| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,486,104 | G→A | L11L (TTG→TTA) | unknown → | Flp pilus assembly protein TadD, contains TPR repeat |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,486,104 | 0 | G | A | 100.0% | 159.5 / NA | 60 | L11L (TTG→TTA) | unknown | Flp pilus assembly protein TadD, contains TPR repeat |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (34/26); total (34/26) | |||||||||||
GTAATGCAGCAAAGTCTGAATTTTGGTTCCTCTATTTATCATCAATTAATTCAACTATCGACTGATATTAGAGAAATTCAATTATTAGCTATAGAAGAAAAGCTTGGTACGCTGTCAGCAAAAATGAGTATCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTAGCTCCAGGCGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTGTGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTCAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGTACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACACGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAATTCATCTCTACTCTATTTACAGC > 1/1485867‑1486339 | gTAATGCAACAAAGCCTTAATTTTGGTTCCTCTATTTATCATCAACTAGTTCAGCTATCGACTGATATTAGAGAAATTCAATTATTGGCTATAGAAGAAAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGAt > 1:878934/1‑249 (MQ=255)gTAATGCAACAAAGCCTTAATTTTGGTTCCTCTATTTATCATCAACTAGTTCAGCTATCGACTGATATTAGAGAAATTCAATTATTGGCTATAGAAGAAAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGAt > 1:742358/1‑249 (MQ=255) tGCAACAAAGCCTTAATTTTGGTTCCTCTATTTATCATCAACTAGTTCAGCTATCGACTGATATTAGAGAAATTCAATTATTGGCTATAGAAGAAAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATc < 1:72845/251‑1 (MQ=255) ttttGGTTCCTCTATTTATCATCAACTAGTTCAGCTATCGACTGATATTAGAGAAATTCAATTATTGGCTATAGAAGAAAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGtt > 1:591410/1‑249 (MQ=255) ctctATTTATCATCAACTAGTTCAGCTATCGACTGATATTAGAGAAATTCAATTATTGGCTATAGAAGAAAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGc > 1:621527/1‑212 (MQ=255) aTTTATCATCAACTAGTTCAGCTATCGACTGATATTAGAGAAATTCAATTATTGGCTATAGAAGAAAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACta > 1:235578/1‑246 (MQ=255) aTTTATCATCAACTAGTTCAGCTATCGACTGATATTAGAGAAATTCAATTATTGGCTATAGAAGAAAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATa > 1:625426/1‑251 (MQ=255) tcatcaACTAGTTCAGCTATCGACTGATATTAGAGAAATTCAATTATTGGCTATAGAAGAAAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCt > 1:79154/1‑218 (MQ=255) tcatcaACTAGTTCAGCTATCGACTGATATTAGAGAAATTCAATTATTGGCTATAGAAGAAAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATaaaaaa > 1:255279/1‑251 (MQ=255) agttCAGCTATCGACTGATATTAGAGAAATTCAATTATTGGCTATAGAAGAAAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAAc > 1:696888/3‑243 (MQ=255) agttCAGCTATCGACTGATATTAGAGAAATTCAATTATTGGCTATAGAAGAAAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCACTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGAGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCGGTACTAAATAAAAAACCATTAAGt > 1:738981/3‑251 (MQ=255) gttCAGCTATCGACTGATATTAGAGAAATTCAATTATTGGCTATAGAAGAAAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTg > 1:138701/2‑251 (MQ=255) cGACTGATATTAGAGAAATTCAATTATTGGCTATAGAAGAAAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAAtt > 1:250624/1‑251 (MQ=255) cGACTGATATTAGAGAAATTCAATTATTGGCTATAGAAGAAAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAAtt < 1:567204/251‑1 (MQ=255) atatTAGAGAAATTCAATTATTGGCTATAGAAGAAAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATg < 1:325333/203‑1 (MQ=255) atatTAGAGAAATTCAATTATTGGCTATAGAAGAAAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGCGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCt > 1:890744/1‑187 (MQ=255) aTTCAATTATTGGCTATAGAAGAAAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCa > 1:484612/1‑250 (MQ=255) cAATTATTGGCTATAGAAGAAAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACttt > 1:9263/1‑251 (MQ=255) ggCTATAGAAGAAAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACta < 1:486632/193‑2 (MQ=255) taGAAGAAAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGGGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTaa < 1:855882/251‑1 (MQ=255) gaagaaAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAgctg < 1:269651/221‑1 (MQ=255) gaagaaAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCAc > 1:404035/1‑233 (MQ=255) gaagaaAAACTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTaaca > 1:574929/1‑251 (MQ=255) acTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGAt > 1:250880/2‑251 (MQ=255) cTTGGTACACTGTCGGCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATc < 1:170070/230‑1 (MQ=255) gtcggCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGc > 1:704456/5‑128 (MQ=255) cggCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTAt < 1:763368/249‑1 (MQ=255) cggCAAAAATGAGTGTCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTAt < 1:257845/249‑1 (MQ=255) cccTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATc > 1:833460/1‑230 (MQ=255) cTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCag < 1:82055/201‑1 (MQ=255) aTTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAAt < 1:503693/250‑1 (MQ=255) cTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGt < 1:669373/157‑1 (MQ=255) atttattATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTAAATCACTa > 1:543240/1‑222 (MQ=255) atttattATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATATGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATc > 1:512030/1‑218 (MQ=255) attatGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATc < 1:233606/251‑1 (MQ=255) gTTTCCAATTATTATTTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGa < 1:657900/223‑1 (MQ=255) ttattattTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATc > 1:676778/1‑95 (MQ=255) attTTAATTCTGGCTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAagaaga < 1:775313/231‑1 (MQ=255) cTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTctgc < 1:674605/95‑1 (MQ=255) cTCCAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTcacgc < 1:237155/229‑3 (MQ=255) cAGGTGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCTGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTaaca > 1:757112/1‑163 (MQ=255) ggtgTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTg > 1:485407/4‑74 (MQ=255) ggtgTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCAc > 1:149795/4‑143 (MQ=255) ggtgTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGt < 1:333570/182‑1 (MQ=255) gtgTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGt < 1:647849/182‑1 (MQ=255) gtgTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTAc < 1:895961/247‑1 (MQ=255) gggTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGa > 1:707157/1‑158 (MQ=255) gggTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGa > 1:75869/1‑251 (MQ=255) ttCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCGCGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTCATctcta > 1:449320/1‑250 (MQ=255) ttCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTc < 1:46744/243‑1 (MQ=255) ttCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTCATctcta > 1:779480/1‑250 (MQ=255) cTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTCATctctactc < 1:26574/251‑1 (MQ=255) tctTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTctgctg < 1:467815/56‑1 (MQ=255) ctTAAAAATGTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTCATCTCTACTCTACTTACa > 1:145183/1‑251 (MQ=255) gTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTaaca < 1:252357/115‑1 (MQ=255) gTTCTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTCATCTCTACTCTACTTACAGc > 1:112687/1‑244 (MQ=255) cTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAg < 1:22221/65‑1 (MQ=255) cTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGa > 1:6432/1‑143 (MQ=255) cTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTAc > 1:771240/1‑201 (MQ=255) cTATTATGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTAAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGCACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACGCGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAGTTc < 1:505275/221‑1 (MQ=255) | GTAATGCAGCAAAGTCTGAATTTTGGTTCCTCTATTTATCATCAATTAATTCAACTATCGACTGATATTAGAGAAATTCAATTATTAGCTATAGAAGAAAAGCTTGGTACGCTGTCAGCAAAAATGAGTATCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTAGCTCCAGGCGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTGTGCGGCATGATCTTATCTGTTACTGCATGTTCTGCTGTACTCAATAAAAAACCATTAAGTGCTGATAAATTAGCTGCTAAAGAAGCACTTTATCAGAGTACTAACAACAACGATGCGTTAATCACTATGTATCGTGATGGACTTAAAAATAAAGAAGATCCTCTCACACGTTATAAATTATCTGAAATTTATTACAAGAAAGGGGACAGTAATTCATCTCTACTCTATTTACAGC > 1/1485867‑1486339 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |