| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,473,446 | G→A | A14V (GCG→GTG) | unknown ← | Transcription‑repair coupling factor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,473,446 | 0 | G | A | 100.0% | 210.3 / NA | 78 | A14V (GCG→GTG) | unknown | Transcription‑repair coupling factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (40/38); total (40/38) | |||||||||||
GAAATAATATCTTGATGAGGCGAAAAACTATCATAAGGCAGGGTTTCCCAATCGGGGAAAAAAGTCACGTTTTGCAATAATTCGGAAGGCGTCAGTTGCGTTAATTCTTTCGCCAAACGCACCGCACTTCGGGTGTCATTGGTCACCACCACGGTTAGACCGTCAAACTGCGCGGCAATTTCGCTAATGGCGAGGCTATCCGCACCGGGCAGGATATTGGCTAAAATTTTATGATCATTCGCTTGGGTAGGAATTTCGAGATGAAAAAATTGAGTTTGCATAAAACGACAAAAGAGTAAGAAAAAAATTGCCGTTAGTTTAGCGCAAACGAGGGGGATTTCCAATAAAGATCTGTATAAAAAGACAGTAATTCTACCTAGGGCAAGGCATTGCCTCGGGTATTACAGTTGTTCGAAACATTATAATTCATTGATATTTTTTTAAATATCTTGCCTTCCTCCGTTTACGGGGGGACA > 1/1473206‑1473681 | gAAATAATATCTTGATGAGGCGAAAAACTATCATAAGGCAGGGTTTCCCAATCGGGGAAAAAAGTCACGTTTTGCAATAATTCGGAAGGCGCCAGTTGCTTTAATTCTTTTTCCAAACGCACCGCACTTCGGGTGTCATTGGTCACCACCACGGTTAAACCATCAAACTGCGCGGCAATTTCGCTAATGGCGAGGCTATCCGCGCCGGGCAGGATATTGGCTAAAATTTTATGATCATTCACTTGGGTAgg > 1:766319/1‑251 (MQ=255)gAAATAATATCTTGATGAGGCGAAAAACTATCATAAGGCAGGGTTTCCCAATCGGGGAAAAAAGTCACGTTTTGCAATAATTCGGAAGGCGCCAGTTGCTTTAATTCTTTTTCCAAACGCACCGCACTTCGGGTGTCATTGGTCACCACCACGGTTAAACCATCAAACTGCGCGGCAATTTCGCTAATGGCGAGGCTATCCGCGCCGGGCAGGATATTGGCTAAAATTTTATGATCATTCACTTGGGTAgg > 1:662851/1‑251 (MQ=255)gAAATAATATCTTGATGAGGCGAAAAACTATCATAAGGCAGGGTTTCCCAATCGGGGAAAAAAGTCACGTTTTGCAATAATTCGGAAGGCGCCAGTTGCTTTAATTCTTTTTCCAAACGCACCGCACTTCGGGTGTCATTGGTCACCACCACGGTTAAACCATCAAACTGCGCGGCAATTTCGCTAATGGCGAGGCTATCCGCGCCGGGCAGGATATTGGCTAAAATTTTATGATCATTCACTTGGGTAgg > 1:194682/1‑251 (MQ=255) aaaaCTATCATAAGGCAGGGTTTCCCAATCGGGGAAAAAAGTCACGTTTTGCAATAATTCGGAAGGCGCCAGTTGCTTTAATTCTTTTTCCAAACGCACCGCACTTCGGGTGTCATTGGTCACCACCACGGTTAAACCATCAAACTGCGCGGCAATTTCGCTAATGGCGAGGCTATCCGCGCCGGGCAGGATATTGGCTAAAATTTTATGATCATTCACTTGGGTAGGAATTTCGAGATGAAAAAATTGAg < 1:237060/251‑1 (MQ=255) aaaaCTATCATAAGGCAGGGTTTCCCAATCGGGGAAAAAAGTCACGTTTTGCAATAATTCGGAAGGCGCCAGTTGCTTTAATTCTTTTTCCAAACGCACCGCACTTCGGGTGTCATTGGTCACCACCACGGTTAAACCATCAAACTGCGCGGCAATTTCGCTAATGGCGAGGCTATCCGCGCCGGGCAGGATATTGGCTAAAATTTTATGATCACTCACTTGGGTAGGAATTTCGAGATGAAAAAATTGAg < 1:458659/251‑1 (MQ=255) cTATCATAAGGCAGGGTTTCCCAATCGGGGAAAAAAGTCACGTTTTGCAATAATTCGGAAGGCGCCAGTTGCTTTAATTCTTTTTCCAAACGCACCGCACTTCGGGTGTCATTGGTCACCACCACGGTTAAACCATCAAACTGCGCGGCAATTTCGCTAATGGCGAGGCTATCCGCGCCGGGCAGGATATTGGCTAAAATTTTATGATCATTCACTTGGGTAGGAATTTCGAGATGAAAAAATTGAGTTTg > 1:413429/1‑251 (MQ=255) tCATAAGGCAGGGTTTCCCAATCGGGGAAAAAAGTCACGTTTTGCAATAATTCGGAAGGCGCCAGTTGCTTTAATTCTTTTTCCAAACGCACCGCACTTCGGGTGTCATTGGTCACCACCACGGTTAAACCATCAAACTGCGCGGCAATTTCGCTAATGGCGAGGCTATCCGCGCCGGGCAGGATATTGGCTAAAATTTTATGATCATTCACTTGGGTAGGAAt > 1:359210/1‑224 (MQ=255) 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1:292915/1‑251 (MQ=255) cTAATGGCGAGGCTATCCGCGCCGGGCAGGATATTGGCTAAAATTTTATGATCATTCACTTGGGTAGGAATTTCGAGATGAAAAAATTGAGTTTGCATAAAACGACAAAAGAGTAAGAAAAAAGTTGCAGTTAGTTTAGCGCAAACAAGAGGGATTTCCAATAAAGATCTGTATAAAAAGACAGTAATTCTACCTAGGGCAAAGCATTGCCCCGGGTATTACAGTTGTTCGAAACATTATAATTCATTGat < 1:108388/251‑1 (MQ=255) tGGCGAGGCTATCCGCGCCGGGCAGGATATTGGCTAAAATTTTATGATCATTCACTTGGGTAGGAATTTCGAGATGAAAAAATTGAGTTTGCATAAAACGACAAAAGAGTAAGAAAAAAGTTGCAGTTAGTTTAGCGCAAACAAGAGGGATTTCCAATAAAGATCTGTATAAAAAGAc > 1:44520/1‑178 (MQ=255) tGGCGAGGCTATCCGCGCCGGGCAGGATATTGGCTAAAATTTTATGATCATTCACTTGGGTAGGAATTTCGAGATGAAAAAATTGAGTTTGCATAAAACGACAAAAGAGTAAGAAAAAAGTTGCAGTTAGTTTAGCGCAAACAAGAGGGATTTCCAATAAAGATCTGTATAAAAAGACAGTAATTCTACCTAGGGCAAAGCATTGCCCCGGGTATTACAGTTGTTCGAAACATTATAAt > 1:241638/1‑239 (MQ=255) ggCTATCCGCGCCGGGCAGGATATTGGCTAAAATTTTATGATCATTCACTTGGGTAGGAATTTCGAGATGAAAAAATTGAGTTTGCATAAAACGACAAAAGAGTAAGAAAAAAGTTGCAGTTAGTTTAGCGCAAACAAGAGGGATTTCCAATAAAGATCTGTATAAAAAGACAGTAATTCTACCt < 1:12296/185‑1 (MQ=255) 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aTCATTCACTTGGGTAGGAATTTCGAGATGAAAAAATTGAGTTTGCATAAAACGACAAAAGAGTAAGAAAAAAGTTGCAGTTAGTTTAGCGCAAACAAGAGGGATTTCCAATAAAGATCTGTATAAAAAGACAGTAATTCTACCTAGGGCAAAGCATTGCCCCGGGTATTACAGTTGTTCGAAACATTATAATTCATTGATA‑TTTTTTAAATATCTTGCCTTCCTCCGTTTACggg < 1:616048/236‑1 (MQ=39) tCATTCACTTGGGTAGGAATTTCGAGATGAAAAAATTGAGTTTGCATAAAACGACAAAAGAGTAAGAAAAAAGTTGCAGTTAGTTTAGCGCAAACAAGAGGGATTTCCAATAAAGATCTGTATAAAAAGACAGTAATTCTACCTAGGGc < 1:629550/149‑1 (MQ=255) | GAAATAATATCTTGATGAGGCGAAAAACTATCATAAGGCAGGGTTTCCCAATCGGGGAAAAAAGTCACGTTTTGCAATAATTCGGAAGGCGTCAGTTGCGTTAATTCTTTCGCCAAACGCACCGCACTTCGGGTGTCATTGGTCACCACCACGGTTAGACCGTCAAACTGCGCGGCAATTTCGCTAATGGCGAGGCTATCCGCACCGGGCAGGATATTGGCTAAAATTTTATGATCATTCGCTTGGGTAGGAATTTCGAGATGAAAAAATTGAGTTTGCATAAAACGACAAAAGAGTAAGAAAAAAATTGCCGTTAGTTTAGCGCAAACGAGGGGGATTTCCAATAAAGATCTGTATAAAAAGACAGTAATTCTACCTAGGGCAAGGCATTGCCTCGGGTATTACAGTTGTTCGAAACATTATAATTCATTGATATTTTTTTAAATATCTTGCCTTCCTCCGTTTACGGGGGGACA > 1/1473206‑1473681 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |