaa < 1:441296/152‑1 (MQ=255) aGTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATTTGGCTCACCGGCATAAAAATGGATTGCTGATAAGTCCGTCCGTTATAAATTGCGCCGAATTTTTGCGGATCGATGTCCAATGTATTTTGGGCTGTTGTTTGTCCGGCTGCAGGTTTATTAg < 1:642140/250‑1 (MQ=255) gTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATTTGGCTCACCGGCATAAAAATGGATTGCTGATAAGTCCGTCCGTTATAAATTGCGCCGAATTTTTGCGGATCGATGTCCAATGTAt > 1:484023/1‑213 (MQ=255) gTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATTTGGCTCACCGGCATAAAAATGGATTGCTGATAAGTCCGTCCGTTATAAATTGCGCCGAATTTTTGCGGATCGATGTCCAATGTATTTTggg > 1:883293/1‑219 (MQ=255) gTACCCAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATTTGGCTCACCGGCATAAAAATGGATTGCTGATAAGTCCGTCCGTTATAAATTGCGCCGAATTTTTGCGGATCGATGTCCAATGTATTTTGGGCTGTTGTTTGTCCGGCTGCAGGTTTATTAGaa > 1:885291/1‑251 (MQ=255) cccAAGCGGTCACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATTTGGCTCACCGGCATAAAAATGGATTGCTGATAAGTCCGTCCGTTATAAATTGCGCCGAATTTTTGCGGATCGATGt > 1:258446/1‑201 (MQ=255) | CAATTCCAAACCTTTACCTCTCAATGCACCGGCATAAATTTCGGCACGGGAGAAACGTTTTTTCGAAGGAAGTGCATAAATCGGTTGGTTAAATTTGCCTTGTTGGGTGCGACGGGCATGAATCACCGGGGAATAATAGCCCGTCATGAGTACATTTTGATAGCCGTCGAAGCCTTTCATCACTTGGCTTTGGATACCGAAATTAGTTAATTCACCGGTATTGGCACCGGCGAGTACCCAAGCGGTTACTTTGTTGTAAAGCGGGGCGAAGCTGCTGCTCAATTTAGCGGAATAATTATTTATATTTGACAGTTGGGTTAAAAAATCACCCTGATTTACCACCGCACTTTTGTTTTCAATTTGGCTCACCGGCATAAAAATGGATTGCTGATAAGTCCGTCCGTTATAAATTGCGCCGAATTTTTGCGGATCGATGTCCAATGTATTTTGGGCTGTTGTTTGTCCGGCTGCAGGTTTATTAGAA > 1/282969‑283452 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |