| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 208,818 | C→T | T650T (ACC→ACT) | unknown → | Cytochrome c heme lyase subunit CcmF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 208,818 | 0 | C | T | 100.0% | 148.7 / NA | 55 | T650T (ACC→ACT) | unknown | Cytochrome c heme lyase subunit CcmF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (30/25); total (30/25) | |||||||||||
AAAAACGCTTATACACCGTGAGCAAAATGCCGATGACCGAAGCCGCGATCGATTGGGGTTTCAGCCGTGACTTGTATGTGGCGTTAGGTGAAAAATTAGACGACAATTCCTGGGCGTTGCGCTTGTATTACAAACCCTTTATCCGCTGGATAT‑GGCTTGGTGGGTTGTTTATGGTGCTCGGCGGGATATTATGCCTGTTCGACCGCCGTTATCGGTTTAGTAAAATTTTAGGTAAAGAAACCGTGCAGTAACCCCTTATAGAATCATCGAGTATTGATAATGAAAAAGAAATTATATTTACCTTTAATTATTTTCTTCGTTTTGGTTACCGCCTTTCTGGTGCAATTACAACGCAATGCACTGGGTGATGATCCGAAAGCATTGGAATCGGCGTTGGTGGGTAAGCCGGTTCCGCCGAAGACGTTGCAGGATTTATTATCGGATAAAACCTATGATGAAACGCTGTTTAAACAGGGCAAACCG > 1/208577‑209059 | aaaaacgttttaacacGGTGGGCAATATGCCGAGGACCGAGGCCGCGTCCGATTGGGGTTTCAGCCTTGGCTTGTATGTGCCGTTAGGTAAAAAATTGGACGTATTTTCCTGGGCGTTGCGTTTGTTTTCCAAGCCCTTTATCCGCTGGATAT‑GGCTTGGTGGTTTGTTTATGGTGCTCGGGGGAATATTATGCCTGTTCTGCCGCCGTTATCGGTTTAGTAAAATTTTAGGTAAAGAAACTGTGCAGTaa < 1:381727/239‑1 (MQ=255) 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AAAAACGCTTATACACCGTGAGCAAAATGCCGATGACCGAAGCCGCGATCGATTGGGGTTTCAGCCGTGACTTGTATGTGGCGTTAGGTGAAAAATTAGACGACAATTCCTGGGCGTTGCGCTTGTATTACAAACCCTTTATCCGCTGGATAT‑GGCTTGGTGGGTTGTTTATGGTGCTCGGCGGGATATTATGCCTGTTCGACCGCCGTTATCGGTTTAGTAAAATTTTAGGTAAAGAAACCGTGCAGTAACCCCTTATAGAATCATCGAGTATTGATAATGAAAAAGAAATTATATTTACCTTTAATTATTTTCTTCGTTTTGGTTACCGCCTTTCTGGTGCAATTACAACGCAATGCACTGGGTGATGATCCGAAAGCATTGGAATCGGCGTTGGTGGGTAAGCCGGTTCCGCCGAAGACGTTGCAGGATTTATTATCGGATAAAACCTATGATGAAACGCTGTTTAAACAGGGCAAACCG > 1/208577‑209059 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |