| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,375,542 | G→C | P12A (CCG→GCG) | unknown ← | Nucleoside diphosphate kinase (EC 2.7.4.6) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,375,542 | 0 | G | C | 100.0% | 335.6 / NA | 116 | P12A (CCG→GCG) | unknown | Nucleoside diphosphate kinase (EC 2.7.4.6) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (62/54); total (62/54) | |||||||||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
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1:831245/166‑1 (MQ=255) | TAGTACTGCCAATTAAAGTGCGGTAATCCTGCACGGCGTTTTCTTTTTCCAATACGCTAACCAACACAGGGGCGGATGTCATGTATTCCACCAACGACAC‑AAAAAAAGGTTTGCCTTGGTGTTCGACATAAAAACCTTCCGCCTGCTCCTGCGTTAAATGCAACATTTTTGCTGCCACAATTTTAAAACCCTGTTGCTCAAAGCGCGCCAAAATTGCGCCGACTAAGTGGCGTTTCACCGCATCCGGTTTAATAATGGATAATGTTCGTTGTAAGCTCATGTAACCTCCTCTTACTGTTGATTTGCTTTAGTAATTAATAGATTGGCTAAAGTTTGCACACCAATACCGGTGGCACCGGTCGCCCATAAATCGCTTGGCGTTTTGCGATAGGTGGCGGAGCAATCAATGTGCAGCCAATGCTGTTGATAATTTTTCACGAAATAGGATAAAAAAGCGGTGGCAGTGCTGGCACCTGCGCCGATGGGAAC > 1/1375296‑1375784 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |