| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,364,354 | G→A | V149V (GTG→GTA) | unknown → | tRNA (cytidine(32)/uridine(32)‑2'‑O)‑methyltransferase (EC 2.1.1.200) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,364,354 | 0 | G | A | 100.0% | 208.2 / NA | 74 | V149V (GTG→GTA) | unknown | tRNA (cytidine(32)/uridine(32)‑2'‑O)‑methyltransferase (EC 2.1.1.200) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (36/38); total (36/38) | |||||||||||
GTCGCCGATTGCTCTTTAGTCATCGGTACCAGCGCAAGATTGCGCCATTTGCAGAATTCGCTTATTGAACCGCGTGAGTGCGGCAAAAAAGCCGTTGCTTACGCAACAAACGGGAAAGTCGCCATTGTGTTCGGGCGCGAACGCGTCGGCTTAACTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTGCAATTAATCGCTTATGAAATCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCGTTCTGTTGGGTTCATTCAGAATCAGGGCGTTATGCAAAGGCTAAGACGTTTATACAACCGTGCAGGGATAGAAAAAACAGAATTAAACATTCTGCTTGGTAT > 1/1364115‑1364599 | gTCGCCGATTGCTCTTTAGTCATCGGTACCAGCGCAAGATTGCGCCATTTGCAGAATTCGCTTATTGAACCGCGTGAGTGCGGCAAAAAAGCCGTTGCTTACGCAACAAACGGGAAAGTCGCCATTGTGTTCGGGCGCGAACGCGTCGGCTTAACTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCg < 1:811461/250‑1 (MQ=255)gTCGCCGATTGCTCTTTAGTCATCGGTACCAGCGCAAGATTGCGCCATTTGCAGAATTCGCTTATTGAACCGCGTGAGTGCGGCAAAAAAGCCGTTGCTTACGCAACAAACGGGAAAGTCGCCATTGTGTTCGGGCGCGAACGCGTCGGCTTAACTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCg > 1:376119/1‑250 (MQ=255) ttAGTCATCGGTACCAGCGCAAGATTGCGCCATTTGCAGAATTCGCTTATTGAACCGCGTGAGTGCGGCAAAAAAGCCGTTGCTTACGCAACAAACGGGAAAGTCGCCATTGTGTTCGGGCGCGAACGCGTCGGCTTAACTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAAt < 1:89857/251‑1 (MQ=255) cATCGGTACCAGCGCAAGATTGCGCCATTTGCAGAATTCGCTTATTGAACCGCGTGAGTGCGGCAAAAAAGCCGTTGCTTATGCAACAAACGGGAAAGTCGCCATTGTGTTCGGGCGCGAACGCGTCGGCTTAACTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCat < 1:436400/251‑1 (MQ=255) aTCGGTACCAGCGCAAGATTGCGCCATTTGCAGAATTCGCTTATTGAACCGCGTGAGTGCGGCAAAAAAGCCGTTGCTTACGCAACAAACGGGAAAGTCGCCATTGTGTTCGGGCGCGAACGCGTCGGCTTAACTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCata > 1:19088/1‑251 (MQ=255) gTACCAGCGCAAGATTGCGCCATTTGCAGAATTCGCTTATTGAACCGCGTGAGTGCGGCAAAAAAGCCGTTGCTTACGCAACAAACGGGAAAGTCGCCATTGTGTTCGGGCGCGAACGCGTCGGCTTAACTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTa < 1:558905/221‑1 (MQ=255) gcgcAAGATTGCGCCATTTGCAGAATTCGCTTATTGAACCGCGTGAGTGCGGCAAAAAAGCCGTTGCTTACGCAACAAACGGGAAAGTCGCCATTGTGTTCGGGCGCGAACGCGTCGGCTTAACTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATAttt > 1:284090/1‑244 (MQ=255) aGATTGCGCCATTTGCAGAATTCGCTTATTGAACCGCGTGAGTGCGGCAAAAAAGCCGTTGCTTACGCAACAAACGGGAAAGTCGCCATTGTGTTCGGGCGCGAACGCGTCGGCTTAACTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGAt > 1:753461/1‑251 (MQ=255) aGATTGCGCCATTTGCAGAATTCGCTTATTGAACCGCGTGAGTGCGGCAAAAAAGCCGTTGCTTACGCAACAAACGGGAAAGTCGCCATTGTGTTCGGGCGCGAACGCGTCGGCTTAACTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGAt > 1:521811/1‑251 (MQ=255) ccATTTGCAGAATTCGCTTATTGAACCGCGTGAGTGCGGCAAAAAAGCCGTTGCTTACGCAACAACCGGGAAAGTCGCCATTGTGTTCGGGCGCGAACGCGCCGGCTTAACTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTTACTCAAACGTTTGCATCa > 1:487010/1‑250 (MQ=255) cATTTGCAGAATTCGCTTATTGAACCGCGTGAGTGCGGCAAAAAAGCCGTTGCTTACGCAACAAACGGGAAAGTCGCCATTGTGTTCGGGCGCGAACGCGTCGGCTTAACTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAGCGATTGCATCAcc < 1:236391/251‑1 (MQ=255) aTTCGCTTATTGAACCGCGTGAGTGCGGCAAAAAAGCCGTTGCTTACGCAACAAACGGGAAAGTCGCCATTGTGTTCGGGCGCGAACGCGTCGGCTTAACTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAat > 1:642980/1‑251 (MQ=255) cTTATTGAACCGCGTGAGTGCGGCAAAAAAGCCGTTGCTTACGCAACAAACGGGAAAGTCGCCATTGTGTTCGGGCGCGAACGCGTCGGCTTAACTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCAt < 1:106171/232‑1 (MQ=255) ttATTGAACCGCGTGAGTGCGGCAAAAAAGCCGTTGCTTACGCAACAAACGGGAAAGTCGCCATTGTGTTCGGGCGCGAACGCGTCGGCTTAACTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCg > 1:121071/1‑250 (MQ=255) aTTGAACCGCGTGAGTGCGGCAAAAAAGCCGTTGCTTACGCAACAAACGGGAAAGTCGCCATTGTGTTCGGGCGCGAACGCGTCGGCTTAACTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAat > 1:472653/1‑243 (MQ=255) gcgTGAGTGCGGCAAAAAAGCCGTTGCTTACGCAACAAACGGGAAAGTCGCCATTGTGTTCGGGCGCGAACGCGTCGGCTTAACTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGa > 1:586331/1‑251 (MQ=255) gcgTGAGTGCGGCAAAAAAGCCGTTGCTTACGCAACAAACGGGAAAGTCGCCATTGTGTTCGGGCGCGAACGCGTCGGCTTAACTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGa > 1:209032/1‑251 (MQ=255) ccGTTGCTTACGCAACAAACGGGAAAGTCGCCATTGTGTTCGGGCGCGAACGCGTCGGCTTAACTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATggag < 1:251441/251‑1 (MQ=255) gTTGCTTACGCAACAAACGGGAAAGTCGCCATTGTGTTCGGGCGCGAACGCGTCGGCTTAACTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATggagga > 1:200797/1‑251 (MQ=255) ttACGCAACAAACGGGAAAGTCGCCATTGTGTTCGGGCGCGAACGCGTCGGCTTAACTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAg > 1:701889/1‑251 (MQ=255) aCGCAACAAACGGGAAAGTCGCCATTGTGTTCGGGCGCGAACGCGTCGGCTTAACTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGaa < 1:215774/251‑1 (MQ=255) aaCGGGAAAGTCGCCATTGTGTTCGGGCGCGAACGCGTCGGCTTAACTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAat > 1:862958/1‑244 (MQ=255) tCGCCATTGTGTTCGGGCGCGAACGCGTCGGCTTAACTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAg < 1:256970/244‑1 (MQ=255) cGCCATTGTGTTCGGGCGCGAACGCGTCGGCTTAACTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACgg < 1:235028/251‑1 (MQ=255) tgtTCGGGCGCGAACGCGTCGGCTTAACTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCtt < 1:136432/251‑1 (MQ=255) tgtTCGGGCGCGAACGCGTCGGCTTAACTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCtt < 1:160964/251‑1 (MQ=255) ggCGCGAACGCGTCGGCTTAACTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCg < 1:74811/250‑1 (MQ=255) ggCGCGAACGCGTCGGCTTAACTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCGt > 1:218538/1‑251 (MQ=255) cgAACGCGTCGGCTTAACTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCGTTCTg < 1:777544/251‑1 (MQ=255) tAACTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCAACTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGCATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCGt > 1:375651/1‑233 (MQ=255) aCTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCGTTCTGTTGGGTTCATTCAGaa < 1:59551/251‑1 (MQ=255) cTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCGTTCTGTTGGGTTCATTCAGAAt < 1:664507/251‑1 (MQ=255) cTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCGTTCTGTTGGGTTCATTCAGAAt > 1:78820/1‑251 (MQ=255) tAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCGTTCTGTTGGGTTCATTCAGAATc < 1:226678/251‑1 (MQ=255) gaaTTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATAtt < 1:418005/112‑1 (MQ=255) gaaTTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTc > 1:640755/1‑137 (MQ=255) gaaTTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCGTTCTGTTg < 1:229355/229‑1 (MQ=255) aCTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTTAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAACAGCTTTATCGTTCTGTTGGGTTCATTCAGAATCAGGGCGTTATg > 1:294725/1‑250 (MQ=255) cTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCg < 1:309163/215‑1 (MQ=255) cTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCGTTCTGTTGGGTTCATTCAGAATc > 1:442545/1‑238 (MQ=255) tGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCtt < 1:491390/204‑1 (MQ=255) ccACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACgg > 1:886995/1‑194 (MQ=255) ccACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCGt < 1:482338/208‑1 (MQ=255) ccACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCGTTCTGTTGGGTTCATTCAGAATCAGGGCGTTATGCaa > 1:438363/1‑244 (MQ=255) aCTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTg > 1:35366/1‑98 (MQ=255) aCTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCGTTCTGTTGGGTTCATTCAGAATCAGGGCGTTATGCAAAGGCTAAGa > 1:811479/1‑251 (MQ=255) aCTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCGTTCTGTTGGGTTCATTCAGAATCAGGGCGTTATGCAAAGGCTAAGa > 1:260929/1‑251 (MQ=255) cTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCGTTCTGTTGGGTTCATTCAGAATCAGGGCGTTATGCAAAGGCTAAGAc < 1:48479/251‑1 (MQ=255) cTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCGTTCTGTTGGGTTCATTCAGAATCAGGGCGTTATGCAAAGGCTAAGAc < 1:156778/251‑1 (MQ=255) cTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCGTTCTGTTGGGTTCATTCAGAATCAGGGCGTTATGCAAAGGCTAAGAc < 1:365868/251‑1 (MQ=255) aTCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGc > 1:327481/1‑182 (MQ=255) tCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCGTTCTGTTGGGTTCATTCAGAATc < 1:285355/224‑1 (MQ=255) tCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCGTTCTGTTGGGTTCATTCAGAATCAGGGCGTTATGCAAAGGCTAAGACGtt > 1:843641/1‑251 (MQ=255) aTTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCTCCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACgg < 1:154906/178‑1 (MQ=255) tCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGcc < 1:523546/170‑1 (MQ=255) cGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCGTTc > 1:231814/1‑189 (MQ=255) tAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCGTTCTGTTGGGTTCATTCAGAATCAGGGCGTTATGCAAAGGCTAAGACGTTTATACAACCGTGCAGGGa < 1:151160/251‑1 (MQ=255) aaTCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCAAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACgg < 1:734240/169‑1 (MQ=255) cccGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGagcagc > 1:225347/1‑172 (MQ=255) aTTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCGTTCTGTTGGGTTCATTCAGAATCAGGGCGTTATGCAAAGGCTAAGACGTTTATACAACCGTGCAGGGATAGaaaaa > 1:66758/1‑251 (MQ=255) aCCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCGTTCTGTTGGGTTCATTCAGAATCAGGGCGTTATGCAAAGGCTAAGACGTTTATACAACCGTGCAGGGATAGAAAAAACAGa > 1:409338/1‑251 (MQ=255) cACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCAcc > 1:95617/1‑79 (MQ=255) cACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAatat > 1:263984/1‑137 (MQ=255) cACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTAt < 1:790724/164‑1 (MQ=255) cACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCGTTCTGTTGGGTTCATTCAGAATCAGGGCGTTATGCAAAgg < 1:307772/206‑1 (MQ=255) cACTTAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCGTTCTGTTGGGTTCATTCAGAATCAGGGCGTTATGCAAAGGCTAAGACGTTTATACAACCGTGCAGGGATAGAAAAAACAGAATTa > 1:819068/1‑251 (MQ=255) ttAATCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCGTTCTGTTGGGTTCATTCAGAATCAGGGCGTTATGCAAAGGCTAAGACGTTTATACAACCGTGCAGGGATAGAAAAAACAGAATTAAAc < 1:108604/251‑1 (MQ=255) aaTCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTAcc > 1:35601/1‑109 (MQ=255) aaTCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCGTTCTGTTGGGTTCATTCAGAATCAGGGCGTTATGCAAAGGCTAAGACGTTTATACAAc < 1:580288/219‑1 (MQ=255) aTCTTGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCGTTCTGTTGGGTTCATTCAGAATCAGGGCGTTATGCAAAGGCTAAGACGTTTATAc < 1:361663/215‑1 (MQ=255) tGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCGTTCTGTTGGGTTCATTCAGAATCAggg < 1:493720/183‑1 (MQ=255) tGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCGTTCTGTTGGGTTCATTCAGAATCAGGGCGTTATGc > 1:468674/1‑191 (MQ=255) tGCCATGGCGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCGTTCTGTTGGGTTCATTCAGAATCAGGGCGTTATGCaa < 1:390342/193‑1 (MQ=255) cGGTACAATTAATCGCTTATGAAGTCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCGTTCTGTTGGGTTCATTCAGAATCAGGGCGTTATGCAAAGGCTAAGACGTTTATACAACCGTGCAGGGATAGAAAAAACAGAATTAAACATTCTGCTTGGTAt < 1:887465/250‑1 (MQ=255) | GTCGCCGATTGCTCTTTAGTCATCGGTACCAGCGCAAGATTGCGCCATTTGCAGAATTCGCTTATTGAACCGCGTGAGTGCGGCAAAAAAGCCGTTGCTTACGCAACAAACGGGAAAGTCGCCATTGTGTTCGGGCGCGAACGCGTCGGCTTAACTAATGAAGAATTACTCAAATGCCACTATCATGTGACTATTCCCGCTAATCCCGATTATACCTCACTTAATCTTGCCATGGCGGTGCAATTAATCGCTTATGAAATCAGAATGGCATATTTGACTCAAACGATTGCATCACCTTCCCAAAATATCCGCAATAACGCGAATATTTACCCGCAGATGGAGGAATTAGAATATTTTTTTAGCCATACGGAGCAGCTTTATCGTTCTGTTGGGTTCATTCAGAATCAGGGCGTTATGCAAAGGCTAAGACGTTTATACAACCGTGCAGGGATAGAAAAAACAGAATTAAACATTCTGCTTGGTAT > 1/1364115‑1364599 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |