| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,438,254 | C→G | Q8H (CAG→CAC) | unknown ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,438,254 | 0 | C | G | 100.0% | 166.9 / NA | 61 | Q8H (CAG→CAC) | unknown | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (32/29); total (32/29) | |||||||||||
AATTGTGGGTTTCCTGTTAAAGCTAAAGCCTTTTCGGCTATCTCACCGCAAAACGGCCCCTGCCGATTTTCTTGTAATACTTAGGTAACCCATCGTGCTGTAATTAAAGATGGTGGTTTAGGCTCTTTTGGCATATACGGCTGAATTAAAGCATTCATTTCTTGTGTTAAAAGTTGTATTTGAATAGTCAATTCATCTTGCTTTTCTTTTAGTGATAGCAAGCAAGAGATTAATTCCTGCTTGGATAATTTTTGTGACATAATAGAAAAATCCCTATTGAGTAAAATTCCAATAGGGATTTTAGTATTTTCAATCGGTTAAATCTTTGTGCAACTGCTACATAATGCCGTTAATGCCAATCAATACCCTTCTTCCTGTAAATTCGGCAGGAAAGTTTTGTGTTGAATGCGTTTAACGCGGGTTTCGATGCGTCCGTCGGCGTACAATTCAATTTCACGCCAGCCCGGTTGAGCGGTGT > 1/1438018‑1438495 | aaTTGTGGGTTTCCTGTTAAAGCTAAAGCCTTTTCGGCTATCTCACCGCAAAACGGCCCCTGCCGATTTTCTTGTAATACTTAGGTAACCCATCGTGCTGTAATTAAAGATGGTGGTTTAGGCTCTTTTGGCATATACGGCTGAATTAAAGCATTCATTTCTTGTGTTAAAAGTTGTATTTGAATAGTCAATTCATCTTGCTTTTCTTTTAGTGATAGCAAGCAAGAGATTAATTCGTGCTTGGATAAttt < 1:269541/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |