| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 1,478,965 | C→T | L86L (CTA→TTA) | unknown → | Type IV prepilin peptidase TadV/CpaA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,478,965 | 0 | C | T | 100.0% | 227.6 / NA | 85 | L86L (CTA→TTA) | unknown | Type IV prepilin peptidase TadV/CpaA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (41/44); total (41/44) | |||||||||||
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cTTATTATCGGGTTTTTACTGTTTTCTCTGCACTTCATAGGTGCAGGAGATATTAAGCTTGCTTCGGTGCTAATGTTAGCCGTTCCAAGTGAGGAAATTTTTTCTTTTTTCTTCTTTACAACATTTGCCGGATTGGGACTAATTATTATCGGTTGGTTATTTTTCCGTAAATCAATTAAAGAAAACGGATTGCCTTATGGCGTAGCAATAAGc > 1:478321/1‑213 (MQ=255) attatCGGGTTTTTACTGTTTTCTCTGCACTTCATAGGTGCAGGAGATATTAAGCTTGCTTCGGTGCTAATGTTAGCCGTTCCAAGTGAGGAAATTTTTTCTTTTTTCTTCTTTACAACATTTGCCGGATTGGGACTAATTATTATCGGTTGGTTATTTTTCCGTAAATCAATTa > 1:270233/1‑175 (MQ=255) gtttttACTGTTTTCTCTGCACTTCATAGGTGCAGGAGATATTAAGCTTGCTTCGGTGCTAATGTTAGCCGTTCCAAGTGAGGAAATTTTTTCTTTTTTCTTCTTTACAACATTTGCCGGATTGGGACTAATTATTATCGGTTGGTTATTTTTCCGTAAATCAATTAAAGAAAACGGATTGCCTTATGGCGTAGCAATAAGc > 1:568390/2‑202 (MQ=255) cTGTTTTCTCTGCACTTCATAGGTGCAGGAGATATTAAGCTTGCTTCGGTGCTAATGTTAGCCGTTCCAAGTGAGGAAATTTTTTCTTTTTTCTTCTTTACAACATTTGCCGGATTGGGACTAATTATTATCGGTTGGTTATTTTTCCGTAAATCAATTAAAGAAAACGGATTGCCTTATGGCGTAGCAATAAGcc > 1:884409/1‑196 (MQ=255) 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aaTGTTAGCCGTTCCAAGTGAGGAAATTTTTTCTTTTTTCTTCTTTACAACATTTGCCGGATTGGGACTAATTATTATCGGTTGGTTATTTTTCCGTAAATCAATTAAAGAAAACGGATTGCCTTATGGCGTAGCAATAAGcc < 1:885175/143‑1 (MQ=255) aaTGTTAGCCGTTCCAAGTGAGGAAATTTTTTCTTTTTTCTTCTTTACAACATTTGCCGGATTGGGACTAATTATTATCGGTTGGTTATTTTTCCGTAAATCAATTAAAGAAAACGGATTGCCTTATGGCGTAGCAATAAGc < 1:624958/142‑1 (MQ=255) | GCTTATTAATACTTTAGTAGTCATAACGATCTTACTGCTGACTACTTTATCTGTAACTGACATTCGTTCTCGGATTATTAGTAACCGAGTCGTTTTGTTTCTGTTATTCGTCATTATTCCGTTCAGTTTATTAAAATATCAGACTATCTTTGTTATTCCCGCCTTATGTACACTTATTATCGGATTTTTACTGTTTTCTTTGCACTTCATAGGTGCAGGAGATATTAAGCTTGCTTCGGTGCTAATGCTAGCCGTTCCAAGTGACGAAATTTTTTCTTTTTTCTTCTTTACAACATTTGCCGGATTGGGACTAATTATTATCGGTTGGTTATTTTTCCGTGAATCAATTAAAGAAAACGGATTGCCTTATGGCGTAGCAATAAGCCTTGGCTTTATGATAAACATGGCTCTATCAAATTAATTTTGATTGAGCGGAGACTTTACTTTGTTAAAATTTAATTAAGGGTAAAAAATGAATTAC > 1/1478718‑1479198 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |