| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 190,963 | G→T | intergenic (‑130/‑65) | unknown ← / → unknown | Transcriptional regulator for fatty acid degradation FadR, GntR family/Na+/H+ antiporter NhaB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 190,963 | 0 | G | T | 100.0% | 126.4 / NA | 45 | intergenic (‑130/‑65) | unknown/unknown | Transcriptional regulator for fatty acid degradation FadR, GntR family/Na+/H+ antiporter NhaB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (14/31); total (14/31) | |||||||||||
GGTAAATCCGAACCGGGTGGGAAATGATTATTCCAAATGCTTTTTACAATGTATTCTTCTGCTAATGCCGCCGGGCTTTGTGCTTTCAGAAGGGGGGAATTGTTATTCATAGTAATTCGGTATTATCAGTAGTTATCAAATAAAAAACGGCTTTATTATCGTTGAAACGACTATACATTACAATTAGATAATTATTTTTTAAATTCGTTGACATCATCTGCTATTTTTGACACAGTTTAGCGCTGAACTACCTTGAACGGTATTAGGTTAATATATTGTTAATTAAGAAATTAAGGTCAACTTTATGGATAGTAATTATACACAGGCATTTTTTAAAAACTTTCTTGGTTCTAGCCCGGGCTGGTATAAAATAGCGATCGTCGCATTTCTTGTCATTAATCCCGTCTTATTTGCTATTTCACCTTTTTGGGCGGGGTGGTTATTAGTCATTGAATTCATTTTCACCCTAGCTATGGCGCTAAAAT > 1/190724‑191208 | ggTAAATCCGAACCGGGTGGGAAATGATTATTCCAAATGCTTTTTACAATGTATTCTTCTGCTAATGCCGCCGGGCTTTGTGCTTTCAGAAGGGGGGAATTGTTATTCATAGTAATTCGGTATTATCAGTAGTTATCAAATAAAAAACGGCTTTATTATCGTTGAAACGACTATACATTACAATTAGATAATTATTTTTTAAATTCGTTGACATCATCTGCTATTTTTGACACAGTTTATCGCTGAACTa > 1:153258/1‑250 (MQ=255) 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GGTAAATCCGAACCGGGTGGGAAATGATTATTCCAAATGCTTTTTACAATGTATTCTTCTGCTAATGCCGCCGGGCTTTGTGCTTTCAGAAGGGGGGAATTGTTATTCATAGTAATTCGGTATTATCAGTAGTTATCAAATAAAAAACGGCTTTATTATCGTTGAAACGACTATACATTACAATTAGATAATTATTTTTTAAATTCGTTGACATCATCTGCTATTTTTGACACAGTTTAGCGCTGAACTACCTTGAACGGTATTAGGTTAATATATTGTTAATTAAGAAATTAAGGTCAACTTTATGGATAGTAATTATACACAGGCATTTTTTAAAAACTTTCTTGGTTCTAGCCCGGGCTGGTATAAAATAGCGATCGTCGCATTTCTTGTCATTAATCCCGTCTTATTTGCTATTTCACCTTTTTGGGCGGGGTGGTTATTAGTCATTGAATTCATTTTCACCCTAGCTATGGCGCTAAAAT > 1/190724‑191208 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |