| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,441,127 | A→C | H270Q (CAT→CAG) | unknown ← | N‑succinyl‑L,L‑diaminopimelate desuccinylase (EC 3.5.1.18) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,441,127 | 0 | A | C | 100.0% | 248.6 / NA | 85 | H270Q (CAT→CAG) | unknown | N‑succinyl‑L,L‑diaminopimelate desuccinylase (EC 3.5.1.18) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (35/50); total (35/50) | |||||||||||
ACTTTATGAATGGTGGCGTTAAGCGGTCCGAATTCCACCACTTCCGCGCCCATGAGGGCAATAAAACGTCCGTCTGAGGTGCCACCACCGGTTTCCAATTTCGGCGTAATGCCTGCGATTTGTTGCAGGCTGTCCACCAACGCACTCACCAGTTTTCCCGGTTTGGTTAAAAACGGCTTGCCGGAAAGATTCCATTCAATACGATACTTCAGCCCGTGTTTTTCCAGCATCTCGGCGACTTTATGCTTAATCATCCCGTCCGTCACTTCCGTGCAATAACGCAAATTAAATTGCACATAAAGCTCGCCCGGAATCACATTATTGCTGCCGGTGCCGGCATGAATATTAGCGATTTGCAGACTGGTTGGAGGAAAAAAGTCATTGCCGTTGTCCCATTGGTATGTGGTGAGCTCCTGCAAGAACGGCGCGGCTTTGTGAATAGGATTCTCCGCCAGATGGGGATAGGCAACGTGCCCTTGAATGC > 1/1440885‑1441368 | aCTTTATGAATGGTGGCGTTAAGCGGTCCGAATTCCACCACTTCCGCGCCCATGAGGGCAATAAAACGTCCGTCTGAGGTGCCACCACCGGTTTCCAATTTCGGCGTAATGCCTGCGATTTGTTGCAGGCTGTCCACCAACGCACTCACCAGTTTTCCCGGTTTGGTTAAAAACGGCTTGCCGGAAAGATTCCATTCAATACGATACTTCAGCCCGTGTTTTTCCAGCATCTCGGCGACTTTCTGCTTAat < 1:674702/251‑1 (MQ=255)aCTTTATGAATGGTGGCGTTAAGCGGTCCGAATTCCACCACTTCCGCGCCCATGAGGGCAATAAAACGTCCGTCTGAGGTGCCACCACCGGTTTCCAATTTCGGCGTAATGCCTGCGATTTGTTGCAGGCTGTCCACCAACGCACTCACCAGTTTTCCCGGTTTGGTTAAAAACGGCTTGCCGGAAAGATTCCATTCAATACGATACTTCAGCCCGTGTTTTTCCAGCATCTCGGCGACTTTCTGCTTAat < 1:371093/251‑1 (MQ=255) cTTTATGAATGGTGGCGTTAAGCGGTCCGAATTCCACCACTTCCGCGCCCATGAGGGCAATAAAACGTCCGTCTGAGGTGCCACCACCGGTTTCCAATTTCGGCGTAATGCCTGCGATTTGTTGCAGGCTGTCCACCAACGCACTCACCAGTTTTCCCGGTTTGGTTAAAAACGGCTTGCCGGAAAGATTCCATTCAATACGATACTTCAGCCCGTGTTTTTCCAGCATCTCGGCGACTTTCTGCTTAat > 1:125984/1‑250 (MQ=255) tttATGAATGGTGGCGTTAAGCGGTCCGAATTCCACCACTTCCGCGCCCATGAGGGCAATAAAACGTCCGTCTGAGGTGCCACCACCGGTTTCCAATTTCGGCGTAATGCCTGCGATTTGTTGCAGGCTGTCCACCAACGCACTCACCAGTTTTCCCGGTTTGGTTAAAAACGGCTTGCCGGAAAGATTCCATTCAATACGATACTTCAGCCCGTGTTTTTCCAGCATCTCGGCGACTTTCTGCTTAatca > 1:517602/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |