| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 209,771 | C→T | P91L (CCA→CTA) | unknown → | Cytochrome c heme lyase subunit CcmL |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 209,771 | 0 | C | T | 100.0% | 206.3 / NA | 75 | P91L (CCA→CTA) | unknown | Cytochrome c heme lyase subunit CcmL |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (39/36); total (39/36) | |||||||||||
AATGTGTTTGCCGCCATCGACGTGCTGAATTTCAGCTCGCCGCAGCAGGAAGCCGACTATCACGCCTTAACGCGGGAACTGCGCTGTCCGCAATGTCAGAATAACAATATCGCCGATTCTAACGCCGCTATTGCTGTGGATATGCGCACTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCCATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCACAACAGCAGCGCCTTAATGCTTTGTTAAATAAGGAAAATGACTAATGAATTTGTGGACAAGCATTTTTGTGTTAACGCTGATTGCCGCGTTAATTTGTTTTT > 1/209527‑210009 | aaTGTGTTTGCCGCCATCGACGTGCTGAATTTCAGCTCGCCGCAGCAGGAAGCCGACTATCACGCCTTAACGCGGGAACTGCGCTGTCCGCAATGTCAGAATAACAATATCGCCGATTCTAACGCCGCTATTGCTGTGGATATGCGCACTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGAc < 1:825497/251‑1 (MQ=255) aTGTGTTTGCCGCCATCGACGTGCTGAATTTCAGCTCGCCGCAGCAGGAAGCCGACTATCACGCCTTAACGCGGGAACTGCGCTGTCCGCAATGTCAGAATAACAATATCGCCGATTCTAACGCCGCTATTGCTGTGGATATGCGCACTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGAcc < 1:369819/251‑1 (MQ=255) ccgccATCGACGTGCTGAATTTCAGCTCGCCGCAGCAGGAAGCCGACTATCACGCCTTAACGCGGGAACTGCGCTGTCCGCAATGTCAGAATAACAATATCGCCGATTCTAACGCCGCTATTGCTGTGGATATGCGCACTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCAc > 1:222547/1‑250 (MQ=255) cGACGTGCTGAATTTCAGCTCGCCGCAGCAGGAAGCCGACTATCACGCCTTAACGCGGGAACTGCGCTGTCCGCAATGTCAGAATAACAATATCGCCGATTCTAACGCCGCTATTGCTGTGGATATGCGCACTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGttt < 1:376585/251‑1 (MQ=255) tttCAGCTCGCCGCAGCAGGAAGCCGACTATCACGCCTTAACGCGGGAACTGCGCTGTCCGCAATGTCAGAATAACAATATCGCCGATTCTAACGCCGCTATTGCTGTGGATATGCGCACTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACg > 1:70504/1‑250 (MQ=255) cTATCACGCCTTAACGCGGGAACTGCGCTGTCCGCAATGTCAGAATAACAATATCGCCGATTCTAACGCCGCTATTGCTGTGGATATGCGCACTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTgg > 1:873309/1‑251 (MQ=255) gTCCGCAATGTCAGAATAACAATATCGCCGATTCTAACGCCGCTATTGCTGTGGATATGCGCACTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATg > 1:552964/1‑251 (MQ=255) gAATAACAATATCGCCGATTCTAACGCCGCTATTGCTGTGGATATGCGCACTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGAcc < 1:596064/154‑1 (MQ=255) cAATATCGCCGATTCTAACGCCGCTATTGCTGTGGATATGCGCACTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATg > 1:283877/1‑251 (MQ=255) cAATATCGCCGATTCTAACGCCGCTATTGCTGTGGATATGCGCACTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATg > 1:263685/1‑251 (MQ=255) aaTATCGCCGATTCTAACGCCGCTATTGCTGTGGATATGCGCACTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGc < 1:220409/251‑1 (MQ=255) cGCCGATTCTAACGCCGCTATTGCTGTGGATATGCGCACTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCcgcg > 1:596407/1‑250 (MQ=255) ttCTAACGCCGCTATTGCTGTGGATATGCGCACTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAgg > 1:882119/1‑251 (MQ=255) ttCTAACGCCGCTATTGCTGTGGATATGCGCACTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAgg > 1:199056/1‑251 (MQ=255) cTAACGCCGCTATTGCTGTGGATATGCGCACTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGcc < 1:489797/251‑1 (MQ=255) ccgcTATTGCTGTGGATATGCGCACTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAGAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAg < 1:205978/250‑1 (MQ=255) ccgcTATTGCTGTGGATATGCGCACTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGt < 1:274532/251‑1 (MQ=255) ccgcTATTGCTGTGGATATGCGCACTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACAAGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAg < 1:567640/250‑1 (MQ=255) cTATTGCTGTGGATATGCGCACTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAg > 1:394218/1‑247 (MQ=255) cTATTGCTGTGGATATGCGCACTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGaa > 1:691186/1‑251 (MQ=255) ttGCTGTGGATATGCGCACTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGca > 1:754135/1‑251 (MQ=255) gCTGTGGATATGCGCACTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGcaca > 1:688845/1‑251 (MQ=255) gCTGTGGATATGCGCACTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGcaca > 1:632275/1‑251 (MQ=255) tgtgGATATGCGCACTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCacaac < 1:36253/251‑1 (MQ=255) gtgGATATGCGCACTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGAc < 1:53488/116‑1 (MQ=255) gtgGATATGCGCACTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATg > 1:214533/1‑164 (MQ=255) tgGATATGCGCACTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCGCCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCACAAcag < 1:265956/251‑1 (MQ=255) ggATATGCGCACTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGAcc < 1:524076/115‑1 (MQ=255) gATATGCGCACTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCACAAcagca > 1:263827/1‑251 (MQ=255) gcACTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCtt < 1:80661/151‑1 (MQ=255) cACTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTgg < 1:601915/198‑1 (MQ=255) aCTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCACAACAGCAGCGCCTTaa < 1:99989/251‑1 (MQ=255) aaaGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCACAACAGCAGCGCCTTAATGc < 1:145033/251‑1 (MQ=255) aaaGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCACAACAGCAGCGCCTTAATGc < 1:82863/251‑1 (MQ=255) gtgtTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGAc < 1:189627/98‑1 (MQ=255) gtgtTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCACAACAGCAGCGCCTTAATGCttt > 1:680247/1‑251 (MQ=255) gtTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGttt < 1:767226/113‑1 (MQ=255) gtTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGGAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCACAACAGCAGCGCCTTAATGCTTTGt > 1:455835/1‑251 (MQ=255) tttGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCGCCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCACAACAGCAGCGCCTTAATGCTTTGt < 1:534443/250‑1 (MQ=255) tttGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCACAACAGCAGCGCCTTAATGCTTTGt < 1:63781/250‑1 (MQ=255) ttGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAg > 1:561520/1‑212 (MQ=255) gTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCt < 1:828342/150‑1 (MQ=255) gTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGGTGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCACAACAGCAGCGCCTTAATGCTTTGTTAAATAAgg > 1:451850/1‑251 (MQ=255) gTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTG‑TTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCACAACAGCAGCGCCTTAATGCTTTGTTAAATAAGGa > 1:357824/1‑251 (MQ=255) cAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGt > 1:257842/1‑207 (MQ=255) cAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCACAACAGCAGCGCCTTAATGc < 1:132971/233‑1 (MQ=255) aaTCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCACAAcag > 1:625824/1‑209 (MQ=255) aaTCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCACAACAGCAGCGCCTTAATGc > 1:809684/1‑223 (MQ=255) cAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCACAACAGCAGCGCCTTAATGCTTTGTTAAATAAGGAAAATGACTAATGAATTTGTgg > 1:621588/1‑251 (MQ=255) gATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCACAACAGCAGCGCCTTAATGCTTTGTTAAATAAGGAAAATGACTAATGAATTtgtg < 1:571082/247‑1 (MQ=255) aTGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCACAACAGCAGCGCCTTAATGCTTTGTTAAATAAGGAAAATGACTAATGAATTTGTGGACaa > 1:63320/1‑251 (MQ=255) gtgCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATc > 1:139098/1‑99 (MQ=255) gtgCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATg < 1:673072/104‑1 (MQ=255) gtgCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTgg > 1:204778/1‑149 (MQ=255) gtgCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCACAACAGCAGCGCCTTAATGCTTTGTTAAATAAGGaaaa < 1:532644/224‑1 (MQ=255) gCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGt < 1:276659/145‑1 (MQ=255) aaTACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCt < 1:342661/89‑1 (MQ=255) aaTACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCACAACAGCAGCGCCTTAATGCTTTGTTAAATAAGGAAAATGACTAATGAATTTGTGGACAAGCATTTTtg < 1:711770/251‑1 (MQ=255) aTACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGc > 1:204301/1‑156 (MQ=255) aTACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGcac < 1:862878/182‑1 (MQ=255) aTACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCACAACAGCAGCGCCTTAATGCTTTGTTAAATAAGGAAAATGACTAATGa > 1:860196/1‑229 (MQ=255) aTACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCACAACAGCAGCGCCTTAATGCTTTGTTAAATAAGGAAAATGACTAATGAATTTGTGGACAAGCATTTTtgt > 1:208292/1‑251 (MQ=255) aTACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCACAACAGCAGCGCCTTAATGCTTTGTTAAATAAGGAAAATGACTAATGAATTTGTGGACAAGCATTTTtgt > 1:162394/1‑251 (MQ=255) aCATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGcac > 1:363646/1‑180 (MQ=255) aCATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCACAACAGCAGCGCCTTAATGCTTTGTTAAATAAGGAAAATGACTAATGAATTTGTGGACAAGCATTTTTgtgt < 1:398780/251‑1 (MQ=255) aCATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCACAACAGCAGCGCCTTAATGCTTTGTTAAATAAGGAAAATGACTAATGAATTTGTGGACAAGCATTTTTgtgt > 1:878692/1‑251 (MQ=255) aCATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCACAACAGCAGCGCCTTAATGCTTTGTTAAATAAGGAAAATGACTAATGAATTTGTGGACAAGCATTTTTgtgt > 1:230718/1‑251 (MQ=255) tggtggATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGAc < 1:133910/46‑1 (MQ=255) gtggATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTAT‑GGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCACAACAGCAGCGCCTTAATGTTTTGTTAAATAAGGAAAATGACTAATGAATTTGTGGACAAGCATTTTTGTGTTAACg > 1:382813/1‑250 (MQ=255) tCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCACAACAGCAGCGCCTTAATGCTTTGTTAAATAAGGAAAATGACTAATGAATTTGTGGACAAGCATTTTTGTGTTAACGCTGAt < 1:312500/251‑1 (MQ=255) cTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCACAACAGCAGCGCCTTAATGCTTTGTTAAATAAGGAAAATGACTAATGAATTTGTGGACAAGCATTTTTGTGTTAACGCTGATTGc < 1:231190/251‑1 (MQ=255) gCAATTTTGTTACTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCACAACAGCAGCGCCTTAATGCTTTGTTAAATAAGGAAAATGACTAATGAATTTGTGGACAAGCATTTTTGTGTTAACGCTGATTGCCGCGt > 1:644667/1‑251 (MQ=255) cTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCgcgc < 1:160271/129‑1 (MQ=255) cTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCACACCAGCAGCGCCTTAATGCTTTGTTAAATAAGGAAAATGACTAATGAATTTGTGGACAAGCATTTTTGTGTTAACGCTGATTGCCGCGTTAATTTGttttt > 1:85029/1‑251 (MQ=255) cTTATGACCCGCTATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCACAACAGCAGCGCCTTAATGCTTTGTTAAATAAGGAAAATGACTAATg > 1:661403/1‑196 (MQ=255) | AATGTGTTTGCCGCCATCGACGTGCTGAATTTCAGCTCGCCGCAGCAGGAAGCCGACTATCACGCCTTAACGCGGGAACTGCGCTGTCCGCAATGTCAGAATAACAATATCGCCGATTCTAACGCCGCTATTGCTGTGGATATGCGCACTAAAGTGTTTGAATTGTTACAGGAAGGCAAATCCAAACAGGATGTGGTGCAATACATGGTGGATCGCTATGGCAATTTTGTTACTTATGACCCGCCATTGACCGTTGCCACCCTTGTTTTATGGGTTACGCCTTTTGCTTTGATCTTATGCGGGCTGGTATGGCTTTTCGGGCGGAAAAGAACGATGCCGAGTGGGGCGGATAATGCCGCGCCACAGGCCTTAAGTGAAGCACAACAGCAGCGCCTTAATGCTTTGTTAAATAAGGAAAATGACTAATGAATTTGTGGACAAGCATTTTTGTGTTAACGCTGATTGCCGCGTTAATTTGTTTTT > 1/209527‑210009 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |