| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 228,985 | C→T | V51V (GTG→GTA) | unknown ← | DNA polymerase III beta subunit (EC 2.7.7.7) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 228,985 | 0 | C | T | 100.0% | 202.2 / NA | 74 | V51V (GTG→GTA) | unknown | DNA polymerase III beta subunit (EC 2.7.7.7) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (30/44); total (30/44) | |||||||||||
GGCTTGCTCAAGCGTAAAATCCACTTCCGATTGCCAGTCCGTTAAATTCGGATAATCTTCCACCGGCAAAGTGGATAAATTGAATTTACTGCGATCGGAACGCACAATAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCCACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACTTGTTGTAAGGGTTTTAGTAAATTTTCTCTGGAAATAATAAATTGCATCATATGACTCCTATACGGATAAAATTCGGATTAAGTTAGCCCAATCTTCTTGAATATTCGGATCGGTGTCGCGGAATCCTGCAATGGTGCGGCA > 1/228739‑229231 | ggCTTGCTCAAGCGTAAAATCCACTTCCGATTGCCAGTCCGTTAAATTCGGATAATCTTCCGCCGGCAAAGTGGATAAATTGAATTTACTGCGATCGGAACGCACAATAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACtt > 1:350123/1‑251 (MQ=255) gCTTGCTCAAGCGTAAAATCCACTTCCGATTGCCAGTCCGTTAAATTCGGATAATCTTCCGCCGGCAAAGTGGATAAATTGAATTTACTGCGATCGGAACGCACAATAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACtt < 1:865631/250‑1 (MQ=255) cTTGCTCAAGCGTAAAATCCACTTCCGATTGCCAGTCCGTTAAATTCGGATAATCTTCCGCCGGCAAAGTGGATAAATTGAATTTACTGCGATCGGAACGCACAATAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTc < 1:258171/250‑1 (MQ=255) cTTGCTCAAGCGTAAAATCCACTTCCGATTGCCAGTCCGTTAAATTCGGATAATCTTCCGCCGGCAAAGTGGATAAATTGAATTTACTGCGATCGGAACGCACAATAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTc < 1:40055/250‑1 (MQ=255) cTCAAGCGTAAAATCCACTTCCGATTGCCAGTCCGTTAAATTCGGATAATCTTCCGCCGGCAAAGTGGATAAATTGAATTTACTGCGATCGGAACGCACAATAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAAt > 1:83223/1‑251 (MQ=255) cTCAAGCGTAAAATCCACTTCCGATTGCCAGTCCGTTAAATTCGGATAATCTTCCGCCGGCAAAGTGGATAAATTGAATTTACTGCGATCGGAACGCACAATAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAAt < 1:517142/251‑1 (MQ=255) tCAAGCGTAAAATCCACTTCCGATTGCCAGTCCGTTAAATTCGGATAATCTTCCGCCGGCAAAGTGGATAAATTGAATTTACTGCGATCGGAACGCACAATAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATc < 1:693637/251‑1 (MQ=255) aGCGTAAAATCCACTTCCGATTGCCAGTCCGTTAAATTCGGATAATCTTCCGCCGGCAAAGTGGATAAATTGAATTTACTGCGATCGGAACGCACAATAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGt > 1:793028/1‑251 (MQ=255) cGTAAAATCCACTTCCGATTGCCAGTCCGTTAAATTCGGATAATCTTCCGCCGGCAAAGTGGATAAATTGAATTTACTGCGATCGGAACGCACAATAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACtt < 1:153706/239‑1 (MQ=255) cGTAAAATCCACTTCCGATTGCCAGTCCGTTAAATTCGGATAATCTTCCGCCGGCAAAGTGGATAAATTGAATTTACTGCGATCGGAACGCACAATAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTAc < 1:311256/251‑1 (MQ=255) aaaTCCACTTCCGATTGCCAGTCCGTTAAATTCGGATAATCTTCCGCCGGCAAAGTGGATAAATTGAATTTACTGCGATCGGAACGCACAATAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGt > 1:241532/1‑251 (MQ=255) aTCCACTTCCGATTGCCAGTCCGTTAAATTCGGATAATCTTCCGCCGGCAAAGTGGATAAATTGAATTTACTGCGATCGGAACGCACAATAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATc > 1:387371/1‑240 (MQ=255) aCTTCCGATTGCCAGTCCGTTAAATTCGGATAATCTTCCGCCGGCAAAGTGGATAAATTGAATTTACTGCGATCGGAACGCACAATAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATAtt < 1:97192/251‑1 (MQ=255) ccGATTGCCAGTCCGTTAAATTCGGATAATCTTCCGCCGGCAAAGTGGATAAATTGAATTTACTGCGATCGGAACGCACAATAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAata > 1:467148/1‑245 (MQ=255) aTTGCCAGTCCGTTAAATTCGGATAATCTTCCGCCGGCAAAGTGGATAAATTGAATTTACTGCGATCGGAACGCACAATAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTg < 1:146275/250‑1 (MQ=255) tAATCTTCCGCCGGCAAAGTGGATAAATTGAATTTACTGCGATCGGAACGCACAATAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATAc < 1:123075/251‑1 (MQ=255) aTCTTCCGCCGGCAAAGTGGATAAATTGAATTTACTGCGATCGGAACGCACAATAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACtt < 1:809819/197‑1 (MQ=255) aTCTTCCGCCGGCAAAGTGGATAAATTGAATTTACTGCGATCGGAACGCACAATAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTAc < 1:113477/209‑1 (MQ=255) aTCTTCCGCCGGCAAAGTGGATAAATTGAATTTACTGCGATCGGAACGCACAATAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAAt > 1:309184/1‑223 (MQ=255) ccgccGGCAAAGTGGATAAATTGAATTTACTGCGATCGGAACGCACAATAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTAttt < 1:642863/248‑1 (MQ=255) ccgccGGCAAAGTGGATAAATTGAATTTACTGCGATCGGAACGCACAATAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTAttt < 1:567031/248‑1 (MQ=255) gCAAAGTGGATAAATTGAATTTACTGCGATCGGAACGCACAATAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTCCCGGTAATATTTAATTGAGTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAacac < 1:650600/250‑1 (MQ=255) gTGGATAAATTGAATTTACTGCGATCGGAACGCACAATAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATAtt > 1:376216/1‑203 (MQ=255) gAATTTACTGCGATCGGAACGCACAATAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTc > 1:452071/1‑244 (MQ=255) aaTTTACTGCGATCGGAACGCACAATAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACattat < 1:105552/226‑1 (MQ=255) aaTTTACTGCGATCGGAACGCACAATAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGggcgg > 1:238319/1‑249 (MQ=255) tACTGCGATCGGAACGCACAATAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTc < 1:6901/251‑1 (MQ=255) gAACGCACAATAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCAcgccgc < 1:592381/250‑1 (MQ=255) gAACGCACAATAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGca > 1:88362/1‑251 (MQ=255) acaATAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACttg > 1:250532/1‑251 (MQ=255) caATAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACattat < 1:741337/204‑1 (MQ=255) aTAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACttgttg < 1:867580/251‑1 (MQ=255) aGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACTTGTTGTa > 1:605013/1‑251 (MQ=255) cgcgATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACTTGTTGTAAg < 1:606115/251‑1 (MQ=255) cgATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACTTGTTGTAAggg < 1:325286/251‑1 (MQ=255) aTCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAAt > 1:245332/1‑163 (MQ=255) aTCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACattat > 1:831890/1‑194 (MQ=255) cttcAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACTTGTTGTAAGGGtt < 1:790273/246‑1 (MQ=255) cAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACTTGTTGTAAGGGTTTTAGTaaa < 1:209074/251‑1 (MQ=255) tttCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACTTGTTGTAAggg < 1:791803/226‑1 (MQ=255) tCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACTTGTTGTAAGGGTTTTAGTAAATTTTCTCTGGAaataat < 1:444237/251‑1 (MQ=255) gCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAAt > 1:778412/1‑135 (MQ=255) gCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGcaca > 1:138109/1‑208 (MQ=255) gCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACTTGTTGTa < 1:732998/217‑1 (MQ=255) gCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACTTGTTGTAAgg < 1:121972/220‑1 (MQ=255) ttATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACattat < 1:807645/163‑1 (MQ=255) aTCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAatat < 1:409639/125‑1 (MQ=255) aTCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTg > 1:780683/1‑132 (MQ=255) aTCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACTTGTTGTAAGGGTTTTAGTAAATTTTCTCTGGAAATAATAAATTGca > 1:174193/1‑251 (MQ=255) aaaTATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACTTGTTGTAAGGGTTTTAGTAAATTTTCTCTGGAAATAATAAATTGCATCATATGACTCCTATAc < 1:120343/251‑1 (MQ=255) aaaTATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACTTGTTGTAAGGGTTTTAGTAAATTTTCTCTGGAAATAATAAATTGCATCATATGACTCCTATAc < 1:352121/251‑1 (MQ=255) atCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACTTGTTGTAAggg > 1:778016/1‑195 (MQ=255) ccGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACTTGTTGTAAGGGTTTTAGTAAATTTTCTCTGGAAATAATAAATTGCATCATATGACTCCTATACGGATAAAATTCGGATTGAGtt < 1:647135/251‑1 (MQ=255) ggAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATcc > 1:138150/1‑72 (MQ=255) ggAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACTTGTTGTAAGGGTTTTAGTAAATTTTCTCTGGAAATAATAAATTGCATCATATGACTCCTATAc > 1:41949/1‑228 (MQ=255) gAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAAt > 1:506136/1‑89 (MQ=255) aTAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACTTGTTGTAAGGGTTTTAGTAAATTTTCTCTGGAAATAATAAATTGCATCATATGACTCCTATACGGATAAAATTCGGATTAAGTTAGcc > 1:732422/1‑250 (MQ=255) gTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACTTGTTGTAAGGGTTTTAGTa < 1:327409/167‑1 (MQ=255) gTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACTTGTTGTAAGGGTTTTAGTAAATTTTCTCTGGAAATAATAAATTGCATCATATGACTcc < 1:178908/206‑1 (MQ=255) gTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTa > 1:720409/1‑45 (MQ=255) gCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACTTGTTGTAAGGGTTTTAGTAAATTTTCTCTGGAAATAATAAATTGCATCATATGACTCCTATAc < 1:143181/201‑1 (MQ=255) gCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACTTGTTGTAAGGGTTTTAGTAAATTTTCTCTGGAAATAATAAATTGCATCATATGACTCCTATAc < 1:191977/201‑1 (MQ=255) gTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACTTGTTGTAAGGGTTTTAGTAAATTTTCTCTGGAAATAATAAATTGCATCATATGACTCCTATAc > 1:826456/1‑194 (MQ=255) gTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACTTGTTGTAAGGGTTTTAGTAAATTTTCTCTGGAAATAATAAATTGCATCATATGACTCCTATACGGATAAAAtt < 1:301993/204‑1 (MQ=255) gggTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACTTGTTGTAAggg < 1:643248/136‑1 (MQ=255) gggTTTGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACTTGTTGTAAGGGTTTTAGTAAATTTTCTCTGGAAATAATAAATTGCATCATATGACTCCTATACGGATAAAATTCGGATTAAGTTAGCCCAAtcttct > 1:156525/1‑222 (MQ=255) tGGGTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACTTGTTGTAAGGGTTTTAGTAAATTTTCTCTGGAAATAATAAATTGCATCATATGACTCCTATACGGATAAAATTCGGATTAAGTTAGCCCAATCTTCTTGAATATTCGGATCGGTGTCGCGGAATCCTGCaa < 1:650667/251‑1 (MQ=255) gggTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACTTGTTGTAAGGGTTTTAGTAAATTTTCTCTGGAAATAATAAATTGCATCATATGACTCCTATACGGATAAAATTCGGATTAAGTTAGCCCAATCTTCTTGAATATTCGGATCgg > 1:821528/1‑232 (MQ=255) ggTGGACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAatat < 1:254563/89‑1 (MQ=255) ggACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACTTGTTGTAAGGGTTTTAGTAAATTTTCTCTGGAAATAATAAATTGCATCATATGACTCCTATAc < 1:92293/178‑1 (MQ=255) ggACAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACTTGTTGTAAGGGTTTTAGTAAATTTTCTCTGGAAATAATAAATTGCATCATATGACTCCTATACGGATAAAATTCGGATTAAGTTAGCCCAATCTTCTTGaa < 1:461317/216‑1 (MQ=255) cAGTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACTTGTTGTAAGGGTTTTAGTAAATTTTCTCTGGAAATAATAAATTGCATCATATGACTCCTATACGGATAAAATTCGGATTAAGTTAGCCCAATCTTCTTGAATATTCGGATCGGTGTCGCgg < 1:33056/233‑1 (MQ=255) gTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACattat > 1:16107/1‑66 (MQ=255) gTTCTACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACTTGTTGTAAGGGTTTTAGTAAATTTTCTCTGGAAATAATAAATTGCATCATATGACTCCTATACGGATAAAATTCGGATTAAGTTAGCCCAATCTTCTTGAATATTCGGATCGGTGTCGCGGAATCCTGCAATGGTGCGGCa > 1:749509/1‑251 (MQ=255) | GGCTTGCTCAAGCGTAAAATCCACTTCCGATTGCCAGTCCGTTAAATTCGGATAATCTTCCACCGGCAAAGTGGATAAATTGAATTTACTGCGATCGGAACGCACAATAGCGCGATCTTCTTCAAATGTCACAGCAATTTCTGCATTATCCGGCAGGCTGCGACAAATATCCAGGAATTTTTTCGCCGGAATAGTGAATTTGCCGTCTTGTTCCGCATGAAGTAATGGGGTTTGGGTGGACAGTTCCACTTCTAAATCCGTACCGGTAATATTTAATTGATTATTTTCAATTTGCAGCAATACATTATTTAACACCGGAATATTCGGGCGGCTATTCAGCACGCCGCACACTTGTTGTAAGGGTTTTAGTAAATTTTCTCTGGAAATAATAAATTGCATCATATGACTCCTATACGGATAAAATTCGGATTAAGTTAGCCCAATCTTCTTGAATATTCGGATCGGTGTCGCGGAATCCTGCAATGGTGCGGCA > 1/228739‑229231 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |