| Predicted mutation | ||||||
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| * | 1 | 1,479,588 | 0 | A | T | 100.0% | 218.2 / NA | 82 | T133T (ACA→ACT) | unknown | Flp pilus assembly protein RcpC/CpaB |
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ggTTCTTTTCTATCCAACAAATCTATTATCTCTCCGAATGATCCTAGATTCTTTACTTCCAGCTTGAATCCAAGTCAAGAAGTCGCATATCGCATCTATGTTAGATCTGGCGATGATTACATTCTAAATACTATTTTAAGCGGAGACTATGTATCTGTTTATAGCCAGCAAACCGCTTCAGATTCCCGCAATACTTATGATCGTAAAGATTTAGTTAAAGTTTTAGGTAAGGCAGTGGTTCTAcaagcacg > 1:412097/1‑249 (MQ=255) ggTTCTTTTCTATCCAACAAATCTATTATCTCTCCGAATGATCCTAGATTCTTTACTTCCAGCTTGAATCCAAGTCAAGAAGTCGCATATCGCATCTATGTTAGATCTGGCGATGATTACATTCTAAATACTATTTTAAGCGGAGACTATGTATCTGTTTATAGCCAGCAAACCGCTTCAGATTCCCGCAATACTTATGATCGTAAAGATTTAGTTAAAGTTTTAGGTAAGGCAGTGGTTCTAcaag > 1:141345/1‑247 (MQ=255) gTTCTTTTCTATCCAACAAATCTATTATCTCTCCGAATGATCCTAGATTCTTTACTTCCAGCTTGAATCCAAGTCAAGAAGTCGCATATCGCATCTATGTTagat < 1:759656/105‑4 (MQ=255) gTTCTTTTCTATCCAACAAATCTATTATCTCTCCGAATGATCCTAGATTCTTTACTTCCAGCTTGAATCCAAGTCAAGAAGTCGCATATCGCATCTATGTTAGATCTGGCGATGATTACATTCTAAATACTATTTTAAGCGGAGACTATGTATCTGTTTATAGCCAGCAAACCGCTTCAGATTCCCGCAATACTTATGATCGTAAAGATTTAGTTAAAGTTTTAGGTAAGGCAGTGGTTCTAcaagcacgg > 1:682175/1‑248 (MQ=255) cTTTTCTATCCAACAAATCTATTATCTTTCCGAATGATCCTAGATTCTTTACTTCCAGCTTGAATCCAAGTCAAGAAGTCGCATATCGCATCTATGTTAGATCTGGCGATGATTACATTCTAAATACTATTTTAAGCGGAGACTATGTATCTGTTTATAGCCAGCAAACCGCTTCAGATTCCCGCAATACTTATGAt < 1:432130/197‑1 (MQ=255) tttCTATCCAACAAATCTATTATCTCTCCGAATGATCCTAGATTCTTTACTTCCAGCTTGAATCCAAGTCAAGAAGTCGCATATCGCATCTATGTTAGATCTGGCGATGATTACATTCTAAATACTATTTTAAGCGGAGACTATGTATCTGTTTATAGCCAGCAAACCGCTTCAGATTCCCGCAATACTTATGATCGTAAAGATTTAGTTAAAGTTTTAGGTAAGGCAGTGGTTCTAcaagcacggaattt > 1:564018/1‑243 (MQ=255) caacaaATCTATTATCTCTCCGAATGATCCTAGATTCTTTACTTCCAGCTTGAATCCAAGTCAAGAAGTCGCTTATCGCATCTATGTTAGATCTGGCGATGATTACATTCTAAATACTATTTTAAGCGGAGACTATGTATCTGTTTATAGCCAGCAAACCGCTTCAGATTCCCGCAATACTTATGATCGTAAAGATTTAGTTAAAGTTTTAGGTaaggc < 1:841199/219‑4 (MQ=255) aaTCTATTATCTCTCCGAATGATCCTAGATTCTTTACTTCCAGCTTGAATCCAAGTCAAGAAGTCGCATATCGCATCTATGTTAGATCTGGCGATGATTACATTCTAAATACTATTTTAAGCGGAGACTATGTATCTGTTTATAGCCAGCAAACCGCTTCAGATTCCCGCAATACTTATGATCGTAAAGATTTAGTTAAAGTTTTAGGTaaggcagtggtt > 1:716179/1‑211 (MQ=255) aTCTATTATCTCTCCGAATGATCCTAGATTCTTTACTTCCAGCTTGAATCCAAGTCCAGAAGTCGCATATCGCATCTATGTTAGATCTGGCGATGATTACATTCTAAATACTATTTTAAGCGGAGACTATGTATCTGTTTATAGCCAGCAAACCGCTTCAGATTCCCGCAATACTTATGATCGTAAAGATTTAGTTAAAGTTTTAGGTAAGGCAGTGGTTCTAcaagcacggaattttgctcaagtagcag > 1:87582/1‑229 (MQ=255) tCTATTATCTCTCCGAATGATCCTAGATTCTTTACTTCCAGCTTGAATCCAAGTCAAGAAGTCGCATATCGCATCTATGTTAGATCTGGCGATGATTACATTCTAAATACTATTTTAAgc < 1:139195/120‑2 (MQ=255) tCTATTATCTCTCCGAATGATCCTAGATTCTTTACTTCCAGCTTGAATCCAAGTCAAGAAGTCGCATATCGCATCTATGTTAGATCTGGCGATGATTACATTCTAAATACTATTTTAAGCGGAGACTATGtatc > 1:85459/1‑131 (MQ=255) tCTATTATCTCTCCGAATGATCCTAGATTCTTTACTTCCAGCTTGAATCCAAGTCAAGAAGTCGCATATCGCATCTATGTTAGATCTGGCGATGATTACATTCTAAATACTATTTTAAGCGGAGACTATGTATCTGTTTATAGCCAGCAAACCGCTTCAGATTCCCGCAATACTTATGATCGTAAAGATTTAGTTAAAGTTTTAGGTAAGGCAGTGGTTCTAcaagcacggaattttgctcaagtagcag > 1:154701/1‑228 (MQ=255) tattatCTCTCCGAATGATCCTAGATTCTTTACTTCCAGCTTGAATCCAAGTCAAGAAGTCGCATATCGCATCTATGTTAGATCTGGCGATGATTACATTCTAAATACTATTTTAAGCGGAGACTATGTATCTGTTTATAGCCAGCAAACCGCTTCAGATTCCCGCAATACTTATGATCGTAAAGATTTAGTTAAAGTTTTAGGTAAGGCAGTGGTTCTAcaagcacggaattttgctcaagtagcagaac < 1:47873/251‑26 (MQ=255) tctctcCGAATGATCCTAGATTCTTTACTTCCAGCTTGAATCCAAGTCAAGAAGTCGCATATCGCATCTATGTTAGATCTGGCGATGATTACATTCTAAATACTATTTTAAGCGGAGACTATGTATCTGTTTATAGCCAGCAAACCGCTTCAGATTCCCGCAATACTTATGATCGTAAAGATTTAGTTAAAGTTTTAGGTAAGGCAGTGGTTCTACAAGCACGGAATTTTGCTCAAGTAGCAGAACAAggc < 1:740715/251‑2 (MQ=255) ctcCGAATGATCCTAGATTCTTTACTTCCAGCTTGAATCCAAGTCAAGAAGTCGCATATCGCATCTATGTTAGATCTGGCGATGATTACATTCTAAATACTATTTTAAGCGGAGACTATGTATCTGTTTATAGCCAGCAAACCGCTTCAGATTCCCGCAATACTTATGATCGTAAAGATTTAGTTAAAGTTTTAGGTAAGGCAGTGGTTCTACAAGCACGGAATTTTGCTCAAGTAGCAGAACAAggca > 1:91141/1‑247 (MQ=255) ctcCGAATGATCCTAGATTCTTTACTTCCAGCTTGAATCCAAGTCAAGAAGTCGCATATCGCATCCATGTTAGATCTGGCGATGATTACATTCTAAATACTATTTTAAGCGGAGACTATGTATCTGTTTATAGCCAGCAAACCGCTTCAGATTCCCGCAATACTTATGATCGTAAAGATTTAGTTAAAGTTTTAGGTAAGGCAGTGGTTCTACAAGCACGGAATTTTGCTCAAGTAGCAGAACAAggca > 1:54289/1‑247 (MQ=255) aTCCTAGATTCTTTACTTCCAGCTTGAATCCAAGTCAAGAAGTCGCATATCGCATCTATGTTAGATCTGGCGATGATTACATTCTAAATACTATTTTAAgc < 1:344984/101‑2 (MQ=255) ccTAGATTCTTTACTTCCAGCTTGAATCCAAGTCAAGAAGTCGCATATCGCATCTATGTTAGATCTGGCGATGATTACATTCTAAATACTATTTTAAGCGGAGACTATGTATCTGTTTATAGCCAGCAAACCGCTTCAGATTCCCGCAATACTTATGATCGTAAAGATTTAGTTAAAGTTTTAGGTAAGGCAGTGGTTCTACAAGCACGGAATTTTGCTCAAGTAGCAGAACAAggcactgaaactgagaa > 1:167761/1‑236 (MQ=255) | GCCGAGTTAAAGAATGACGTAAGCAAAGGTCATTTATTACAGGCAGATGATTATATTTTAAATGAGATTTCTGTCCCTGAAGACAGTGCACTAGTCGACAATGACCTAAGAGAGGCTACGACTAAAAATGGTATTCAGGGATTACAAGGCTATTTAATGGCAGAAAATGTCAGAGCTGGTTCTTTTCTATCCAACAAATCTATTATCTCTCCGAACGATCCTAGATTCTTTACATCCAGCCTAGATCCGAATCAAGAAGTTGCATATCGCATCTATGTTAAATCTGGTGATGATTACATTCTAAATACTATTTTAAGTGGAGACTATGTTGCTATCTATAGCCAACAAATTGCTTCAGATTCGCGCAACACTTATGATCGTAAAGATTTAGTTAAAATTTTAGGTAAAGTATTGGTTTTACAAGCAAGAAACTTTACTCAATCAACAGAACAAGGTGCTCCTGAAGCTGA > 1/1479355‑1479824 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |