| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,407,178 | A→G | intergenic (‑90/‑51) | unknown ← / → unknown | Heat shock protein GrpE/NAD kinase (EC 2.7.1.23) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,407,178 | 0 | A | G | 100.0% | 251.8 / NA | 87 | intergenic (‑90/‑51) | unknown/unknown | Heat shock protein GrpE/NAD kinase (EC 2.7.1.23) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (27/60); total (27/60) | |||||||||||
AGGTTTCGGCAAGTTGAGCTTCTAACTCCTGAACACGCGCAATGGCTTCTTCCAACGGGTCTTCACCCTGTTCTTTTAGTTCATCAACAACGTCTTCCGGTTGAATCTCTTGTTCCAATTCGTGCTGATTATCTGCGCTTTGGTGGTTTGTCATTCTTATTTCTCCTTGAGTCAAATTTGGGCGATTATAGCAAAAAATCTTAAACTTACCATGTGCGCCGACTGGCAAGCAAAAGGCGTTCTATTGTAATATAATGCCCAATTTTCCGAATTCAAGTTAATCACAAGATAAATATGGATACCTTAAATGCGGTGAAACCGCACAGCTTACACACGTCATTTCAGACCATTGGTTTGGTGGGGAAACCGAGAAATGACTTAAACCTGCAAATGCATAAAAACCTGTTTTTTTGGCTGTTGGAGCACGGTTATCATGTTCTGGTTGAACGGGAAATCGGGGAAAAAATCGAACTTCCGCCGAAACATTTG > 1/1406935‑1407423 | aGGTTTCGGCAAGTTGAGCTTCTAACTCCTGAACACGCGCAATGGCTTCTTCCAACGGGTCTTCACCCTGTTCTTTTAGTTCATCAACAACGTCTTCCGGTTGAATCTCTTGTTCCAATTCGTGCTGATTATCTGCGCTTTGGTGGTTTGTCATTCTTATTTCTCCTTGAGTCAAATTTGGGCGATTATAGCAAAAAATCTTAAACTTACCATGTGCGCCGACTGGCAAGCAAAAGGCGTTCTGTTGTaa < 1:664097/250‑1 (MQ=255)aGGTTTCGGCAAGTTGAGCTTCTAACTCCTGAACACGCGCAATGGCTTCTTCCAACGGGTCTTCACCCTGTTCTTTTAGTTCATCAACAACGTCTTCCGGTTGAATCTCTTGTTCCAATTCGTGCTGATTATCTGCGCTTTGGTGGTTTGTCATTCTTATTTCTCCTTGAGTCAAATTTGGGCGATTATAGCAAAAAATCTTAAACTTACCATGTGCGCCGACTGGCAAGCAAAAGGCGTTCTGTTGTaa < 1:68716/250‑1 (MQ=255)aGGTTTCGGCAAGTTGAGCTTCTAACTCCTGAACACGCGCAATGGCTTCTTCCAACGGGTCTTCACCCTGTTCTTTTAGTTCATCAACAACGTCTTCCGGTTGAATCTCTTGTTCCAATTCGTGCTGATTATCTGCGCTTTGGTGGTTTGTCATTCTTATTTCTCCTTGAGTCAAATTTGGGCGATTATAGCAAAAAATCTTAAACTTACCATGTGCGCCGACTGGCAAGCAAAAGGCGTTCTGTTGTaa < 1:839913/250‑1 (MQ=255) gTTTCGGCAAGTTGAGCTTCTAACTCCTGAACACGCGCAATGGCTTCTTCCAACGGGTCTTCACCCTGTTCTTTTAGTTCATCAACAACGTCTTCCGGTTGAATCTCTTGTTCCAATTCGTGCTGATTATCTGCGCTTTGGTGGTTTGTCATTCTTATTTCTCCTTGAGTCAAATTTGGGCGATTATAGCAAAAAATCTTAAACTTACCATGTGCGCCGACTGGCAAGCAAAAGGCGTTCTGTTGTAat < 1:692589/249‑1 (MQ=255) 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cgcTTTGGTGGTTTGTCATTCTTATTTCTCCTTGAGTCAAATTTGGGCGATTATAGCAAAAAATCTTAAACTTACCATGTGCGCCGACTGGCAAGCAAAAGGCGTTCTGTTGTAATATAATGCCCAATTTTCCGAATTCAAGTTAATCACAAGATAAATATGGATACCTTAAATGCGGTGAAACCGCACAGCTTACACACGTCATTTCAGACCATTGGTTTGGTGGGGAAACCGAGAAATGACTTAAAcc < 1:842510/250‑1 (MQ=255) gcTTTGGTGGTTTGTCATTCTTATTTCTCCTTGAGTCAAATTTGGGCGATTATAGCAAAAAATCTTAAACTTACCATGTGCGCCGACTGGCAAGCAAAAGGCGTTCTGTTGTAATATAATGCCCAATTTTCCGAATTCAAGTTAATCACAAGATAAATATGGATACCTTAAATGCGGTGAAACCGCACAGCTTACACACGTCATTTCAGACCATTGGTTTGGTGGGGAAACCGAGAAATGACTTAAAc > 1:563369/1‑248 (MQ=255) cTTTGGTGGTTTGTCATTCTTATTTCTCCTTGAGTCAAATTTGGGCGATTATAGCAAAAAATCTTAAACTTACCATGTGCGCCGACTGGCAAGCAAAAGGCGTTCTGTTGTAATATAATGCCCAATTTTCCGAATTCAAGTTAATCACAAGATAAATATGGATACCTTAAATg < 1:640323/173‑1 (MQ=255) tggtTTGTCATTCTTATTTCTCCTTGAGTCAAATTTGGGCGATTATAGCAAAAAATCTTAAACTTACCATGTGCGCCGACTGGCAAGCAAAAGGCGTTCTGTTGTAATATAATGCCCAATTTTCCGAATTCAAGTTAATCACAAGATAAATATGGATACCTTAAATGCGGTGAAACCGCACAGCTTACACACGTCATTTCAGACCATTGGTTTGGTGGGGAAACCGAGAAATGACTTAAACCTGCAAATg < 1:354869/250‑1 (MQ=255) ggtTTGTCATTCTTATTTCTCCTTGAGTCAAATTTGGGCGATTATAGCAAAAAATCTTAAACTTACCATGTGCGCCGACTGGCAAGCAAAAGGCGTTCTGTTGTAATATAATGCCCAATTTTCCGAATTCAAGTTAATCACAAGATAAATATGGATACCTTAAATGCGGTGAAAc < 1:178729/175‑1 (MQ=255) tGTCATTCTTATTTCTCCTTGAGTCAAATTTGGGCGATTATAGCAAAAAATCTTAAACTTACCATGTGCGCCGACTGGCAAGCAAAAGGCGTTCTGTTGTAATATAATGCCCAATTTTCCGAATTCAAGTTAATCACAAGATAAATATGGATACCTTAAATGCGGTGAAACCGCACAGCTTACACACGTCATTTCAGACCATTGGTTTGGTGGGGAAACCGAGAAATGACTTAAACCTGCAAATGCATaaa < 1:713721/251‑1 (MQ=255) gTCATTCTTATTTCTCCTTGAGTCAAATTTGGGCGATTATAGCAAAAAATCTTAAACTTACCATGTGCGCCGACTGGCAAGCAAAAGGCGTTCTGTTGTAatat < 1:505113/104‑1 (MQ=255) ttCTTATTTCTCCTTGAGTCAAATTTGGGCGATTATAGCAAAAAATCTTAAACTTACCATGTGCGCCGACTGGCAAGCAAAAGGCGTTCTGTTGTAATATAATGCCCAATTTTCCGAATTCAAGTTAATCACAAGATAAATATGGATACCTTAAATGCGGTGAAACCGCACAGCTTACACACGTCATTTCAGACCATTGGTTTGGTGGGGAAACCGAGAAATGACTTAAACCTGCAAATGCATAAAAAc > 1:373959/1‑249 (MQ=255) aaTTTGGGCGATTATAGCAAAAAATCTTAAACTTACCATGTGCGCCGACTGGCAAGCAAAAGGCGTTCTGTTGTAATATAATGCCCAATTTTCCGAATTCAAGTTAATCACAAGATAAATATGGATACCTTAAATGCGGTGAAACCGCACAGCTTACACACGTCATTTCAGACCATTGGTTTGGTGGGGAAACCGAGAAATGACTTAAACCTGCAAATGCATAAAAACCTGTTTTTTTGGCTGTTGGAGCa < 1:6459/251‑1 (MQ=255) ttATAGCAAAAAATCTTAAACTTACCATGTGCGCCGACTGGCAAGCAAAAGGCGTTCTGTTGTAATATAATGCCCAATTTTCCGAATTCAAGTTAATCACAAGATAAATATGGATACCTTAAATGCGGTGAAACCGCACAGCTTacac > 1:645315/1‑148 (MQ=255) ttATAGCAAAAAATCTTAAACTTACCATGTGCGCCGACTGGCAAGCAAAAGGCGTTCTGTTGTAATATAATGCCCAATTTTCCGAATTCAAGTTAATCACAAGATAAATATGGATACCTTAAATGCGGTGAAACCGCACAGCTTACACACGTCATTTCAGACCATTGGTTTGGTGGGGAAACCGAGAAATGACTTAAACCTGCAAATGCATAAAAACCTGTTTTTTTGGCTGTTGGAGCACGGTTATCATg < 1:601997/251‑1 (MQ=255) ttATAGCAAAAAATCTTAAACTTACCATGTGCGCCGACTGGCAAGCAAAAGGCGTTCTGTTGTAATATAATGCCCAATTTTCCGAATTCAAGTTAATCACAAGATAAATATGGATACCTTAAATGCGGTGAAACCGCACAGCTTACACACGTCATTTCAGACCATTGGTTTGGTGGGGAAACCGAGAAATGACTTAAACCTGCAAATGCATAAAAACCTGTTTTTTTGGCTGTTGGAGCACGGTTATCATg < 1:185404/251‑1 (MQ=255) ttATAGCAAAAAATCTTAAACTTACCATGTGCGCCGACTGGCAAGCAAAAGGCGTTCTGTTGTAATATAATGCCCAATTTTCCGAATTCAAGTTAATCACAAGATAAATATGGATACCTTAAATGCGGTGAAACCGCACAGCTTACACACGTCATTTCAGACCATTGGTTTGGTGGGGAAACCGAGAAATGACTTAAACCTGCAAATGCATAAAAACCTGTTTTTTTGGCTGTTGGAGCACGGTTATCATg < 1:872155/251‑1 (MQ=255) ataGCAAAAAATCTTAAACTTACCATGTGCGCCGACTGGCAAGCAAAAGGCGTTCTGTTGTAATATAATGCCCAATTTTCCGAATTCAAGTTAATCACAAGATAAATATGGATACCTTAAATGCGGTGAAACCGCACAGCTTACACACGTCATTTCAGACCATTGGTTTGGTGGGGAAACCGAGAAATGACTTAAACCTGCAAATGCATAAAAACCTGTTTTTTTGGCTGTTGGAGCACGGTTATCATGtt < 1:741118/251‑1 (MQ=255) taGCAAAAAATCTTAAACTTACCATGTGCGCCGACTGGCAAGCAAAAGGCGTTCTGTTGTAATATAATGCCCAATTTTCCGAATTCAAGTTAATCACAAGATAAATATGGATACCTTAAATGCGGTGAAACCGCACAGCTTACACACGTCATTTCAGACCATTGGTTTGGTGGGGAAACCGAGAAATGACTTAAACCTGCAAATGCATAAAAACCTGTTTTTTTGGCTGTTGGAGCACGGTTATCATGtt > 1:224567/1‑250 (MQ=255) aTCTTAAACTTACCATGTGCGCCGACTGGCAAGCAAAAGGCGTTCTGTTGTAATATAATGCCCAATTTTCCGAATTCAAGTTAATCACAAGATAAATATGGATACCTTAAATGCGGTGAAACCGCACAGCTTACACACGTCATTTCAGACCATTGGTTTGGTGGGGAAACCGAGAAATGACTTAAACCTGCAAATGCATAAAAACCTGTTTTTTTGGCTGTTGGAGCACGGTTATCATGTTCTGGTTGaa > 1:622171/1‑250 (MQ=255) aaCTTACCATGTGCGCCGACTGGCAAGCAAAAGGCGTTCTGTTGTAATATAATGCCCAATTTTCCGAATTCAAGTTAATCACAAGATAAATATGGATACCTTAAATGCGGTGAAACCGCACAGCTTACACACGTCATTTCAGACCATTGGTTTGGTGGGGAAACCGAGAAATGACTTAAACCTGCAAATGCATAAAAACCTGTTTTTTTGGCTGTTGGAGCACGGTTATCATGTTCTGGTTGAACGGGaaa > 1:55851/1‑251 (MQ=255) 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AGGTTTCGGCAAGTTGAGCTTCTAACTCCTGAACACGCGCAATGGCTTCTTCCAACGGGTCTTCACCCTGTTCTTTTAGTTCATCAACAACGTCTTCCGGTTGAATCTCTTGTTCCAATTCGTGCTGATTATCTGCGCTTTGGTGGTTTGTCATTCTTATTTCTCCTTGAGTCAAATTTGGGCGATTATAGCAAAAAATCTTAAACTTACCATGTGCGCCGACTGGCAAGCAAAAGGCGTTCTATTGTAATATAATGCCCAATTTTCCGAATTCAAGTTAATCACAAGATAAATATGGATACCTTAAATGCGGTGAAACCGCACAGCTTACACACGTCATTTCAGACCATTGGTTTGGTGGGGAAACCGAGAAATGACTTAAACCTGCAAATGCATAAAAACCTGTTTTTTTGGCTGTTGGAGCACGGTTATCATGTTCTGGTTGAACGGGAAATCGGGGAAAAAATCGAACTTCCGCCGAAACATTTG > 1/1406935‑1407423 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |