| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,479,930 | A→G | S247S (TCA→TCG) | unknown → | Flp pilus assembly protein RcpC/CpaB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,479,930 | 0 | A | G | 100.0% | 194.7 / NA | 68 | S247S (TCA→TCG) | unknown | Flp pilus assembly protein RcpC/CpaB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (39/29); total (39/29) | |||||||||||
ATGTTGCTATCTATAGCCAACAAATTGCTTCAGATTCGCGCAACACTTATGATCGTAAAGATTTAGTTAAAATTTTAGGTAAAGTATTGGTTTTACAAGCAAGAAACTTTACTCAATCAACAGAACAAGGTGCTCCTGAAGCTGAAAAGGCAGCA‑GACGGGATTCCAAACAATCAAGAATATGCTGGTTATGTAGCACTAAAAATAACTGCTGAACAAGCAAAAAAATTCTATTCACTGGATAGAGAATCAAAGTTAGTTATATTACCTGCCGAAAATAATACTCAAGAAGTTGATTCACGCGGTGTATTCATCAGAAAATTAAGAGGTCAATAAGATGCAAAATTGGAATCATACTTTTGGCAAAAAACAATTAATATGCTGTGCAGTTCTCGGGGCAATGTTCTCATTAAATGCGTACGCACAAAATTTCTCTCTGGATAAAGGTGCAACCCAGTTGGTTCAAACAAAAGAAAAGATCGACACTATTTTCGTC > 1/1479680‑1480174 | atgtatctgtttataGCCAGCAAACCGCTTCAGATTCCCGCAATACTTATGATCGTAAAGATTTAGTTAAAGTTTTAGGTAAGGCAGTGGTTCTACAAGCACGGAATTTTGCTCAAGTAGCAGAACAAG‑‑GC‑ACTGAAACTGAGAAAGCGTTAGGTCTGG‑CTCCAAATAGTGAAGTATATGCCGGTTATGTAGCATTAAAAATAACTGCTGAACAAGCTAAAAAATTCTATTCACTGGATAGAGAATCGAag > 1:780671/12‑251 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gaATCGAAGTTAGTCATATTACCTGTCGAAAATAATACTCAAGAAGTTGATTCACGCGGTGTATTCATCAGAAAATTAAGAGGTCAATAAGATGCAAAATTGGAATCATACTTTTGGCAAAAAACAATTGATATGCTGTGCAGTTCTCGGAGCAATGTTCTCATTAAATg < 1:54644/170‑1 (MQ=255) gaATCGAAGTTAGTCATATTACCTGTCGAAAATAATACTCAAGAAGTTGATTCACGCGGTGTATTCATCAGAAAATTAAGAGGTCAATAAGATGCAAAATTGGAATCATACTTTTGGCAAAAAACAATTGATATGCTGTGCAGTTCTCGGAGCAATGTTCTCATTAAATGCGTACGCACAAAATTtctc < 1:539393/189‑1 (MQ=255) aaTCGAAGTTAGTCATATTACCTGTCGAAAATAATACTCAAGAAGTTGATTCACGCGGTGTATTCATCAGAAAATTAAGAGGTCAATAAGATGCAAAATTGGAATCATACTTTTGGCAAAAAACAATTGATATGCTGTGCAGTTCTCGGAGCAATGTTCTCATTAAATGCGTACGCACAAAATTTCTCTCTGGATAAAGGTGCAACCCAGTTGGTTCAAACAAAAGAAAAGATCGACACTATTTTCGtc < 1:555335/249‑1 (MQ=255) | ATGTTGCTATCTATAGCCAACAAATTGCTTCAGATTCGCGCAACACTTATGATCGTAAAGATTTAGTTAAAATTTTAGGTAAAGTATTGGTTTTACAAGCAAGAAACTTTACTCAATCAACAGAACAAGGTGCTCCTGAAGCTGAAAAGGCAGCA‑GACGGGATTCCAAACAATCAAGAATATGCTGGTTATGTAGCACTAAAAATAACTGCTGAACAAGCAAAAAAATTCTATTCACTGGATAGAGAATCAAAGTTAGTTATATTACCTGCCGAAAATAATACTCAAGAAGTTGATTCACGCGGTGTATTCATCAGAAAATTAAGAGGTCAATAAGATGCAAAATTGGAATCATACTTTTGGCAAAAAACAATTAATATGCTGTGCAGTTCTCGGGGCAATGTTCTCATTAAATGCGTACGCACAAAATTTCTCTCTGGATAAAGGTGCAACCCAGTTGGTTCAAACAAAAGAAAAGATCGACACTATTTTCGTC > 1/1479680‑1480174 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |