| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 216,472 | G→T | intergenic (+56/+141) | unknown → / ← unknown | NrfD protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 216,472 | 0 | G | T | 100.0% | 183.1 / NA | 67 | intergenic (+56/+141) | unknown/unknown | NrfD protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (40/27); total (40/27) | |||||||||||
ATCGGCGTCATGCTTATCGGCATCCTCATCCCGCTCGCCGGTAATCTATTGGTTAGCGATAAATTAAGATACAATCGTCATTTCATCATTCTGGTATCTATATTTGATTTAATCGGCGTGTTGTGTCTGCGATATTTTATTTTGTACGGCGGACAATTGACCGTTGCGTAGGTTAGTTTTTTATTATTGATAAAGGCGTATAATGTACGCTTTTTGTTTAGCTGTTGCTACTTTCTTGCTTGTGCAAGAAAGTAGCAAAGAACACACCCCAGCTTCACCGCTGATCTTCGCTTGGTTGCAATTTTTTTAACGGAAATTTTTGAACTCGCCACTACGCAGCTCAAACAAAGCGAAAATTTCCTAAAAATTACAAGTCGCTCAGGCGGGTCAGATGGGGCCCCCATGGTGCATTATTAAAAGTGCGGTGGTTTTTAAAATAGTTTTTTAATGATAAAAACGCTTGAAAAAATGAC > 1/216246‑216718 | aTCGGCGTCATGCTTATCGGCATCCTCATCCCGCTCGCCGGTAATCTATTGGTTAGCGATAAATTAAGATACAATCGTCATTTCATCATTCTGGTATCTATATTTGATTTAATCGGCGTGTTGTGTCTGCGATATTTTATTTTGTACGGCGGACAATTGACCGTTGCGTAGGTTAGTTTTTTATTATTGATAAAGGCGTATAATGTACGCTTTTTGTTTAGCTGTTTCTACTTTCTTGCTTGTGCAAGaa < 1:769204/250‑1 (MQ=255) 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1:896176/207‑1 (MQ=255) ttGTTTAGCTGTTTCTACTTTCTTGCTTGTGCAAGAAAGTAGCAAAGAACACAcccc < 1:122669/57‑1 (MQ=255) ttGTTTAGCTGTTTCTACTTTCTTGCTTGTGCAAGAAAGTAGCAAAGAACACACCCCAGCTTCACCGCTGATCTTCGCTTGGTTGCAATTTTTTTAACGGAAATTTTTGAACTCGCCACTACGCAGCTcaaac < 1:693501/133‑1 (MQ=255) ttGTTTAGCTGTTTCTACTTTCTTGCTTGTGCAAGAAAGTAGCAAAGAACACACCCCAGCTTCACCGCTGATCTTCGCTTGGTTGCAATTTTTTTAACGGAAATTTTTGAACTCGCCACTACGCAGCTCAAACAAAGCGAAAATTTCCTAAAAATTACAAGTCGCTCAGGCGGGTCAGATGGGGCCCCCATGGTGCATTATTAAAAg > 1:883793/1‑207 (MQ=255) gTTTAGCTGTTTCTACTTTCTTGCTTGTGCAAGAAAGTAGCAAAGAACACACCCCAGCTTCACCGCTGATCTTCGCTTGGTTGCAATTTTTTTAACGGAAATTTTTGAACTCGCCACTACGCAGCTcaaacaa > 1:749844/1‑133 (MQ=255) gTTTAGCTGTTTCTACTTTCTTGCTTGTGCAAGAAAGTAGCAAAGAACACACCCCAGCTTCACCGCTGATCTTCGCTTGGTTGCAATTTTTTTAACGGAAATTTTTGAACTCGCCACTACGCAGCTCAAACAAAGCGAAAATTTCCTAAAAATTACAAGTCGCTCAGGCGGGTCAGATg > 1:848181/1‑179 (MQ=255) 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| ATCGGCGTCATGCTTATCGGCATCCTCATCCCGCTCGCCGGTAATCTATTGGTTAGCGATAAATTAAGATACAATCGTCATTTCATCATTCTGGTATCTATATTTGATTTAATCGGCGTGTTGTGTCTGCGATATTTTATTTTGTACGGCGGACAATTGACCGTTGCGTAGGTTAGTTTTTTATTATTGATAAAGGCGTATAATGTACGCTTTTTGTTTAGCTGTTGCTACTTTCTTGCTTGTGCAAGAAAGTAGCAAAGAACACACCCCAGCTTCACCGCTGATCTTCGCTTGGTTGCAATTTTTTTAACGGAAATTTTTGAACTCGCCACTACGCAGCTCAAACAAAGCGAAAATTTCCTAAAAATTACAAGTCGCTCAGGCGGGTCAGATGGGGCCCCCATGGTGCATTATTAAAAGTGCGGTGGTTTTTAAAATAGTTTTTTAATGATAAAAACGCTTGAAAAAATGAC > 1/216246‑216718 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |