| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 1,385,917 | A→C | I43I (ATA→ATC) | unknown → | 2‑oxoglutarate/malate translocator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,385,917 | 0 | A | C | 99.0% | 284.7 / ‑4.9 | 103 | I43I (ATA→ATC) | unknown | 2‑oxoglutarate/malate translocator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base C (52/50); minor base T (0/1); total (52/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.95e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
CTGACACAAGCCTTAATGAAATTTGATGCTGCCTGCATTGCGCGAAATTTAAGCGCAGGCGGTAGCGCCGATTTGTTGGCGCTGATGATTTTCTTTCAAACTTTAAGAGGTAATTCACATGGCATTATCTAAAAATGCAAAACTGGCGATCTTGGTAGCCATACCGTTGGTCACCTTTATTTTGCCGGCGCCGGAGGGACTTTCTCTGATCGCCTGGCGTTTACTTGGGGTTTATATCGCCACCATAGTCGGCTTGGTGTTAAAACCGTACGGCGAACCGGTAATCTTGCTGGCGGCGGTTGCGGTGTCCGGCGCGATTATCGGTAATACTAGCGGTGCAGCAGAATTTCTGAAAGCCGGCGACATTCTCAACGGTTATAAATCAGGCACCACGTGGTTGATTTTTACCGCCTTCACATTAAGCTCCGCGTTCGTTATCACCGGTCTCGGTAAACGTATTGCTTATCACATGATCGGCGCCATGGGTAGCAC > 1/1385671‑1386162 | cTGACACAAGCCTTAATGAAATTTGATGCTGCCTGCATTGCGCGAAATTTAAGCGCAGGCGGTAGCGCCGATTTGTTGGCGCTGATGATTTTCTTTCAAACTTTAAGAGGTAATTCACATGGCATTATCTAAAAATGCAAAACTGGCGATCTTGGTAGCCATACCGTTGGTCACCTTTATTTTGCCGGCGCCGGAGGGACTTTCTCTGATCGCCTGGCGTTTACTTGGGGTTTATATCGCCACCAtcgtcg < 1:875861/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |