| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,486,146 | C→A | L25L (CTC→CTA) | unknown → | Flp pilus assembly protein TadD, contains TPR repeat |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,486,146 | 0 | C | A | 100.0% | 195.7 / NA | 74 | L25L (CTC→CTA) | unknown | Flp pilus assembly protein TadD, contains TPR repeat |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (41/33); total (41/33) | |||||||||||
ATTTATCATCAATTAATTCAACTATCGACTGATATTAGAGAAATTCAATTATTAGCTATAGAAGAAAAGCTTGGTACGCTGTCAGCAAAAATGAGTATCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTAGCTCCAGGCGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTGTGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTCAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGTACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACACGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAATTCATCTCTACTCTATTTACAGCCGTTGCTAACAAACAGTGGGCAGTTAAGTGAAAAGGCCAAAGTTCTACAAG > 1/1485900‑1486390 | aTTTATCATCAACTAGTTCAGCTATCGACTGATATTAGAGAAATTCAATTATTGGCTATAGAAGAAAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATa > 1:625426/1‑251 (MQ=255) tcatcaACTAGTTCAGCTATCGACTGATATTAGAGAAATTCAATTATTGGCTATAGAAGAAAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATaaaaaa > 1:255279/1‑251 (MQ=255) agttCAGCTATCGACTGATATTAGAGAAATTCAATTATTGGCTATAGAAGAAAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAAc > 1:696888/3‑243 (MQ=255) agttCAGCTATCGACTGATATTAGAGAAATTCAATTATTGGCTATAGAAGAAAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCACTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGAGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCGGTACTAAATAAAAAACCATTAAGt > 1:738981/3‑251 (MQ=255) gttCAGCTATCGACTGATATTAGAGAAATTCAATTATTGGCTATAGAAGAAAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTg > 1:138701/2‑251 (MQ=255) cGACTGATATTAGAGAAATTCAATTATTGGCTATAGAAGAAAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAAtt < 1:567204/251‑1 (MQ=255) cGACTGATATTAGAGAAATTCAATTATTGGCTATAGAAGAAAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAAtt > 1:250624/1‑251 (MQ=255) aTTCAATTATTGGCTATAGAAGAAAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCa > 1:484612/1‑250 (MQ=255) cAATTATTGGCTATAGAAGAAAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACttt > 1:9263/1‑251 (MQ=255) taGAAGAAAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGGGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTaa < 1:855882/251‑1 (MQ=255) gaagaaAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAgctg < 1:269651/221‑1 (MQ=255) gaagaaAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCAc > 1:404035/1‑233 (MQ=255) gaagaaAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTaaca > 1:574929/1‑251 (MQ=255) acTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGAt > 1:250880/2‑251 (MQ=255) cTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATc < 1:170070/230‑1 (MQ=255) cggCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTAt < 1:763368/249‑1 (MQ=255) cggCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTAt < 1:257845/249‑1 (MQ=255) cccTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATc > 1:833460/1‑230 (MQ=255) cTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCag < 1:82055/201‑1 (MQ=255) aTTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAAt < 1:503693/250‑1 (MQ=255) cTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGt < 1:669373/157‑1 (MQ=255) atttattATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTAAATCACTa > 1:543240/1‑222 (MQ=255) atttattATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATATGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATc > 1:512030/1‑218 (MQ=255) attatGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATc < 1:233606/251‑1 (MQ=255) gTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGa < 1:657900/223‑1 (MQ=255) attTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAagaaga < 1:775313/231‑1 (MQ=255) cTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTcacgc < 1:237155/229‑3 (MQ=255) cAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCTGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTaaca > 1:757112/1‑163 (MQ=255) ggtgTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCAc > 1:149795/4‑143 (MQ=255) ggtgTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGt < 1:333570/182‑1 (MQ=255) gtgTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGt < 1:647849/182‑1 (MQ=255) gtgTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTAc < 1:895961/247‑1 (MQ=255) gggTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGa > 1:707157/1‑158 (MQ=255) gggTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGa > 1:75869/1‑251 (MQ=255) ttCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCGCGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTCATctcta > 1:449320/1‑250 (MQ=255) ttCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTc < 1:46744/243‑1 (MQ=255) ttCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTCATctcta > 1:779480/1‑250 (MQ=255) cTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTCATctctactc < 1:26574/251‑1 (MQ=255) ctTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTCATCTCTACTCTACTTACa > 1:145183/1‑251 (MQ=255) gTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTaaca < 1:252357/115‑1 (MQ=255) gTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTCATCTCTACTCTACTTACAGc > 1:112687/1‑244 (MQ=255) cTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAg < 1:22221/65‑1 (MQ=255) cTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGa > 1:6432/1‑143 (MQ=255) cTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTAc > 1:771240/1‑201 (MQ=255) cTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTc < 1:505275/221‑1 (MQ=255) attatgCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAAt > 1:497263/5‑154 (MQ=255) attatgCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATaaa < 1:529295/177‑1 (MQ=255) attatgCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTCATCTCTACTCTACTTACAGc > 1:701171/5‑239 (MQ=255) attatgCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTCATCTCTACTCTACTTACAGCCGTTGCTaacaa > 1:100346/5‑251 (MQ=255) ggCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTCATctctactctac > 1:826923/1‑224 (MQ=255) cATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTCATCTCTACTCTACTTACAGCCGTTGCTAACAAACAGCGGGc < 1:245515/251‑1 (MQ=255) gATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTCATCTCTACTCTACTTACAGCCGTTGCTAACAAACAGCGGGCAGt > 1:887131/1‑251 (MQ=255) tCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATaaa > 1:212542/1‑167 (MQ=255) tCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTCATCTCTACTCTACTTACAGCCGTTGCTAACAAACAGCGGGCAGTTa > 1:620848/1‑251 (MQ=255) tCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTCATCTCTACTCTACTTACAGCCGTTGCTAACAAACAGCGGGCAGTTa > 1:385054/1‑251 (MQ=255) aTCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGa > 1:708315/1‑99 (MQ=255) cTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTCATCTCTACTCTACTTACAGCCGTTGCTAACAAACAGCGGGCAGTTAAGTGaa > 1:662157/1‑251 (MQ=255) cTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTCATCTCTACTCTACTTACAGCCGTTGCTAACAAACAGCGGGCAGTTAAGTGaa > 1:460884/1‑251 (MQ=255) gTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTCATCTCTACTCTACTTACAGCCGTTGCTAACAAACAGCGGGCAGTTAAGTGaaag > 1:700887/1‑250 (MQ=255) ttACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTCATCTCTACTCTACTTACAGCCGTTGCTAACAAACAGCGGGCAGTTAAGTGaaagg < 1:648776/251‑3 (MQ=255) aCTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTcacgcg < 1:8650/149‑4 (MQ=255) cTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGtt < 1:681127/97‑1 (MQ=255) aTGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGt > 1:686816/1‑109 (MQ=255) tGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTCATCTCTACTCTACTTACAGCCGTTGCTAACAAACAGCGGGCAGTTAAGTGAAAGGGCCaaaat < 1:791705/251‑3 (MQ=255) gTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGt < 1:624924/102‑1 (MQ=255) ctgctgTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGt < 1:64051/99‑1 (MQ=255) ctgctgTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATg > 1:166120/1‑108 (MQ=255) ctgctgTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTcacgc < 1:552512/138‑3 (MQ=255) gctgTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAAt > 1:57038/1‑117 (MQ=255) gctgTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAAATATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTCATCTCTACTCTACTTACAGCCGTTGCTAACAAACAGCGGGCAGTTAAGTGa < 1:346068/233‑1 (MQ=255) gTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATaaa < 1:132451/141‑1 (MQ=255) gTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAAt < 1:358929/142‑1 (MQ=255) gTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTCATCTCTACTCTACTTACAGCCGTTGCTAACAAACAGCGGGCAGTTAAGTGa > 1:267253/1‑230 (MQ=255) gTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTCATCTCTACTCTACTTACAGCCGTTGCTAACAAACAGCGGGCAGTTAAGTGAAAGGGCCAAAATTCTAcaag > 1:900333/1‑250 (MQ=255) | ATTTATCATCAATTAATTCAACTATCGACTGATATTAGAGAAATTCAATTATTAGCTATAGAAGAAAAGCTTGGTACGCTGTCAGCAAAAATGAGTATCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTAGCTCCAGGCGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTGTGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTCAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGTACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACACGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAATTCATCTCTACTCTATTTACAGCCGTTGCTAACAAACAGTGGGCAGTTAAGTGAAAAGGCCAAAGTTCTACAAG > 1/1485900‑1486390 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |