| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 1,485,881 | T→C | S222S (AGT→AGC) | unknown → | Type II/IV secretion system protein TadC, associated with Flp pilus assembly |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,485,881 | 0 | T | C | 100.0% | 182.8 / NA | 64 | S222S (AGT→AGC) | unknown | Type II/IV secretion system protein TadC, associated with Flp pilus assembly |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (39/25); total (39/25) | |||||||||||
ATTGATTTAGTAGCTGTTAATGTACAAACAGGGATAAGTATTGAGGCCGCACTAAAACAGGTTGCAACTGACTTTAAAACATTAAATCCTGATCTAACTTATGTTATGTTACGTATTATTCGTAAATCTGAAATTACTGGTATGTCACAAGCATTACAGGATCTCTCTGTGTCTTTACCAACAACGGAAATCAGGATGTTTTGCACTGTAATGCAGCAAAGTCTGAATTTTGGTTCCTCTATTTATCATCAATTAATTCAACTATCGACTGATATTAGAGAAATTCAATTATTAGCTATAGAAGAAAAGCTTGGTACGCTGTCAGCAAAAATGAGTATCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTAGCTCCAGGCGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTGTGCGGCATGATCTTATC > 1/1485660‑1486121 | aTTGATTTAGTAGCTGTTAATTTACAAACGGGAATGGGTATTGAAGCTGCGCTAAAGCACGTTGCAACTGACTTTAAAATATTAAACCCTGATCTGACTTATGTTATGTTACGTATTATTCGTAAATCCGAGATTACCGGTATGTCGCAGGCATTGCAGGATCTCTCTGTGTCTTTACCAACAGCAGAAATCCGAATGTTTTGTACTGTAATGCAACAAAGCCTTAATTTTGGTTCCTCTATTTAtcatca > 1:699177/1‑251 (MQ=255) 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ATTGATTTAGTAGCTGTTAATGTACAAACAGGGATAAGTATTGAGGCCGCACTAAAACAGGTTGCAACTGACTTTAAAACATTAAATCCTGATCTAACTTATGTTATGTTACGTATTATTCGTAAATCTGAAATTACTGGTATGTCACAAGCATTACAGGATCTCTCTGTGTCTTTACCAACAACGGAAATCAGGATGTTTTGCACTGTAATGCAGCAAAGTCTGAATTTTGGTTCCTCTATTTATCATCAATTAATTCAACTATCGACTGATATTAGAGAAATTCAATTATTAGCTATAGAAGAAAAGCTTGGTACGCTGTCAGCAAAAATGAGTATCCCTTTGATTCTATTTATTATGTTTCCAATTATTATTTTAATTCTAGCTCCAGGCGTAATGAGGGTATTTCCACATGTATTCTAAATCTCTTAAAAATGTTCTATTGTGCGGCATGATCTTATC > 1/1485660‑1486121 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |