| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 179,577 | G→A | intergenic (+62/+119) | unknown → / ← unknown | L‑asparaginase (EC 3.5.1.1)/L‑serine dehydratase, beta subunit (EC 4.3.1.17) / L‑serine dehydratase, alpha subunit (EC 4.3.1.17) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 179,577 | 0 | G | A | 100.0% | 196.5 / NA | 72 | intergenic (+62/+119) | unknown/unknown | L‑asparaginase (EC 3.5.1.1)/L‑serine dehydratase, beta subunit (EC 4.3.1.17) / L‑serine dehydratase, alpha subunit (EC 4.3.1.17) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (36/36); total (36/36) | |||||||||||
TGGTGCGTTCTTCCCGCGTGCCGACGGGCTACACCACCCGTGATGCGGAAGTGGATGACAGCAGATACGGCTTCGTGACCTCAGGTTCGTTGAACCCGCAAAAAGCGCGCGTGTTGTTGCAATTAGCATTAACCAAAACCAAAGATGTGAAGGAAATTCAGCAATATTTCGATGATTTTTAACGACGTCCCGTTTGAGGTTTTATAACCTACGTTTAAATATAACCCCATACGGTAAGTATGGGGTTATATTTAAAAACACTGTGAAAAATATTCATAAATCACTGAAGTGATTTATTCACCCCTTCGGGGCCGTTGGCATAGCCAACGTTTAAAAAATGGAATTTTTTGTGACCGCACCTTTTACGAGCAAACCACTTTAATCGCTAAGCCGCCTTGTGAGGTTTCGCGGTATTTGGCGTTCATGTCTTTACCGGTTTCGTACATGGTTTCGATCACCTTATCCAGACTGACGCGCGGGCTGGTGGT > 1/179334‑179821 | tggtgCGTTCTTCCCGCGTGCCGACGGGCTACACCACCCGTGATGCGGAAGTGGATGACAGCAGATACGGCTTCGTTACCTCAGGTTCGTTGAACCCGCAAAAAGCGCGCGTGTTGTTGCAATTAGCATTAACCAAAACCAAAGATGTGAAGGAAATTCAGCAATATTTCGATGATTTTTAACGACGTCCCGTTTGAGGTTTTATAACCTACGTTTAAATATAACCCCATACGGTAAGTATGGAGTta < 1:358869/248‑1 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(MQ=255) gTATGGAGTTATATTTAAAAACACTGTGAAAAATATTCATAAATCACTGAAGTGATTTATTCACCCCTTCGGGGCCGTTGGCATAGCCAACGTTTAAAAAATGGAATTTTTTGTGACCGCACCTTTTACGAGCAAACCACTTTAATCGCTAAGCCGCCTTGTGAGGTTTCGCGGTATTTGGCGTTCATGTCTTTACCGGTTTCGTACATGGTTTCGATCACCTTATCCAGACTGACGCGCGGGCTggtggt > 1:730914/1‑251 (MQ=255) gTATGGAGTTATATTTAAAAACACTGTGAAAAATATTCATAAATCACTGAAGTGATTTATTCACCCCTTCGGGGCCGTTGGCATAGCCAACGTTTAAAAAATGGAATTTTTTGTGACCGCACCTTTTACGAGCAAACCACTTTAATCGCTAAGCCGCCTTGTGAGGTTTCGCGGTATTTGGCGTTCATGTCTTTACCGGTTTCGTACATGGTTTCGATCACCTTATCCAGACTGACGCGCGGGCTggtggt > 1:763203/1‑251 (MQ=255) gTATGGAGTTATATTTAAAAACACTGTGAAAAATATTCATAAATCACTGAAGTGATTTATTCACCCCTTCGGGGCCGTTGGCATAGCCAACGTTTAAAAAATGGAATTTTTTGTGACCGCACCTTTTACGAGCAAACCACTTTAATCGCTAAGCCGCCTTGTGAGGTTTCGCGGTATTTGGCGTTCATGTCTTTACCGGTTTCGTACATGGTTTCGATCACCTTATCCAGACTGACGCGCGGGCTggtggt > 1:682669/1‑251 (MQ=255) 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TGGTGCGTTCTTCCCGCGTGCCGACGGGCTACACCACCCGTGATGCGGAAGTGGATGACAGCAGATACGGCTTCGTGACCTCAGGTTCGTTGAACCCGCAAAAAGCGCGCGTGTTGTTGCAATTAGCATTAACCAAAACCAAAGATGTGAAGGAAATTCAGCAATATTTCGATGATTTTTAACGACGTCCCGTTTGAGGTTTTATAACCTACGTTTAAATATAACCCCATACGGTAAGTATGGGGTTATATTTAAAAACACTGTGAAAAATATTCATAAATCACTGAAGTGATTTATTCACCCCTTCGGGGCCGTTGGCATAGCCAACGTTTAAAAAATGGAATTTTTTGTGACCGCACCTTTTACGAGCAAACCACTTTAATCGCTAAGCCGCCTTGTGAGGTTTCGCGGTATTTGGCGTTCATGTCTTTACCGGTTTCGTACATGGTTTCGATCACCTTATCCAGACTGACGCGCGGGCTGGTGGT > 1/179334‑179821 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |