| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,360,714 | T→C | intergenic (+200/‑79) | unknown → / → unknown | Fe(3+) ions import ATP‑binding protein fbpC (EC 3.6.3.30)/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,360,714 | 0 | T | C | 100.0% | 117.2 / NA | 42 | intergenic (+200/‑79) | unknown/unknown | Fe(3+) ions import ATP‑binding protein fbpC (EC 3.6.3.30)/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (24/18); total (24/18) | |||||||||||
TTTCCGAACAAGGGGTTTTCCTGTTAAAAAATGAATAAAATTAAAAAATAATTGAAATTTTAACCGCACTTTGTATTCAAAAGATTAGGGCTTGTGTGTTTTAATGAGCACACAAGCCTTAAGTGCGGGCACAAAAAACAACGTTTTTTGAACGTTGGCTCTGCCAGCGGCCCCATAGGGGCGAATAAATCACTTTTTGTGATTTATGAGTAATCATTTACGACGTTTTAGAAACTGTCATAGGTAATAAATTACCTATGGTTGGGTATAGGTGTTCCCCTTTGGGGAACCGATAAAATTCAAACTTGAGGACAACATGAGCAAAAAAAGAAAAGTCACGTTAACACTTGCCGCTATCATCGTTGCTATCGGTAGCGGTGCACAAATTTACACCAATCAACAAGTGGAGCAGGTGCTACAAAAATTCCCTTATTCCTTGGATAATCAACTTCGCCTCAATGTAACCG > 1/1360477‑1360943 | tttCCGAACAAGGGGTTTTCCTGTTAAATAATGAATAAAATTAAAAAATAATTGAAATTTTAACCGCACTTTGTATTCAAAAGATTAGGGCTTGTGTGTTTTAATGAGCACACAAGCCTTAAGTGCGGGCACAAAAAACAACGTTTTTTGAACGTTGGCTCTGCCAGCGGCCCCATAGGGGCGAATAAATCACTTTTTGTGATTTATGAGTAATCATTTACGACGTTTTAGAAACTGCCATAGGTAATaaa < 1:762060/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |