| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 1,483,825 | A→G | E258E (GAA→GAG) | unknown → | Type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF, TadA subfamily |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,483,825 | 0 | A | G | 100.0% | 225.9 / NA | 81 | E258E (GAA→GAG) | unknown | Type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF, TadA subfamily |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (36/45); total (36/45) | |||||||||||
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accTCATGTTGTACGCCTTGAAACACGTTTAGCCGGCGTTGAGCATACAGGCGAGGTTACTATGCAGGATTTAGTAATAAATGCACTACGTATGCGTCCTGAGCGTATTATCGTAGGTGAATGCCGTGGTGGAGAAGCATTCCAGATGTTACAAGCGATGAACACTGGTCACGATGGTTc < 1:655922/179‑1 (MQ=255) accTCATGTTGTACGCCTTGAAACACGTTTAGCCGGCGTTGAGCATACAGGCGAGGTTACTATGCAGGATTTAGTAATAAATGCACTACGTATGCGTCCTGAGCGTATTATCGTAGGTGAATGCCGTGGTGGAGAAGCATTCCAGATGTTACAAGCGATGAACACTGGTCACGATGGTTCTATGTCAACGTTGCACGCAAATACCCCTCGGGATGCAACAtctc < 1:28837/223‑1 (MQ=255) accTCATGTTGTACGCCTTGAAACACGTTTAGCCGGCGTTGAGCATACAGGCGAGGTTACTATGCAGGATTTAGTAATAAATGCACTACGTATGCGTCCTGAGCGTATTATCGTAGGTGAATGCCGTGGTGGAGAAGCATTCCAGATGTTACAAGCGATGAACACTGGTCACGATGGTTCTATGTCAACGTTGCACGCAAATACCCCTCGGGATGCAACATCTCGATTGGAGAGTATGGTTATGATGTCg < 1:475616/249‑1 (MQ=255) accTCATGTTGTACGCCTTGAAACACGTTTAGCCGGCGTTGAGCATACAGGCGAGGTTACTATGCAGGATTTAGTAATAAATGCACTACGTATGCGTCCTGAGCGTATTATCGTAGGTGAATGCCGTGGTGGAGAAGCATTCCAGATGTTACAAGCGATGAACACTGGTCACGATGGTTCTATGTCAACGTTGCACGCAAATACCCCTCGGGATGCAACATCTCGATTGGAGAGTATGGTTATGATGTCGa > 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |