| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,352,370 | G→T | P400Q (CCA→CAA) | unknown ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,352,370 | 0 | G | T | 100.0% | 271.6 / NA | 99 | P400Q (CCA→CAA) | unknown | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (48/51); total (48/51) | |||||||||||
CTGCGCCGTTCCAGTTTTGCTGTCATTAACATAAACGGCAGCGACATCAGGGAAACAATCCAGGCATAAACGGTGATCATCAGCCCTGCTTGCTGCACCGGGGTTTCAAAACTTTGCGCAATGTCGGATAACAAGGCGACGGGTAAGAATTCGGTGGTGTTGAAAATAAACGCGGCAAATGCCAATAACACAACGCGAAAAAATTTCAGGCGTCGCACAATTTTTAAAGAGACCATATTATGGTTTTAATTTACGTCGAAGAAGTTCTTTGATTTTATTGCGAAATGCTTTGTCGATATTCACTTCATATTGCGGCGAATAGCAACTATTAAAGAAATGAATCGGTAGCACAATGTCCGTATATTTTTCATCGGTTGGACGAAGGTTCAGGTCAACATAGCATTGCATGGATTGCAAATTCACCCGACCACGCCCCTCACCTAAAAGTGCGGTGGTTTTCAAGATCATTTTTTC > 1/1352129‑1352602 | cTGCGCCGTTCCAGTTTTGCTGTCATTAACATAAACGGCAGCGACATCAGGGAAACAATCCAGGCATAAACGGTGATCATCAGCCCTGCTTGCTGCACCGGGGTTTCAAAACTTTGCGCAATGTCGGATAACAAGGCGACGGGTAAGAATTCGGTGGTGTTGAAAATAAACGCGGCAAATGCCAATAACACAACGCGAAAAAATTTCAGGCGTCGCACAATTTTTAAAGAGACCATATTATTGTTTTAAtt < 1:408264/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |