| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,354,545 | G→A | A90V (GCC→GTC) | unknown ← | Uridine kinase (EC 2.7.1.48) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,354,545 | 0 | G | A | 100.0% | 237.4 / NA | 83 | A90V (GCC→GTC) | unknown | Uridine kinase (EC 2.7.1.48) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (50/33); total (50/33) | |||||||||||
ATATTGGTCGATCACCGATTGCAGAGAACGCCCTCGCTCTTCCATGTCACGCTGCAAACGACGAATAAAGCAAATATCCAGCGGCGTATCTACGAACACGGAAATATCCGCCAACTGACGCACACGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGGCATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTCTTCGCAGCCTAATTCATTGCACAGTTCTCTATGAACAGTGGACGCAATAGAGCTTTTTCCGGAGGCGGACGCCCCCGCGATGGCGATAATAATAC > 1/1354307‑1354788 | atatTGGTCGATCACCGATTGCAGAGAACGCCCTCGCTCTTCCATGTCACGCTGCAAACGACGAATAAAGCAAATATCCAGCGGCGTATCTACGAACACGGAAATATCCGCCAACTGACGCACATGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGAc > 1:82175/1‑249 (MQ=255)atatTGGTCGATCACCGATTGCAGAGAACGCCCTCGCTCTTCCATGTCACGCTGCAAACGACGAATAAAGCAAATATCCAGCGGCGTATCTACGAACACGGAAATATCCGCCAACTGACGCACACGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGAcc < 1:312181/250‑1 (MQ=255) gagaACGCCCTCGCTCTTCCATGTCACGCTGCAAACGACGAATAAAGCAAATATCCAGCGGCGTATCTACGAACACGGAAATATCCGCCAACTGACGCACACGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATg > 1:501841/1‑251 (MQ=255) aCGCCCTCGCTCTTCCATGTCACGCTGCAAACGACGAATAAAGCAAATATCCAGCGGCGTATCTACGAACACGGAAATATCCGCCAACTGACGCACACGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCa < 1:706178/251‑1 (MQ=255) cGCCCTCGCTCTTCCATGTCACGCTGCAAACGACGAATAAAGCAAATATCCAGCGGCGTATCTACGAACACGGAAATATCCGCCAACTGACGCACACGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCaa > 1:759710/1‑251 (MQ=255) cccTCGCTCTTCCATGTCACGCTGCAAACGACGAATAAAGCAAATATCCAGCGGCGTATCTACGAACACGGAAATATCCGCCAACTGACGCACACGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAAt > 1:788604/1‑251 (MQ=255) cccTCGCTCTTCCATGTCACGCTGCAAACGACGAATAAAGCAAATATCCAGCGGCGTATCTACGAACACGGAAATATCCGCCAACTGACGCACACGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAAt > 1:792665/1‑251 (MQ=255) cTCGCTCTTCCATGTCACGCTGCAAACGACGAATAAAGCAAATATCCAGCGGCGTATCTACGAACACGGAAATATCCGCCAACTGACGCACACGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATcg > 1:694415/1‑251 (MQ=255) tCGCTCTTCCATGTCACGCTGCAAACGACGAATAAAGCAAATATCCAGCGGCGTATCTACGAACACGGAAATATCCGCCAACTGACGCACACGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATcgc < 1:738552/251‑1 (MQ=255) cGCTCTTCCATGTCACGCTGCAAACGACGAATAAAGCAAATATCCAGCGGCGTATCTACGAACACGGAAATATCCGCCAACTGACGCACACGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATcgcg > 1:217572/1‑251 (MQ=255) ctctTCCATGTCACGCTGCAAACGACGAATAAAGCAAATATCCAGCGGCGTATCTACGAACACGGAAATATCCGCCAACTGACGCACACGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGAt > 1:402403/1‑251 (MQ=255) ctTCCATGTCACGCTGCAAACGACGAATAAAGCAAATATCCAGCGGCGTATCTACGAACACGGAAATATCCGCCAACTGACGCACACGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCt < 1:632133/213‑1 (MQ=255) ctTCCATGTCACGCTGCAAACGACGAATAAAGCAAATATCCAGCGGCGTATCTACGAACACGGAAATATCCGCCAACTGACGCACACGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGAttt > 1:179362/1‑223 (MQ=255) ctTCCATGTCACGCTGCAAACGACGAATAAAGCAAATATCCAGCGGCGTATCTACGAACACGGAAATATCCGCCAACTGACGCACACGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATc > 1:129167/1‑250 (MQ=255) ctTCCATGTCACGCTGCAAACGACGAATAAAGCAAATATCCAGCGGCGTATCTACGAACACGGAAATATCCGCCAACTGACGCACACGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATc > 1:81851/1‑250 (MQ=255) tCACGCTGCAAACGACGAATAAAGCAAATATCCAGCGGCGTATCTACGAACACGGAAATATCCGCCAACTGACGCACACGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAAt < 1:208506/250‑1 (MQ=255) tCACGCTGCAAACGACGAATAAAGCAAATATCCAGCGGCGTATCTACGAACACGGAAATATCCGCCAACTGACGCACACGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAAt < 1:266821/250‑1 (MQ=255) tCACGCTGCAAACGACGAATAAAGCAAATATCCAGCGGCGTATCTACGAACACGGAAATATCCGCCAACTGACGCACACGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAAt < 1:647409/250‑1 (MQ=255) tCACGCTGCAAACGACGAATAAAGCAAATATCCAGCGGCGTATCTACGAACACGGAAATATCCGCCAACTGACGCACACGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAAt < 1:1678/250‑1 (MQ=255) tCACGCTGCAAACGACGAATAAAGCAAATATCCAGCGGCGTATCTACGAACACGGAAATATCCGCCAACTGACGCACACGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAAt < 1:17297/250‑1 (MQ=255) gaATAAAGCAAATATCCAGCGGCGTATCTACGAACACGGAAATATCCGCCAACTGACGCACACGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAAt > 1:639888/1‑234 (MQ=255) gCAAATATCCAGCGGCGTATCTACGAACACGGAAATATCCGCCAACTGACGCACACGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCa > 1:850685/1‑251 (MQ=255) gCAAATATCCAGCGGCGTATCTACGAACACGGAAATATCCGCCAACTGACGCACACGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCa > 1:696586/1‑251 (MQ=255) aaaTATCCAGCGGCGTATCTACGAACACGGAAATATCCGCCAACTGACGCACACGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCAcc < 1:522513/251‑1 (MQ=255) atCCAGCGGCGTATCTACGAACACGGAAATATCCGCCAACTGACGCACACGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAAt > 1:348700/1‑221 (MQ=255) atCCAGCGGCGTATCTACGAACACGGAAATATCCGCCAACTGACGCACACGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTgggg > 1:495005/1‑226 (MQ=255) gTATCTACGAACACGGAAATATCCGCCAACTGACGCACACGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCAttt > 1:49526/1‑250 (MQ=255) tCTACGAACACGGAAATATCCGCCAACTGACGCACACGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGa > 1:132091/1‑206 (MQ=255) gAAATATCCGCCAACTGACGCACACGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCaaa > 1:118701/1‑165 (MQ=255) gAAATATCCGCCAACTGACGCACACGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTc > 1:45693/1‑206 (MQ=255) aaaTATCCGCCAACTGACGCACACGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCTTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATc < 1:63481/250‑1 (MQ=255) aCGCACACGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGCACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCt < 1:447726/250‑1 (MQ=255) gTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAAc < 1:340705/237‑1 (MQ=255) ttCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCaataa > 1:826903/1‑251 (MQ=255) ggTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGa > 1:93254/1‑251 (MQ=255) taaCAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGc < 1:887441/242‑1 (MQ=255) aCAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACTCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCg > 1:550662/1‑251 (MQ=255) tCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTc < 1:338787/251‑1 (MQ=255) tCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTc < 1:7734/251‑1 (MQ=255) aaTCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAAc > 1:148976/1‑206 (MQ=255) tCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGATGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATc < 1:632018/193‑1 (MQ=255) cGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTCATTGCACAGt < 1:508609/251‑1 (MQ=255) aTTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTgggg < 1:800429/138‑1 (MQ=255) tttCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTCATTGCACAGTTCTCTAt < 1:724125/251‑1 (MQ=255) tttCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTCATTGCACAGTTCTCTAt < 1:618930/251‑1 (MQ=255) tCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGGCCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTCATTGCACAGTTCTCTATGa < 1:722799/251‑1 (MQ=255) gggTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAAt < 1:820539/123‑1 (MQ=255) gggTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTc < 1:477689/196‑1 (MQ=255) gAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTc > 1:22274/1‑225 (MQ=255) gAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTCATTGCACAGTTCTCTATGAACAg < 1:206802/248‑1 (MQ=255) gggTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTCATTGCACAGTTCTCTAt < 1:661321/237‑1 (MQ=255) gggTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTCATTGCACAGTTCTCTATGAACAGTGGACGCa > 1:538340/1‑251 (MQ=255) tcgtcgGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTCATTGCACAGTTCTCTATGAACAGTGGACGCAATAGAGCt < 1:598523/251‑1 (MQ=255) gtcgGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAAt > 1:385417/1‑119 (MQ=255) gTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGc > 1:828414/1‑176 (MQ=255) gTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTCATTGCACAGTtc > 1:18045/1‑218 (MQ=255) gTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTCATTGCACAGTTCTCTATGAACAGTGGACGCAATAGAGCTTTTTc > 1:868237/1‑250 (MQ=255) gTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTCATTGCACAGTTCTCTATGAACAGTGGACGCAATAGAGCTTTTTc > 1:596491/1‑250 (MQ=255) aGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTc > 1:201803/1‑201 (MQ=255) aGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTCATTGCACAGTTCTCTATGAACAGTGGACGCAATAGAGCTTTTTCCGGAgg > 1:531725/1‑251 (MQ=255) aTGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTCATTGCACAGTTCTCTATGAACAGTGGACGCAATAGAGCTTTTTCCGGAGGCgg > 1:669729/1‑251 (MQ=255) gTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTCATTGCACAGTTCTCTAt > 1:733303/1‑213 (MQ=255) gTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTCATTGCACAGTTCTCTATGAACAGTGGACGCAATAGAGCTTTTTCCGGAGGCGGa > 1:519673/1‑250 (MQ=255) cAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTCATTGcac < 1:98242/200‑1 (MQ=255) cAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTCATTGCACAGTTCTCTATGAACAGTGGACGCAATAGAGCTTTTTCCGGAGGCGGACGcc < 1:630697/251‑1 (MQ=255) aCATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTCATTGcac > 1:453126/1‑198 (MQ=255) aCATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTCATTGCACAGTTCTCTAt > 1:356402/1‑208 (MQ=255) aCATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTCATTGCACAGTTCTCTATGAACAGTGGACGc > 1:521594/1‑221 (MQ=255) aCATAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTCATTGCACAGTTCTCTATGAACAGTGGACGCAATAGAGCTTTTTCCGGAGGCGGACGccc > 1:205215/1‑250 (MQ=255) tAGCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTTATTGCACAGTTCTCTAt > 1:678780/1‑205 (MQ=255) gCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAggg < 1:896811/41‑1 (MQ=255) gCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCGAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTCATTGCACAGTTCTCTATGAACAGTGGACGCAATAGAGCTTTTTCCGGAGGCGGACGCCCCCGCGa > 1:820680/1‑251 (MQ=255) gCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTCATTGCACAGt < 1:797562/196‑1 (MQ=255) gCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTCATTGCACAGTTCTCTATGAAc > 1:868963/1‑207 (MQ=255) gCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTCATTGCACAGTTCTCTATGAACAGTGGACGCAATAGAGCTTTTTCCGGAGGCGGACGCCCCCGCGa > 1:674781/1‑251 (MQ=255) gCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTCATTGCACAGTTCTCTATGAACAGTGGACGCAATAGAGCTTTTTCCGGAGGCGGACGCCCCCGCGa > 1:259538/1‑251 (MQ=255) gCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTCATTGCACAGTTCTCTATGAACAGTGGACGCAATAGAGCTTTTTCCGGAGGCGGACGCCCCCGCGa > 1:468626/1‑251 (MQ=255) gCTATAAACAGGAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTCATTGCACAGTTCTCTATGAACAGTGGACGCAATAGAGCTTTTTCCGGAGGCGGACGCCCCCGCGa > 1:395768/1‑251 (MQ=255) ggAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTCATTGCACAGTTCTCTATGAACAGTGGACGCAATAGAGCTTTTTCCGGAGGCGGACGCCCCCGCGATGGCGataat > 1:436529/1‑251 (MQ=255) gAATATCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTCATTGCACAGTTCTCTAt < 1:612966/192‑1 (MQ=255) atCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTCATTGCACAGTTCTCTATGAAc > 1:738877/1‑192 (MQ=255) atCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTCATTGCACAGTTCTCTATGAACAGTGGACGCAATAGAGCTTTTTCCGGAGGCGGACGCCCCCGCGATGGCGataataata > 1:210661/1‑250 (MQ=255) atCGACGACATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTTTTCGCAGCCTAATTCATTGCACAGTTCTCTATGAACAGTGGACGCAATAGAGCTTTTTCCGGAGGCGGACGCCCCCGCGATGGCGATAATAATAc < 1:493479/251‑1 (MQ=255) | ATATTGGTCGATCACCGATTGCAGAGAACGCCCTCGCTCTTCCATGTCACGCTGCAAACGACGAATAAAGCAAATATCCAGCGGCGTATCTACGAACACGGAAATATCCGCCAACTGACGCACACGTTCATCGGTTAATAACAAAATGCCTTCTAAAATCACGATTCTTTTCGGGGTGAAATGGGTGACGTCGTCGGTACGAGTATGTTCAACATAGCTATAAACAGGAATATCGACGGCATTGCCGACCTTGAGGGATTTCAAATGTTGAATGAGCAAATCGCGATCCATAGAATTGGGGTGGTCATAATTGGTTTTCACCCGCTCTGCCATTTCCAGATGGCTTTGATCTTTGTAATAACTGTCTTCCGCAATAATGCCGATTTCTTCGCAGCCTAATTCATTGCACAGTTCTCTATGAACAGTGGACGCAATAGAGCTTTTTCCGGAGGCGGACGCCCCCGCGATGGCGATAATAATAC > 1/1354307‑1354788 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |