| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 1,486,393 | A→C | R108R (AGA→CGA) | unknown → | Flp pilus assembly protein TadD, contains TPR repeat |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,486,393 | 0 | A | C | 100.0% | 288.1 / NA | 99 | R108R (AGA→CGA) | unknown | Flp pilus assembly protein TadD, contains TPR repeat |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (43/56); total (43/56) | |||||||||||
CAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGTACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACACGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAATTCATCTCTACTCTATTTACAGCCGTTGCTAACAAACAGTGGGCAGTTAAGTGAAAAGGCCAAAGTTCTACAAGCAAGAAATTTAAATCAACTCAAGCGCTATCAAGAAGCGTTGGAAGTCGAAAACAGCTTATTAACAACATCTCCCAAAAACGGGGAAGTTTATAATCTTCGTGGTGTGACTTATGCCTTAATGGGAAATCCTAATAAAGCCAACGAAGATATAAATAAAGCCCGCGAGTATTTTTTAAACGATGCTGTAGCGGTAAACAATCTTGCTATGCTAAGTATCGTCAACGGAGATTATCGTAATGC > 1/1486146‑1486631 | aaaTAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTCATCTCTACTCTACTTACAGCCGTTGCTAACAAACAGCGGGCAGTTAAGTGAAAGGGCCAAAATTCTACAAGCACGaa > 1:886743/2‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |