| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,486,332 | T→C | Y87Y (TAT→TAC) | unknown → | Flp pilus assembly protein TadD, contains TPR repeat |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,486,332 | 0 | T | C | 100.0% | 243.5 / NA | 84 | Y87Y (TAT→TAC) | unknown | Flp pilus assembly protein TadD, contains TPR repeat |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (46/38); total (46/38) | |||||||||||
CTTAAAAATGTTCTATTGTGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTCAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGTACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACACGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAATTCATCTCTACTCTATTTACAGCCGTTGCTAACAAACAGTGGGCAGTTAAGTGAAAAGGCCAAAGTTCTACAAGCAAGAAATTTAAATCAACTCAAGCGCTATCAAGAAGCGTTGGAAGTCGAAAACAGCTTATTAACAACATCTCCCAAAAACGGGGAAGTTTATAATCTTCGTGGTGTGACTTATGCCTTAATGGGAAATCCTAATAAAGCCAACGAAGATATAAATAAAGCCCGCGAGTATTTTTTAAACGATGCTG > 1/1486087‑1486576 | ctTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTCATCTCTACTCTACTTACa > 1:145183/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |