| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,372,742 | C→T | H26Y (CAC→TAC) | unknown → | [4Fe‑4S] cluster assembly scaffold protein Mrp (=ApbC) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,372,742 | 0 | C | T | 100.0% | 212.7 / NA | 78 | H26Y (CAC→TAC) | unknown | [4Fe‑4S] cluster assembly scaffold protein Mrp (=ApbC) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (45/33); total (45/33) | |||||||||||
AATATTAACCTTAAGAATTCGTGAAAAACAGGGAAAAAATTGGCGCTTATGTTACCTTATTGAGGGTATTTTTTCTAGTTTAATCATGGTTTAGACATTTTTAACTTAACAGATAAAGGCGGGAGTGATTAAATATAGCGAACTAATTTGCTACATTAGAAAGGACGACATTATGGCGACGTTATTTTCAGAAAATTTAACGGAACAACAAAAGAAACGGATTGTTCGGTTATTCAAAGACTTTCAACACCCTACCCTGCAAAAAGATCTCATTTCCCTCAATACCTTAAAGAAAGTTGAAAAAGGCGGCGACACCTTACGCATTGAAATCACCATGCCTTTTGCATGGAACACCGCCTTTGCGGACTTAAAAAATGCTTTGACCGCACCGTTAAAACAGATAGCGGACGCAAAAAACGCGAAATGGCAGCTTAACTACCAAATCGCCACCTTAAAACGCGCCAACAATCACCCGGCGGTAAAAGGCGTGA > 1/1372495‑1372985 | aataTTAACCTTAAGAATTCGTGAAAAACAGGGAAAAAATTGGCGCTTATGTTTCCTTATTGAGGGTATTTTTTCTAGTTTAATCATTGTTTAGACATTTTTAACTTAACAGATAAAGGCGGGAGTGATTAAATATAGCGAACTAATTTGCTACATTAGAAAGGACGACATTATGGCGACGTTATTTTCAGAAAATTTAACGGAACAACAAAAGAAACGGATTGTTCGGTTATTCAAAGACTTTCAATacc < 1:241228/251‑1 (MQ=255) 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ttGCTACATTAGAAAGGACGACATTATGGCGACGTTATTTTCAGAAAATTTAACGGAACAACAAAAGAAACGGATTGTTCGGTTATTCAAAGACTTTCAATACCCTACCCTGCAAAAAGATCTCATTTCCCTCAATACCTTAAAGAAAGTTGAAAAAGGCGGCGACACCTTACGCATTGAAATCACCATGCCTTTTGCATGGAACACCGCCTTTGCGGACTTAAAAAATGCTTTGACCGCACCGTTAAAAc < 1:709586/251‑1 (MQ=255) cTACATTAGAAAGGACGACATTATGGCGACGTTATTTTCAGAAAATTTAACGGAACAACAAAAGAAACGGATTGTTCGGTTATTCAAAGACTTTCAATACCCTACCCTGCAAAAAGATCTCATTTCCCTCAATACCTTAAAGAAAGTTGAAAAAGGCGGCGACACCTTACGCATTGAAATCACCATGCCTTTTGCATGGAACACCGCCTTTGCGGACTTAAAAAATGCTTTGACCGCACCGTTAAAACAg < 1:558158/250‑1 (MQ=255) aCATTAGAAAGGACGACATTATGGCGACGTTATTTTCAGAAAATTTAACGGAACAACAAAAGAAACGGATTGTTCGGTTATTCAAAGACTTTCAATACCCTACCCTGCAAAAAGATCTCATTTCCCTCAATACCTTAAAGAAAGTTGAAAAAGGCGGCGACACCTTACGCATTGAAATc > 1:388663/1‑179 (MQ=255) aCATTAGAAAGGACGACATTATGGCGACGTTATTTTCAGAAAATTTAACGGAACAACAAAAGAAACGGATTGTTCGGTTATTCAAAGACTTTCAATACCCTACCCTGCAAAAAGATCTCATTTCCCTCAATACCTTAAAGAAAGTTGAAAAAGGCGGCGACACCTTACGCATTGAAATCACCATGCCTTTTGCATGGAACACCGcc < 1:793797/206‑1 (MQ=255) 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1:869722/1‑251 (MQ=255) ggACGACATTATGGCGACGTTATTTTCAGAAAATTTAACGGAACAACAAAAGAAACGGATTGTTCGGTTATTCAAAGACTTTCAATACCCTACCCTGCAAAAAGATCTCATTTCCCTCAATACCTTAAAGAAAGTTGAAAAAGGCGGCGACACCTTACGCATTGAAATCACCATGCCTTTTGCATGGAACACCGCCTTTGCGGACTTAAAAAATGCTTTGACCGCACCGTTAAAACAGATAGCGGACGCaa > 1:192937/1‑251 (MQ=255) acATTATGGCGACGTTATTTTCAGAAAATTTAACGGAACAACAAAAGAAACGGATTGTTCGGTTATTCAAAGACTTTCAATACCCTACCCTGCAAAAAGATCTCATTTCCCTCAATAc > 1:95905/1‑118 (MQ=255) acATTATGGCGACGTTATTTTCAGAAAATTTAACGGAACAACAAAAGAAACGGATTGTTCGGTTATTCAAAGACTTTCAATACCCTACCCTGCAAAAAGATCTCATTTCCCTCAATACCTTAAAGAAAGTTGAAAAAGGCGGCGACACCTTACGCATTGAAATCACCATGCCTTTTGCATGGAac > 1:573123/1‑185 (MQ=255) acATTATGGCGACGTTATTTTCAGAAAATTTAACGGAACAACAAAAGAAACGGATTGTTCGGTTATTCAAAGACTTTCAATACCCTACCCTGCAAAAAGATCTCATTTCCCTCAATACCTTAAAGAAAGTTGAAAAAGGCGGCGACACCTTACGCATTGAAATCACCATGCCTTTTGCATGGAac < 1:411730/185‑1 (MQ=255) 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acATTATGGCGACGTTATTTTCAGAAAATTTAACGGAACAACAAAAGAAACGGATTGTTCGGTTATTCAAAGACTTTCAATACCCTACCCTGCAAAAAGATCTCATTTCCCTCAATACCTTAAAGAAAGTTGAAAAAGGCGGCGACACCTTACGCATTGAAATCACCATGCCTTTTGCATGGAACACCGCCTTTGCGGACTTAAAAAATGCTTTGACCGCACCGTTAAAACAGATAGCGGACGCaaaaaa > 1:668647/1‑250 (MQ=255) gCGACGTTATTTTCAGAAAATTTAACGGAACAACAAAAGAAACGGATTGTTCGGTTATTCAAAGACTTTCAATACCCTACCCTGCAAAAAGATCTCATTTCCCTCAATACCTTAAAGAAAGTTGAAAAAGGCGGCGACACCTTACGCATTGAAATCACCATGCCTTTTGCATGGAACACCGCCTTTGCGGACTTAAAAAATGCTTTGACCGCACCGTTAAAACAGATAGCGGACGCAAAAAACGCGAAAt < 1:586683/250‑1 (MQ=255) gTTATTTTCAGAAAATTTAACGGAACAACAAAAGAAACGGATTGTTCGGTTATTCAAAGACTTTCAATACCCTACCCTGCAAAAAGATCTCATTTCCCTCAATACCTTAAAGAAAGTTGAAAAAGGCGGCGACACCTTACGCATTGAAATCACCATGCCTTTTGCATGGAACACCGCCTTTGCGGACTTAAAAAATGCTTTGACCGCACCGTTAAAACAGATAGCGGACGCAAAAAACGCGAAATGGCAg > 1:591163/1‑250 (MQ=255) 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aTTCAAAGACTTTCAATACCCTACCCTGCAAAAAGATCTCATTTCCCTCAATACCTTAAAGAAAGTTGAAAAAGGCGGCGACACCTTACGCATTGAAATCACCATGCCTTTTGCATGGAACACCGCCTTTGCGGACTTAAAAAATGCTTTGACCGCACCGTTAAAACAGATAGCGGACGCAAAAAACGCGAAATGGCAGCTTAACTACCAAATCGCTACCTTAAAACGCGCCAACAATCACCCGGCGGTaa > 1:754067/1‑251 (MQ=255) cTTTCAATACCCTACCCTGCAAAAAGATCTCATTTCTCTCAATACCTTAAAGAAAGTTGAAAAAGGCGGCGACACCTTACGCATTGAAATCACCATGCCTTTTGCATGGAACACCGCCTTTGCGGACTTAAAAAATGCTTTGACCGCACCGTTAAAACAGATAGCGGACGCAAAAAACGCGAAATGGCAGCTTAACTACCAAATCg < 1:427806/206‑1 (MQ=255) cTTTCAATACCCTACCCTGCAAAAAGATCTCATTTCCCTCAATACCTTAAAGAAAGTTGAAAAAGGCGGCGACACCTTACGCATTGAAATCACCATGCCTTTTGCATGGAACACCGCCTTTGCGGACTTAAAAAATGCTTTGACCGCACCGTTAAAACAGATAGCGGACGCAAAAAACGCGAAATGGCAGCTTAACTACCAAATCGCTACCTTAAAACGCGCCAACAATCACCCGGCGGTAAAAGGCGTga > 1:645984/1‑251 (MQ=255) | AATATTAACCTTAAGAATTCGTGAAAAACAGGGAAAAAATTGGCGCTTATGTTACCTTATTGAGGGTATTTTTTCTAGTTTAATCATGGTTTAGACATTTTTAACTTAACAGATAAAGGCGGGAGTGATTAAATATAGCGAACTAATTTGCTACATTAGAAAGGACGACATTATGGCGACGTTATTTTCAGAAAATTTAACGGAACAACAAAAGAAACGGATTGTTCGGTTATTCAAAGACTTTCAACACCCTACCCTGCAAAAAGATCTCATTTCCCTCAATACCTTAAAGAAAGTTGAAAAAGGCGGCGACACCTTACGCATTGAAATCACCATGCCTTTTGCATGGAACACCGCCTTTGCGGACTTAAAAAATGCTTTGACCGCACCGTTAAAACAGATAGCGGACGCAAAAAACGCGAAATGGCAGCTTAACTACCAAATCGCCACCTTAAAACGCGCCAACAATCACCCGGCGGTAAAAGGCGTGA > 1/1372495‑1372985 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |