| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 1,483,330 | C→T | D93D (GAC→GAT) | unknown → | Type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF, TadA subfamily |
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| * | 1 | 1,483,330 | 0 | C | T | 100.0% | 178.1 / NA | 65 | D93D (GAC→GAT) | unknown | Type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF, TadA subfamily |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (30/35); total (30/35) | |||||||||||
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GTACTAAGTAATCTTGATATTGAAAAGATTGATGAACTTCAAAGTGAAAGAAGCTCACTGGTAAACGAACTGGTTCAGATTGTTAACCGTGTTGCCAATAAAAGCGGTGCTTATTTGACCTCAGCCGATACTCTAGTTATGGCTGAAATTGTTGCTGATGAGATTGAGGGTTATGGACCATTACGAGATCTCATGGCTGACGATACTATAAATGATATTTTAGTTAATGGCCCTAATGACATCTGGGTTGAACGTGCTGGTATTCTGGAAAAAACTGATAAAGAATTTGTTAGTAATGAACAATTAACTGATATTGCAAAAAGGTTAGTTGCTCGGGTTGGTCGCCGTATTGATGATGGTAGTCCACTAGTGGACTCCCGACTACCTGATGGCAGCCGTTTAAATGTTGTTATTGCACCGATTGCATTAGATGGCACATCCATTTCTATTCGTAAATTCAGTAAGAATAAAAAAACATTGCAAG > 1/1483091‑1483574 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |