| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 1,482,363 | A→G | K150K (AAA→AAG) | unknown → | Type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE, associated with Flp pilus assembly |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,482,363 | 0 | A | G | 100.0% | 221.6 / NA | 78 | K150K (AAA→AAG) | unknown | Type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE, associated with Flp pilus assembly |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (35/43); total (35/43) | |||||||||||
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aaGAGATACTGTTAAAATTGCTGTATTAAGTTGTAAGGGCGGTATTGGCGCAAGTTTAAtt > 1:837882/1‑61 (MQ=255) gagaTACTGTTAAAATTGCTGTATTAAGTTGTAAGGGCGGTATTGGCGCAAGTTTAATTAGTTCACATATTGCTAATGAGATTGTATCAAGTAAAAAAATTCCGGTGCTATTAGCCCAAGGTCCTAATGGTTCCCAggatttagat > 1:712244/1‑146 (MQ=255) aTACTGTTAAAATTGCTGTATTAAGTTGTAAGGGCGGTATTGGCGCAAGTTTAATTAGTTCACATATTGCTAATGAGATTGTATCAAGTAAAAAAATTCCGGTGCTATTAGCCCAAGGTCCTAATGGTTCCCAGGATTTAGATTTATTATTTGATAAAAAGCTATCAGGTAATGTTATTGAATATGCTCCTAATTTAGATATATTTAACGGGAGCTTATTTGAGCTAACACCCGCAGCGACTGAAAAATAc < 1:407631/251‑1 (MQ=255) cTGTTAAAATTGCTGTATTAAGTTGTAAGGGCGGTATTGGCGCAAGTTTAATTAGTTCACATATTGCTAATGAGATTGTATCAAGTAAAAAAATTCCGGTGCTATTAGCCCAAGGTCCTAATGGTTCCCAGGATTTAGATTTATTATTTGATAAAAAGCTATCAGGTAATg < 1:543163/171‑1 (MQ=255) ttGCTGTATTAAGTTGTAAGGGCGGTATTGGCGCAAGTTTAATTAGTTCACATATTGCTAATGAGATTGTATCAAGTAAAAAAATTCCGGTGCTATTAGCCCAAGGTCCTAATGGTTCCCAGGATTTAGATTTATTATTTGATAAAAAGCTATCAGGTAATGTTATTGAATATGCTCCTAATTTAGATATATTTAACGGGAGCTTATTTGAGCt > 1:347677/1‑214 (MQ=255) gTATTAAGTTGTAAGGGCGGTATTGGCGCAAGTTTAATTAGTTCACATATTGCTAATGAGATTGTATCAAGTAAAAAAATTCCGGTGCTATTAGCCCAAGGTCCTAATGGTTCCCAGGATTTAGATttatta < 1:694739/132‑1 (MQ=255) gTATTAAGTTGTAAGGGCGGTATTGGCGCAAGTTTAATTAGTTCACATATTGCTAATGAGATTGTATCAAGTAAAAAAATTCCGGTGCTATTAGCCCAAGGTCCTAATGGTTCCCAGGATTTAGATTTATTATTTGATAAAAAGCTATCAGGTAATGTTATTg < 1:428216/163‑1 (MQ=255) gTATTAAGTTGTAAGGGCGGTATTGGCGCAAGTTTAATTAGTTCACATATTGCTAATGAGATTGTATCAAGTAAAAAAATTCCGGTGCTATTAGCCCAAGGTCCTAATGGTTCCCAGGATTTAGATTTATTATTTGATAAAAAGCTATCAGGTAATGTTATTGAATATGCTCCTAATTTAGATATATTTAACGGGAgcttatt > 1:269380/1‑197 (MQ=255) gTATTAAGTTGTAAGGGCGGTATTGGCGCAAGTTTAATTAGTTCACATATTGCTAATGAGATTGTATCAAGTAAAAAAATTCCGGTGCTATTAGCCCAAGGTCCTAATGGTTCCCAGGATTTAGATTTATTATTTGATAAAAAGCTATCAGGTAATGTTATTGAATATGCTCCTAATTTAGATATATTTAACGGGAGCTTATTTGAGc < 1:748852/208‑1 (MQ=255) aTTAAGTTGTAAGGGCGGTATTGGCGCAAGTTTAATTAGTTCACATATTGCTAATGAGATTGTATCAAGTAAAAAAATTCCGGTGCTATTAGCCCAAGGTCCTAATgg < 1:394036/108‑1 (MQ=255) aaGTTGTAAGGGCGGTATTGGCGCAAGTTTAATTAGTTCACATATTGCTAATGAGATTGTATCAAGTAAAAAAATTCCGGTGCTATTAGCCCAAGGTCCTAATGGTTCCCAGGATTTAGATTTATTATTTGATAAAAAGc < 1:247404/140‑1 (MQ=255) gTTGTAAGGGCGGTATTGGCGCAAGTTTAATTAGTTCACATATTGCTAATGAGATTGTATCAAGTAAAAAAATTCCGGTGCTATTAGCCCAAGGTCCTAATGGTTCCCAGGATTTAGATTTATTATTTGATAAAAAGCTATCAGGTAATGTTATTGAATATGCTCCTAATTTAGATATATTTAACGGGAGCTTATTTGAGCTAACACCCGCAGCGACTGAAAAATACAATTTTATTATCTACGATCAAc > 1:252111/1‑249 (MQ=255) | CATGAGACTAACATAAAGACTATTGTCGAACGAGTTTTTAGTATAGTACCACAAAATGTATGGTGTTGTGTTATCGGTGATAGTGACTCCATCTCTTTATCACAAAAACTACTAGATGAGGGCATCCTTTACTTTAATTCGCATACTCAGTTAAGTCAGATGGTTGAGAAAATCATTTTAGGTGCTGATATCCCTCGCTTAAGAGATACTGTTAAAATTGCTGTATTAAGTTGTAAAGGTGGTATTGGCGCAAGTTTAATTAGTTCACATATTGCTAATGAGATTGTGTCAAGTAAAAAAATTCCAGTGCTATTAGCCCAAGGCCCTAATGGTTCTCAAGATTTAGATTTATTATTTGATAAAAAGCTATCAGGTAATGTTATTGAATATACTCCGAATTTAGACATATTTAACGGGAGTCTATTTGAGCTAACACCTGCGGCGACTGAAAAATACAATTTTATTATCTACGATCAAC > 1/1482127‑1482604 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |