| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 1,486,203 | T→C | S44S (AGT→AGC) | unknown → | Flp pilus assembly protein TadD, contains TPR repeat |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,486,203 | 0 | T | C | 100.0% | 209.6 / NA | 73 | S44S (AGT→AGC) | unknown | Flp pilus assembly protein TadD, contains TPR repeat |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (38/35); total (38/35) | |||||||||||
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tAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTCATCTCTACTCTACTTACAGCCGTTGCTAACAAACAGCGGGCAGTTAAGTGAAAGGGCCAAAATTCTACAAGCACGAAATTTAAATCAACTTAAGCGTTATCAAGAAGCGTTgg < 1:881516/251‑1 (MQ=255) cTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATaaa > 1:672667/1‑90 (MQ=255) cTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTCATCTCTACTCTACTTa < 1:235941/144‑1 (MQ=255) cTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTCATCTCTACTCTACTTACAGCCGTTGCTAACAAACAGCGGGCAGTTAAGTGAAAGGGCCAAAATTCTACAAGCACGAAATTTAAATCAACTTAAGCGTTATCAAGAAGCGTTGGAAg > 1:328193/1‑244 (MQ=255) 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TAGAAGAAAAGCTTGGTACGCTGTCAGCAAAAATGAGTATCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTAGCTCCAGGCGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTGTGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTCAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGTACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACACGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAATTCATCTCTACTCTATTTACAGCCGTTGCTAACAAACAGTGGGCAGTTAAGTGAAAAGGCCAAAGTTCTACAAGCAAGAAATTTAAATCAACTCAAGCGCTATCAAGAAGCGTTGGAAGTCGAAAACAG > 1/1485958‑1486445 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |