| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,486,964 | A→C | T39T (ACA→ACC) | unknown → | Flp pilus assembly membrane protein TadE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,486,964 | 0 | A | C | 100.0% | 104.9 / NA | 37 | T39T (ACA→ACC) | unknown | Flp pilus assembly membrane protein TadE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (15/22); total (15/22) | |||||||||||
ACATTGATTACGCAAAAGATATTATTGTGAAGGAAAACATTAATACATCTCCTGATGATTTAATTAATGCTCTCAAAAAAACTGAACGCGTATCTAATAATATCGCCAGATAAAAAAAGGTTCTAT‑AATGAAAAAATTCCTATCGAATAAGAAGGGAGCATCAACCGTTGAGTTTGCCTTGACGGTTGTATTTTATTTCTTTGTCGTATTCCTAATTCTAGAATTCTGTCGTATATCTATTACAACTGCGTACTGGGACTTGGCTATCACTGAAAGTGCAAGAATTGCTAAAAATAGAACTGCAGAGGGTAATGATTATGCGGTAGAATTTGAGAAAGCTCTAAAACAACAGCTTGTTTATCAAGAATCTTCAACTTTAGGTTATCTCGCCCGTTTGGATAAAAATGGCGGTTACAAGATTGATGTTAAATATGTTGATTGTGGTAGTGAGAGTTCTTGTGTTAAGTCTTTATTGGATGGTAGGTTTA > 1/1486721‑1487208 | aaaTTGATTACGCAAAAGATATTATTGTGAAGGAAAACATTAACACATCCCCTGATGATTTAGTTAATGCCCTCAAGAAAACTGAACGCGTGTCTAGTAATATCACCAGAT‑‑AAAAAGGTTCTGTAAATGGAAAAATTCCTATCAAATAAAAAGGGAGCGTCAGCCGTTGAGTTTGCCTTGACGGTTGTATTCTATTTCTTTATCGTATTCTTAATTCTAGAATTCTGCCGTATATCTATTACCACTGcat < 1:786540/248‑3 (MQ=255) 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ACATTGATTACGCAAAAGATATTATTGTGAAGGAAAACATTAATACATCTCCTGATGATTTAATTAATGCTCTCAAAAAAACTGAACGCGTATCTAATAATATCGCCAGATAAAAAAAGGTTCTAT‑AATGAAAAAATTCCTATCGAATAAGAAGGGAGCATCAACCGTTGAGTTTGCCTTGACGGTTGTATTTTATTTCTTTGTCGTATTCCTAATTCTAGAATTCTGTCGTATATCTATTACAACTGCGTACTGGGACTTGGCTATCACTGAAAGTGCAAGAATTGCTAAAAATAGAACTGCAGAGGGTAATGATTATGCGGTAGAATTTGAGAAAGCTCTAAAACAACAGCTTGTTTATCAAGAATCTTCAACTTTAGGTTATCTCGCCCGTTTGGATAAAAATGGCGGTTACAAGATTGATGTTAAATATGTTGATTGTGGTAGTGAGAGTTCTTGTGTTAAGTCTTTATTGGATGGTAGGTTTA > 1/1486721‑1487208 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |