| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 1,483,771 | G→A | Q240Q (CAG→CAA) | unknown → | Type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF, TadA subfamily |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,483,771 | 0 | G | A | 100.0% | 215.5 / NA | 80 | Q240Q (CAG→CAA) | unknown | Type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF, TadA subfamily |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (35/45); total (35/45) | |||||||||||
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catcaCATTAGAAGATACTGCTGAATTGCGTTTGGAACAACCTCATGTTGTACGCCTTGAAACACGTTTAGCCGGCGTTGAGCATACAGGCGAGGTTACTATGCAGGATTTAGTAATAAATGCACTACGTATGCGTCCTGAGCGTATTATCGTAGGTGAATGCCGTGGTGGAGAAGCATTCCAGATGTTACAAGCGATGAACACTGGTCACGATGGTTCTATGTCAACGTTGCACGCAAATACCCCTcggg < 1:298321/251‑3 (MQ=255) atcaCATTAGAAGATACTGCTGAATTGCGTTTGGAACAACCTCATGTTGTACGCCTTGAAACACGTTTAGCCGGCGTTGAGCATACAGGCGAGGTTACTATGCAGGATTTAGTAATAAATGCACTACGTATGCGTCCTGAGCGTATTATCGTAGGTGAATGCCGTGGTGGAGAAGCATTCCAGATGTTACAAGCGATGAACACTGGTCACGATGGTTCTATGTCAACGTTGCACGCAAATACCCCTcggga < 1:847545/251‑4 (MQ=255) cattAGAAGATACTGCTGAATTGCGTTTGGAACAACCTCATGTTGTACGCCTTGAAACACGTTTAGCCGGCGTTGAGCATACAGGCGAGGTTACTATGCaggat > 1:835886/4‑100 (MQ=255) cattAGAAGATACTGCTGAATTGCGTTTGGAACAACCTCATGTTGTACGCCTTGAAACACGTTTAGCCGGCGTTGAGCATACAGGCGAGGTTACTATGCAGGATTTAGTAATAAATGCACTACGTATGCGTCCTGAGCGTATTATCGTAGGTGAATGCCGTGGTGGAGAAGCATTCCAGATGTTACAAGCGATGAACACTGGTCACGATGGTTCTATGTCAACGTTGCACGCAAATACCCCTcggg > 1:664584/4‑244 (MQ=255) cattAGAAGATACTGCTGAATTGCGTTTGGAACAACCTCATGTTGTACGCCTTGAAACACGTTTAGCCGGCGTTGAGCATACAGGCGAGGTTACTATGCAGGATTTAGTAATAAATGCACTACGTATGCGTCCTGAGCGTATTATCGTAGGTGAATGCCGTGGTGGAGAAGCATTCCAGATGTTACAAGCGATGAACACTGGTCACGATGGTTCTATGTCAACGTTGCACGCAAATACCCCTCGGGATGCa > 1:846900/4‑251 (MQ=255) ttAGAAGATACTGCTGAATTGCGTTTGGAACAACCTCATGTTGTACGCCTTGAAACACGTTTAGCCGGCGTTGAGCATATAGGCGAGGTTACTATGCAGGATTTAGTAATAAATGCACTACGTATGCGTCCTGAGCGTATTATCGTAGGTGAATGCCGTGGTGGAGAAGCATTCCAGATGTTACAAGCGATGAACACTGGTCACGATGGTTCTATGTCAACGTTGCACGCAAATACCCCTCGGGATGCa < 1:426233/248‑1 (MQ=255) agaTACTGCTGAATTGCGTTTGGAACAACCTCATGTTGTACGCCTTGAAACACGTTTAGCCGGCGTTGAGCATACAGGCGAGGTTACTATGCAGGATTTAGTAATAAATGCACTACGTATGCGTCCTGAGCGTATTATCGTAGGTGAATGCCGTGGTGGAGAAGCATTCCAGATGTTACAAGCGATGAACACTGGTCACGATGGTTCTATGt > 1:354185/1‑212 (MQ=255) ctgctgaattGCGTTTGGAACAACCTCATGTTGTACGCCTTGAAACACGTTTAGCCGGCGTTGAGCATACAGGCGAGGTTACTATGCAGGATTTAGTAATAAATGCACTACGTATGCGTCCTGAGCGTATTATCGTAGGTGAATGCCGTGGTGGAGAAGCATTCCAGATGTTACAAGCGATGaacact < 1:718168/179‑5 (MQ=255) ctgctgaattGCGTTTGGAACAACCTCATGTTGTACGCCTTGAAACACGTTTAGCCGGCGTTGAGCATACAGGCGAGGTTACTATGCAGGATTTAGTAATAAATGCACTACGTATGCGTCCTGAGCGTATTATCGTAGGTGAATGCCGTGGTGGAGAAGCATTCCAGATGTTACAAGCGATGaacac > 1:258161/10‑184 (MQ=255) ctgctgaattGCGTTTGGAACAACCTCATGTTGTACGCCTTGAAACACGTTTAGCCGGCGTTGAGCATACAGGCGAGGTTACTATGCAGGATTTAGTAATAAATGCACTACGTATGCGTCCTGAGCGTATTATCGTAGGTGAATGCCGTGGTGGAGAAGCATTCCAGATGTTACAAGCGATGAACACTGGTCACGATGGTTCTATGTCAACGTTGCACGCAAATaccc < 1:113111/219‑4 (MQ=255) ctgctgaattGCGTTTGGAACAACCTCATGTTGTACGCCTTGAAACACGTTTAGCCGGCGTTGAGCATACAGGCGAGGTTACTATGCAGGATTTAGTAATAAATGCACTACGTATGCGTCCTGAGCGTATTATCGTAGGTGAATGCCGTGGTGGAGAAGCATTCCAGATGTTACAAGCGATGAACACTGGTCACGATGGTTCTATGTCAACGTTGCACGCAAATACCCCTCGGGATGCAACATCTCGATTg > 1:829310/10‑251 (MQ=255) 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TCCATTTCTATTCGTAAATTCAGTAAGAATAAAAAAACATTGCAAGAGCTTGTAAATTTTGGTTCTATGACTCGCGAAATGGCGAATTTCTTAATTATTGCTGCCAGATCCCGGGTAAATATAATTGTGTCAGGTGGTACAGGATCTGGTAAAACAACCTTACTTAATGCGCTATCTAACTATATTTCCCATACCGAACGTGTCATCACACTAGAAGATACTGCCGAGCTGCGTTTGGAACAGCCTCATGTTGTACGCCTGGAAACGCGTTTAGCCGGCGTTGAGCATACAGGCGAAGTTACTATGCAAGACTTAGTAATAAATGCATTGCGTATGCGTCCTGAGCGTATTATTGTGGGCGAATGCCGTGGTGGAGAAGCATTCCAAATGTTACAAGCAATGAATACCGGTCACGATGGTTCTATGTCAACGTTGCACGCAAATAGCCCTCGCGATGCAACATCTCGCTTGGAAAGTATGGTTA > 1/1483529‑1484012 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |