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cAATTATTGAAAGGCGTAGATACTAATCTGCCGATTATCCTGTTGGATCATCGCCCGTCGGAAATTGAACAGCACGCCAAGCTGCCTATTGATATTCAACTCTCCGGGCACGCCCATAACGGACAAATTTTCCCGGCGAATCTGATCGTGAAATTCATTTACCGTTTAAGTTACGGTTACGAACAAATTAACGGCGTACACTTCTTCGTCACCTCCGGTTATGGCTTTTGGGGCGTTCCGATGCGTTTAgg > 1:368922/1‑251 (MQ=255) ttattGAAAGGCGTAGATACTAATCTGCCGATTATCCTGTTGGATCATCGCCCGTCGGAAATTGAACAGCACGCCAAGCTGCCTATTGATATTCAACTCTCCGGGCACGCCCATAACGGACAAATTTTCCCGGCGAATCTGATCGTGAAATTCATTTACCGTTTAAGTTACGGTTACGAACAAATTAACGGCGTACACTTCTTCGTCACCTCCGGTTATGGCTTTTGGGGCGTTCCGATGCGTTTAGGCt > 1:879038/1‑250 (MQ=255) attGAAAGGCGTAGATACTAATCTGCCGATTATCCTGTTGGATCATCGCCCGTCGGAAATTGAACAGCACGCCAAGCTGCCTATTGATATTCAACTCTCCGGGCACGCCCATaa > 1:142605/1‑114 (MQ=255) ggCGTAGATACTAATCTGCCGATTATCCTGTTGGATCATCGCCCGTCGGAAATTGAACAGCACGCCAAGCTGCCTATTGATATTCAACTCTCCGGGCACGCCCATAACGGACAAATTTTCCCGGCGAATCTGATCGTGAAATTCATTTACCGTTTAAgttacgg > 1:524961/1‑164 (MQ=255) cGTAGATACTAATCTGCCGATTATCCTGTTGGATCATCGCCCGTCGGAAATTGAACAGCACGCCAAGCTGCCTATTGATATTCAACTCTCCGGGCACGCCCATAACGGACAAATTTTCCCGGCGAATCTGAt > 1:410793/1‑132 (MQ=255) cGTAGATACTAATCTGCCGATTATCCTGTTGGATCATCGCCCGTCGGAAATTGAACAGCACGCCAAGCTGCCTATTGATATTCAACTCTCCGGGCACGCCCATAACGGACAAATTTTCCCGGCGAATCTGATCGTGAAATTCATTTACCGTTTAAGTTACGGTTACGAACAAATTAACGGCGTACACTTCTTCGTCACCTCCGGTTATGGCTTTTGGGGCGTTCCGATGCGTTTAGGCTCACAATCGGAAg < 1:571602/251‑1 (MQ=255) aTACTAATCTGCCGATTATCCTGTTGGATCATCGCCCGTCGGAAATTGAACAGCACGCCAAGCTGCCTATTGATATTCAACTCTCCGGGCACGCCCATAAc < 1:318638/101‑1 (MQ=255) aTACTAATCTGCCGATTATCCTGTTGGATCATCGCCCGTCGGAAATTGAACAGCACGCCAAGCTGCCTATTGATATTCAACTCTCCGGGCACGCCCATAAc > 1:408513/1‑101 (MQ=255) aTACTAATCTGCCGATTATCCTGTTGGATCATCGCCCGTCGGAAATTGAACAGCACGCCAAGCTGCCTATTGATATTCAACTCTCCGGGCACGCCCATAACGGACAAATTTTCCCGGCGAATCTGATCGTGAAATTCATTTACCGTTTAAgttacgg < 1:897516/157‑1 (MQ=255) aTACTAATCTGCCGATTATCCTGTTGGATCATCGCCCGTCGGAAATTGAACAGCACGCCAAGCTGCCTATTGATATTCAACTCTCCGGGCACGCCCATAACGGACAAATTTTCCCGGCGAATCTGATCGTGAAATTCATTTACCGTTTAAGTTACGGTTACGAACAAATTAACGGCGTACACTTCTTCGTCACCTCCGGTTATGGCTTTTGGGGCGTTCCGATGCGTTTAGGCTCACAATCGGAAGtgatg > 1:830320/1‑251 (MQ=255) aTACTAATCTGCCGATTATCCTGTTGGATCATCGCCCGTCGGAAATTGAACAGCACGCCAAGCTGCCTATTGATATTCAACTCTCCGGGCACGCCCATAACGGACAAATTTTCCCGGCGAATCTGATCGTGAAATTCATTTACCGTTTAAGTTACGGTTACGAACAAATTAACGGCGTACACTTCTTCGTCACCTCCGGTTATGGCTTTTGGGGCGTTCCGATGCGTTTAGGCTCACAATCGGAAGtgatg < 1:633733/251‑1 (MQ=255) aTACTAATCTGCCGATTATCCTGTTGGATCATCGCCCGTCGGAAATTGAACAGCACGCCAAGCTGCCTATTGATATTCAACTCTCCGGGCACGCCCATAACGGACAAATTTTCCCGGCGAATCTGATCGTGAAATTCATTTACCGTTTAAGTTACGGTTACGAACAAATTAACGGCGTACACTTCTTCGTCACCTCCGGTTATGGCTTTTGGGGCGTTCCGATGCGTTTAGGCTCACAATCGGAAGtgatg > 1:95097/1‑251 (MQ=255) aTACTAATCTGCCGATTATCCTGTTGGATCATCGCCCGTCGGAAATTGAACAGCACGCCAAGCTGCCTATTGATATTCAACTCTCCGGGCACGCCCATAACGGACAAATTTTCCCGGCGAATCTGATCGTGAAATTCATTTACCGTTTAAGTTACGGTTACGAACAAATTAACGGCGTACACTTCTTCGTCACCTCCGGTTATGGCTTTTGGGGCGTTCCGATGCGTTTAGGCTCACAATCGGAAGtgatg < 1:55494/251‑1 (MQ=255) cTAATCTGCCGATTATCCTGTTGGATCATCGCCCGTCGGAAATTGAACAGCACGCCAAGCTGCCTATTGATATTCAACTCTCCGGGCACGCCCATAACGGACAAATTTTCCCGGCGAATCTGATCGTGAAATTCATTTACCGTTTAAGTTACGGTTACGAACAAATTAACGGCGTACACTTCTTCGTCACCTCCGGTTATGGCTTTTGGGGCGTTCCGATGCGTTTAGGCTCACAATCGGAAGTGATGAtt < 1:529366/251‑1 (MQ=255) aaTCTGCCGATTATCCTGTTGGATCATCGCCCGTCGGAAATTGAACAGCACGCCAAGCTGCCTATTGa < 1:323221/68‑1 (MQ=255) tGCCGATTATCCTGTTGGATCATCGCCCGTCGGAAATTGAACAGCACGCCAAGCTGCCTATTGATATTCAACTCTCCGGGCACGCCCATAACGGACAAATTTTCCCGGCGAATCTGATCGTGAAATTCATTTACCGTTTAAGTTACGGTTACGAACAAATTAACGGCGTACACTTCTTCGTCACCTCCGGTTATGGCTTTTGGGGCGTTCCGATGCGTTTAGGCTCACAATCGGAAGTGATGATTATCGAc < 1:544716/251‑1 (MQ=255) aTCCTGTTGGATCATCGCCCGTCGGAAATTGAACAGCACGCCAAGCTGCCTATTGATATTCAACTCTCCGGGCACGCCCATAACGGACAAATTTTCCCGGCGAATCTGATCGTGAAATTCATTTACCGTTTAAGTTACGGTTACGAACAAATTAACGGCGTacac < 1:578231/165‑1 (MQ=255) aTCCTGTTGGATCATCGCCCGTCGGAAATTGAACAGCACGCCAAGCTGCCTATTGATATTCAACTCTCCGGGCACGCCCATAACGGACAAATTTTCCCGGCGAATCTGATCGTGAAATTCATTTACCGTTTAAGTTACGGTTACGAACAAATTAACGGCGTACACTTCTTCGTCACCTCCGGTTATGGCTTTTGGGGCGTTCCGATGCGTTTAGGCTCACAATCGGAAg > 1:885475/1‑229 (MQ=255) cTGTTGGATCATCGCCCGTCGGAAATTGAACAGCACGCCAAGCTGCCTATTGATATTCAACTCTCCGGGCACGCCCATAACGGACAAATTTTCCCGGCGAATCTGATCGTGAAATTCATTTACCGTTTAAGTTACGGTTACGAACAAATTAACGGCGTACACTTCTTCGTCACCTCCGGTTATGGCTTTTGGGGCGTTCCGATGCGTTTAGGCTCACAATCGGAAGTGATGATTATCGACGTGGTTGGAAg > 1:811608/1‑251 (MQ=255) cTGTTGGATCATCGCCCGTCGGAAATTGAACAGCACGCCAAGCTGCCTATTGATATTCAACTCTCCGGGCACGCCCATAACGGACAAATTTTCCCGGCGAATCTGATCGTGAAATTCATTTACCGTTTAAGTTACGGTTACGAACAAATTAACGGCGTACACTTCTTCGTCACCTCCGGTTATGGCTTTTGGGGCGTTCCGATGCGTTTAGGCTCACAATCGGAAGTGATGATTATCGACGTGGTTGGAAg > 1:95177/1‑251 (MQ=255) cTGTTGGATCATCGCCCGTCGGAAATTGAACAGCACGCCAAGCTGCCTATTGATATTCAACTCTCCGGGCACCCCCATAACGGACAAATTTTCCCGGCGAATCTGATCGTGAAATTCATTTACCGTTTAAGTTACGGTTACGAACAAATTAACGGCGTACACTTCTTCGTCACCTCCGGTTATGGCTTTTGGGGCGTTCCGATGCGTTTAGGCTCACAATCGGAAGTGATGATTATCGACGTGGTTGGAAg > 1:200152/1‑251 (MQ=255) atcatcGCCCGTCGGAAATTGAACAGCACGCCAAGCTGCCTATTGATATTCAACTCTCCGGGCACGCCCATAACGGACAAATTTTCCCGGCGAATCTGATCGTGAAATTCATTTACCGTTTAAGTTACGGTTACGAACAAATTAACGGCGTACACTTCTTCGTCACCTCCGGTTATGGCTTTTGGGGCGTTCCGATGCGTTTAGGc > 1:267475/1‑206 (MQ=255) | ACTGAAAGCCCCGCTCGGCGTCTATGCCACCCTTGGCAATCATGATTTTTTCGGCGATCAGGCGCGCATTGAGCGGGAAATTCGGAATGCCGGTATTATTCCGCTGATGGATGAAAGCCTGGTGGTGGATAATCGCTTTGTGTTAATCGGGCGCAACGATGATTTAGTGACCAACCGCCCCTCTACGGAACAATTATTGAAAGGCGTAGATACTAATCTGCCGATTATCCTGTTGGATCATTGCCCGTCGGAAATTGAACAGCACGCCAAGCTGCCTATTGATATTCAACTCTCCGGGCACGCCCATAACGGACAAATTTTCCCGGCGAATCTGATCGTGAAATTCATTTACCGTTTAAGTTACGGTTACGAACAAATTAACGGCGTACACTTCTTCGTCACCTCCGGTTATGGCTTTTGGGGCGTTCCGATGCGTTTAGGCTCACAATCGGAAGTGATGATTATCGACGTGGTTGGAAG > 1/1421719‑1422198 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |