| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 226,146 | G→A | intergenic (‑179/‑9) | unknown ← / → unknown | Superoxide dismutase [Cu‑Zn] precursor (EC 1.15.1.1)/SAM‑dependent methyltransferase HI0095 (UbiE paralog) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 226,146 | 0 | G | A | 100.0% | 128.2 / NA | 49 | intergenic (‑179/‑9) | unknown/unknown | Superoxide dismutase [Cu‑Zn] precursor (EC 1.15.1.1)/SAM‑dependent methyltransferase HI0095 (UbiE paralog) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (23/26); total (23/26) | |||||||||||
GCCGATTACTATGGCTAAAATAGTTTTGATTTTCATTTTTAGCTCCTATTTATGTAAGAAAACCTTTGTCATTATAACCAAACTTAGTAATAAAACCGATAAGTTTTAATAAAATATTAACTATTAAATCATTTACTATTTTAATGTGTTGGCTTTTTATATTTAATAAAAATCATATTTATTTATAATGTAAGCTGTTTGGTGTTATTGAGGAGAAAGCAAAATGGGTAAAGAAGAAGTCGGCCATAATTTTTTAGCGCGTTTAGGTAAAACCCGTTTACGTCCGGGCGGTCGTAAAGCGACGGATTGGTTGATTGCCAGTGGTGATTTTAGTCAAGATAAAAAGGTGCTGGAAGTGGCATGTAATATGTGTACCACGGCAATTGGGCTGGCGAAGCAATACGGTTGCCACATTGAAGGCGTGGATTTGGATGAAAACGCGTTGGAAAAAGCTAAAGCC > 1/225932‑226391 | gCCGATTACTATGGCTAAAATAGTTTTGATTTTCATTTTTAGCTCCTATTTATGTAAGAAAACCTTTGTCATTATAACCAAACTTAGTAATAAAACCGATAAGTTTTAATAAAATATTAACTATTAAATCATTTACTATTTTAATGTGTTGGCTTTTTATATTTAATAAAAATCATATTTATTTATAATGTAAGCTGTTTGGTGTTATTGAGGAAAAAGCAAAATGGGTAAAGAAGAAGTCGGCCATAAtt > 1:844062/1‑251 (MQ=255) 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1/225932‑226391 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |