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caaTTATATATAAGGAGTTTGGGATAAAGCTCGCTGTTGCTGCCAAATTGCAAAAAAATAATCGTATTCGTTTAGCCTTAGATCAATCAGTAAGCACCATAGCTGGTAACTATAACTTTGAGGGAG‑TCGGGAATATTCCGTTCTTTAATACCCGTAAAGCAAAGTCTTTGTTTGAAGTAGCTAACGGAGAAAGTTTTATTATCGGTGGCTTATTCAGCTCAAATGACCTTGAAGGTATAAACAAAGTTc > 1:426553/1‑249 (MQ=255) caaTTATATATAAGGAGTTTGGGATAAAGCTCGCTGTTGCTGCCAAATTGCAAAAAAATAATCGTATTCGTTTAGCCTTAGATCAATCAGTAAGCACCATAGCTGGTAACTATAACTTTGAGGGAG‑TCGGGAATATTCCGTTCTTTAATACCCGTAAAGCAAAGTCTTTATTTGAAGTAGCTAACGGAGAAAGTTTTATTATCGGTGGCTTATTCAGCTCAAATGACCTTGAAGGTATAAAc > 1:674654/1‑242 (MQ=255) caaTTATATATAAGGAGTTTGGGATAAAGCTCGCTGTTGCTGCCAAATTGCAAAAAAATAATCGTATTCGTTTAGCCTTAGATCAATCAGTAAGCACCATAGCTGGTAACTATAACTTTGAGGGAG‑TCGGGAATATTCCGTTCTTTAATACCCGTAAAGCAAAGTCTTTATTTGAAGTAGCTAACGGAGAAAGTTTTATTATCGGTGGCTTATTCAGCTCAAATGACCTTGAAGGTATAAAc < 1:306676/242‑1 (MQ=255) caaTTATATATAAGGAGTTTGGGATAAAGCTCGCTGTTGCTGCCAAATTGCAAAAAAATAATCGTATTCGTTTAGCCTTAGATCAATCAGTAAGCACCATAGCTGGTAACTATAACTTTGAGGGAG‑TCGGGAATATTCCGTTCTTTAATACCCGTAAAGCAAAGTCTTTATTTGAAGTAGCTAACGGAGAAAGTTTTATTATCGGTGGCTTATTCAGCTCAAATGACCTTGAAGGTATAAACAAAGTTc > 1:24560/1‑249 (MQ=255) aTTATATATAAGGAGTTTGGGATAAAGCTCGCTGTTGCTGCCAAATTGCAAAAAAATAATCGTATTCGTTTAGCCTTAGAt > 1:464598/1‑81 (MQ=255) aTTATATATAAGGAGTTTGGGATAAAGCTCGCTGTTGCTGCCAAATTGCAAAAAAATAATCGTATTCGTTTAGCCTTAGATCAATCAGTAAGCACCATAGCTGGTAACTATAACTTTGAGGGAG‑TCGGGAATATTCCGTTCTTTAATACCCGTAAAGCAAAGTCTTTATTTGAAGTAGCTAACGGAGAAAGTTTTATTATCGGTGGCTTATTCAGCTCAAATGACCTTGAAGGTATAAACAAAGTTc > 1:836875/1‑247 (MQ=255) aTTATATATAAGGAGTTTGGGATAAAGCTCGCTGTTGCTGCCAAATTGCAAAAAAATAATCGTATTCGTTTAGCCTTAGATCAATCAGTAAGCACCATAGCTGGTAACTATAACTTTGAGGGAG‑TCGGGAATATTCCGTTCTTTAATACCCATAAAGCAAAGTCTTTATTTGAAGTAGCTAACGGAGAAAGTTttatta < 1:161047/199‑1 (MQ=255) | TTGCCGGTAGTGGTCCATTAGTCGGAGGTAACTTCGGTTTCGGAGGTGGATTCAATGGAAATCAAGGTGTATTACGTTTAGATGCGAAAGGTATTTCTGCCTTTATTAATGCTTTAGATAACCAAAGTAATGGTAAAGTTCTGGCCGAACCGAACATTTCTATGTTATCCGGTGAAACTGCCGATATCTTAGTGGGGGGAGAAATCCCATTTGCACAGCGGGATAGAGATGGTTCACCAACAATTATCTATAAGGAGTTTGGGATAAAACTCGCTGTTGCGGCTAAATTGCAAAAAAATAATCGTATTCGTTTAGCCTTAGATCAAACAGTAAGCACTATTGCAGGTAACTATAACTTTGATGGAA‑TCGGGAATATTCCGTTCTTTAATACCCGTAAAGCAAAATCTTTATTTGAGGTAGCTAACGGAGAAAGTTTTATTATCGGTGGCTTATTCAGCTCAAATGACCTTGAAGGTATAAACAAAGTTC > 1/1480662‑1481150 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |