| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,393,726 | A→G | V307V (GTA→GTG) | unknown → | Galactose operon repressor, GalR‑LacI family of transcriptional regulators |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,393,726 | 0 | A | G | 100.0% | 271.9 / NA | 95 | V307V (GTA→GTG) | unknown | Galactose operon repressor, GalR‑LacI family of transcriptional regulators |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (35/60); total (35/60) | |||||||||||
AGCCATGATTAACCTCTTGAGTTATAACGACAATCTCACGGCAGTGGTGGCGTATAACGATTCCATGGCGGCGGGCGCGTTATCCGTCTTAAATGAAAACAATATCAAAGTGCCGAAGCAATTTTCCATTATCGGCTTTGACGATATGCCTATCGCCCGCTATTTGGTACCGAAATTAACTACTATTCGCTATCCCATTGATCTCATGGCGAATTATGCAGCAAAACTGGCACTAGGTCTGGTAGATATGGACATTTGCCTGCCCATTAACCCCCAATTCAATCCGACCTTGGTTCAACGTTTTTCCGTCGAAAATATACATCACACGGGAGAATAACGCTAAATTTTAACTATTTTTTACATTAAAGATGTAATCGTTTTCATAAATGTGAATATGATCACAGTCTTGAAACATAAAAACCTGTATGCTACGTCCAATTACCTGAGTACCGATTGCAGTGTAAAAAGGTAAGAATTGATAATAATT > 1/1393483‑1393969 | agCCATGATTAACCTCTTGAGTTATAACGACAATCTCACGGCAGTGGTGGCGTATAACGATTCCATGGCGGCGGGCGCGTTATCCGTCTTAAATGAAAACAATATCAAAGTGCCGAAGCAATTTTCCATTATCGGCTTTGACGATATGCCTATCGCCCGCTATTTGGTACCGAAATTAACTACTATTCGCTATCCCATTGATCTCATGGCGAATTATGCAGCAAAACTGGCACTAGGTCTGGTGGATATgg > 1:594334/1‑251 (MQ=255) ccATGATTAACCTCTTGAGTTATAACGACAATCTCACGGCAGTGGTGGCGTATAACGATTCCATGGCGGCGGGCGCGTTATCCGTCTTAAATGAAAACAATATCAAAGTGCCGAAGCAATTTTCCATTATCGGCTTTGACGATATGCCTATCGCCCGCTATTTGGTACCGAAATTAACTACTATTCGCTATCCCATTGATCTCATGGCGAATTATGCAGCAAAACTGGCACTAGGTCTGGTGGATATGGAc < 1:786151/251‑1 (MQ=255) ccATGATTAACCTCTTGAGTTATAACGACAATCTCACGGCAGTGGTGGCGTATAACGATTCCATGGCGGCGGGCGCGTTATCCGTCTTAAATGAAAACAATATCAAAGTGCCGAAGCAATTTTCCATTATCGGCTTTGACGATATGCCTATCGCCCGCTATTTGGTACCGAAATTAACTACTATTCGCTATCCCATTGATCTCATGGCGAATTATGCAGCAAAACTGGCACTAGGTCTGGTGGATATGGAc < 1:743867/251‑1 (MQ=255) tGATTAACCTCTTGAGTTATAACGACAATCTCACGGCAGTGGTGGCGTATAACGATTCCATGGCGGCGGGCGCGTTATCCGTCTTAAATGAAAACAATATCAAAGTGCCGAAGCAATTTTCCATTATCGGCTTTGACGATATGCCTATCGCCCGCTATTTGGTACCGAAATTAACTACTATTCGCTATCCCATTGATCTCATGGCGAATTATGCAGCAAAACTGGCACTAGGTCTGGTGGatat < 1:19135/244‑1 (MQ=255) tAACCTCTTGAGTTATAACGACAATCTCACGGCAGTGGTGGCGTATAACGATTCCATGGCGGCGGGCGCGTTATCCGTCTTAAATGAAAACAATATCAAAGTGCCGAAGCAATTTTCCATTATCGGCTTTGACGATATGCCTATCGCCCGCTATTTGGTACCGAAATTAACTACTATTCGCTATCCCATTGATCTCATGGCGAATTATGCAGCAAAACTGGCACTAGGTCTGGTGGATATGGACATTtgcc < 1:213250/251‑1 (MQ=255) ccTCTTGAGTTATAACGACAATCTCACGGCAGTGGTGGCGTATAACGATTCCATGGCGGCGGGCGCGTTATCCGTCTTAAATGAAAACAATATCAAAGTGCCGAAGCAATTTTCCATTATCGGCTTTGACGATATGCCTATCGCCCGCTATTTGGTACCGAAATTAACTACTATTCGCTATCCCATTGATCTCATGGCGAATTATGCAGCAAAACTGGCACTAGGTCTGGTGGATATGGACATTtgcctg > 1:691537/1‑250 (MQ=255) ccTCTTGAGTTATAACGACAATCTCACGGCAGTGGTGGCGTATAACGATTCCATGGCGGCGGGCGCGTTATCCGTCTTAAATGAAAACAATATCAAAGTGCCGAAGCAATTTTCCATTATCGGCTTTGACGATATGCCTATCGCCCGCTATTTGGTACCGAAATTAACTACTATTCGCTATCCCATTGATCTCATGGCGAATTATGCAGCAAAACTGGCACTAGGTCTGGTGGATATGGACATTtgcctg > 1:742910/1‑250 (MQ=255) ccTCTTGAGTTATAACGACAATCTCACGGCAGTGGCGGCGTATAACGATTCCATGGCGGCGGGCGCGTTATCCGCCTTAAATGAAAACAATATCAAAGTGCCGAAGCAATTTTCCATTATCGGCTTTGACGATATGCCCATCGCCCGCTATTTGGTACCGTAATTAACTACTATTCGCTATCTCATTGATCTCATGGCGAATTATGCAGCAAAACTGGCACTAGGTCTGGTGGATATGGACATTtgcccg > 1:586316/1‑248 (MQ=255) tctTGAGTTATAACGACAATCTCACGGCAGTGGTGGCGTATAACGATTCCATGGCGGCGGGCGCGTTATCCGTCTTAAATGAAAACAATATCAAAGTGCCGAAGCAATTTTCCATTATCGGCTTTGACGATATGCCTATCGCCCGCTATTTGGTACCGAAATTAACTACTATTCGCTATCCCATTGATCTCATGGCGAATTATGCAGCAAAACTGGCACTAGGTCTGGTGGATATGGACATTTGCCTGccc < 1:817325/251‑1 (MQ=255) tctTGAGTTATAACGACAATCTCACGGCAGTGGTGGCGTATAACGATTCCATGGCGGCGGGCGCGTTATCCGTCTTAAATGAAAACAATATCAAAGTGCCGAAGCAATTTTCCATTATCGGCTTTGACGATATGCCTATCGCCCGCTATTTGGTACCGAAATTAACTACTATTCGCTATCCCATTGATCTCATGGCGAATTATGCAGCAAAACTGGCACTAGGTCTGGTGGATATGGACATTTGCCTGccc < 1:882395/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |