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| * | 1 | 1,481,027 | 0 | A | G | 98.8% | 227.8 / ‑5.5 | 85 | I338V (ATC→GTC) | unknown | Type II/IV secretion system secretin RcpA/CpaC, associated with Flp pilus assembly |
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> 1:795596/1‑251 (MQ=255) ccTTAGATCAATCAGTAAGCACCATAGCTGGTAACTATAACTTTGAGGGAG‑TCGGGAATATTCCGTTCTTTAATACCCGTAAAGCAAAGTCTTTATTTGAAGTAGCTAACGGAGAAAGTTTTATTATCGGTGGCTTATTCAGCTCAAATGACCTTGAAGGTATAAACAAAGTTCCTCTTTTAGGAGACATCCCAATTTTAGGTTCTTTCTTCCGTAATGCAACAACTGAGCGCGATAAAAAAGagttagtt < 1:709211/251‑1 (MQ=255) aGATCAATCAGTAAGCACCATAGCTGGTAACTATAACTTTGAGGGAG‑TCGGGAATATTCCGTTCTTTAATACCCGTAAAGCAAAGTCTTTATTTGAAGTAGCTAACGGAGAAAGTTTTATTATCGGTGGCTTATTCAGCTCAAATGACCTTGAAGGTATAAACAAAGTTCCTCTTTTAGGAGACATCCCAATTTTAGGTTCTTTCTTCCGTAATGCAACAACTGAGCGCGATAAAAAAGAGTTAGTTATCg > 1:873763/1‑251 (MQ=255) gATCAATCAGTAAGCACCATAGCTGGTAACTATAACTTTGAGGGAG‑TCGGGAATATTCCGTTCTTTAATACCCGTAAAGCAAAGTCTTTATTTGAAGTAGCTAACGGAGAAAGTTTTATTATCGGTGGCTTATTCAGCTCAAATGACCTTGAAGGTATAAAc > 1:374747/1‑162 (MQ=255) aatcAGTAAGCACCATAGCTGGTAACTATAACTTTGAGGGAG‑TCGGGAATATTCCGTTCTTTAATACCCGTAAAGCAAAGTCTTTATTTGAAGTAGCTAACGGAGAAAGTTTTATTATCGGTGGCTTATTCAGCTCAAATg > 1:843870/4‑141 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |