| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 1,482,311 | C→T | A133V (GCT→GTT) | unknown → | Type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE, associated with Flp pilus assembly |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,482,311 | 0 | C | T | 100.0% | 275.7 / NA | 101 | A133V (GCT→GTT) | unknown | Type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE, associated with Flp pilus assembly |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (46/55); total (46/55) | |||||||||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |