| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,486,791 | T→C | A240A (GCT→GCC) | unknown → | Flp pilus assembly protein TadD, contains TPR repeat |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,486,791 | 0 | T | C | 100.0% | 218.4 / NA | 75 | A240A (GCT→GCC) | unknown | Flp pilus assembly protein TadD, contains TPR repeat |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (31/44); total (31/44) | |||||||||||
CGAGTATTTTTTAAACGATGCTGTAGCGGTAAACAATCTTGCTATGCTAAGTATCGTCAACGGAGATTATCGTAATGCCGTTTCATTGTTATTACCTCAGTATTTAAATGGGGTTAGGGAACAGCGTTTAGTACACAATCTAATCTTTGCTTTAATCAAAAATAATGACATTGATTACGCAAAAGATATTATTGTGAAGGAAAACATTAATACATCTCCTGATGATTTAATTAATGCTCTCAAAAAAACTGAACGCGTATCTAATAATATCGCCAGATAAAAAAAGGTTCTAT‑AATGAAAAAATTCCTATCGAATAAGAAGGGAGCATCAACCGTTGAGTTTGCCTTGACGGTTGTATTTTATTTCTTTGTCGTATTCCTAATTCTAGAATTCTGTCGTATATCTATTACAACTGCGTACTGGGACTTGGCTATCACTGAAAGTGCAAGAATTGCTAAAAATAGAACTGCAGAGGGTAATGAT > 1/1486554‑1487036 | agaatATTTCTTAAATGATGCAGTGGCAGTAAATAATATGGCTATGCTAAGTATCATTAATGGAGATTATCGTAATGCTGTTTCATTATTATTGCCTCAGTATTTAAATGGAGTTAGGGAACAGCGTTTGATACACAATCTAGTCTTTGCTTTAGTCAAGAATAACGAAATTGATTACGCAAAAGATATTATTGTGAAGGAAAACATTAACACATCCCCTGATGATTTAGTTAATGCCCTCaagaaaa > 1:358053/5‑248 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |