| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,479,950 | C→T | A254V (GCC→GTC) | unknown → | Flp pilus assembly protein RcpC/CpaB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,479,950 | 0 | C | T | 100.0% | 207.7 / NA | 74 | A254V (GCC→GTC) | unknown | Flp pilus assembly protein RcpC/CpaB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (38/36); total (38/36) | |||||||||||
TTGCTTCAGATTCGCGCAACACTTATGATCGTAAAGATTTAGTTAAAATTTTAGGTAAAGTATTGGTTTTACAAGCAAGAAACTTTACTCAATCAACAGAACAAGGTGCTCCTGAAGCTGAAAAGGCAGCA‑GACGGGATTCCAAACAATCAAGAATATGCTGGTTATGTAGCACTAAAAATAACTGCTGAACAAGCAAAAAAATTCTATTCACTGGATAGAGAATCAAAGTTAGTTATATTACCTGCCGAAAATAATACTCAAGAAGTTGATTCACGCGGTGTATTCATCAGAAAATTAAGAGGTCAATAAGATGCAAAATTGGAATCATACTTTTGGCAAAAAACAATTAATATGCTGTGCAGTTCTCGGGGCAATGTTCTCATTAAATGCGTACGCACAAAATTTCTCTCTGGATAAAGGTGCAACCCAGTTGGTTCAAACAAAAGAAAAGATCGACACTATTTTCGTCTCTTCACCAAATATTGCCGAC > 1/1479704‑1480195 | ccgCTTCAGATTCCCGCAATACTTATGATCGTAAAGATTTAGTTAAAGTTTTAGGTAAGGCAGTGGTTCTACAAGCACGGAATTTTGCTCAAGTAGCAGAACAAG‑‑GC‑ACTGAAACTGAGAAAGCGTTAGGTCTGG‑CTCCAAATAGTGAAGTATATGCCGGTTATGTAGCATTAAAAATAACTGCTGAACAAGCTAAAAAATTCTATTCACTGGATAGAGAATCGAAGTTAGTCATATTACCTGTCGAAaat < 1:725284/249‑1 (MQ=255) 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catatTACCTGTCGAAAATAATACTCAAGAAGTTGATTCACGCGGTGTATTCATCAGAAAATTAAGAGGTCAATAAGATGCAAAATTGGAATCATACTTTTGGCAAAAAACAATTGATATGCTGTGCAGTTCTCGGAGCAATGTTCTCATTAAATGCGTACGCACAAAATTTCTCTCTGGATAAAGGTGCAACCCAGTTGGTTcaaaca < 1:835569/208‑1 (MQ=255) catatTACCTGTCGAAAATAATACTCAAGAAGTTGATTCACGCGGTGTATTCATCAGAAAATTAAGAGGTCAATAAGATGCAAAATTGGAATCATACTTTTGGCAAAAAACAATTGATATGCTGTGCAGTTCTCGGAGCAATGTTCTCATTAAATGCGTACGCACAAAATTTCTCTCTGGATAAAGGTGCAACCCAGTTGGTTCAAACAAAAGAAAAGATCGACACTATTTTCGTCTCTTCACCAAATAtt > 1:170415/2‑251 (MQ=255) ttACCTGTCGAAAATAATACTCAAGAAGTTGATTCACGCGGTGTATTCATCAGAAAATTAAGAGGTCAATAAGATGCAAAACTGGAATCATACTTTTGGCAAAAAACAATTGATATGCTGTGCAGTTCTCGGAGCAATGTTCTCATTAAATGCGTACGCACAAAATTTCTCTCTGGATAAAGGTGCAACCCAGTTGGTTCAAACAAAAGAAAAGATCGACACTATTTTCGTCTCTTCACCAAATATTGCCg < 1:436534/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |